More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1130 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1130  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 254 aa  504  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.755121  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3502  alpha/beta hydrolase fold protein  43.4 
 
 		 268 aa  190  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0503333  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4667  alpha/beta hydrolase fold  42.25 
 
 		 260 aa  179  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113193  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13227  lipase lipV  42.64 
 
 		 261 aa  175  6e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1402  alpha/beta hydrolase fold  45.77 
 
 		 279 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1420  alpha/beta hydrolase fold  45.77 
 
 		 279 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1800  alpha/beta hydrolase fold  41.54 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155348 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1456  alpha/beta hydrolase fold  44.62 
 
 		 260 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.648204  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3527  alpha/beta hydrolase fold protein  36.18 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  27.35 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1025  alpha/beta hydrolase fold protein  41.18 
 
 		 301 aa  72  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1673  alpha/beta hydrolase fold protein  29.18 
 
 		 294 aa  72  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  29.84 
 
 		 271 aa  72  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1098  Alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0341  alpha/beta hydrolase fold protein  28.91 
 
 		 248 aa  67  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  29.04 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0043  alpha/beta hydrolase fold protein  35.14 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0261008  normal  0.0287829 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3526  alpha/beta hydrolase fold  24.78 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  27.42 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  27.72 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0079  alpha/beta hydrolase superfamily protein  40.68 
 
 		 291 aa  65.5  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  27.86 
 
 		 268 aa  65.1  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  26.27 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1037  alpha/beta hydrolase fold  26.26 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  23.97 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  24.9 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3243  alpha/beta hydrolase fold protein  35.43 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8386  hydrolase, alpha  29.08 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1790  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.911201  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3436  alpha/beta hydrolase  34.78 
 
 		 256 aa  62  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  26.05 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  28.34 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2022  alpha/beta hydrolase fold protein  39.32 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0500364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  34.51 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0820  alpha/beta hydrolase fold protein  38.26 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0978  alpha/beta hydrolase fold  30.17 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  27.6 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.444129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  33.56 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2024  alpha/beta hydrolase fold  37.61 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  25.7 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  33.13 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  35.29 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2011  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219515 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2119  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.57 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0398174  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5976  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1209  esterase/lipase  22.27 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2101  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1698  magnesium chelatase accessory protein  42.86 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28396  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  37.04 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1684  alpha/beta fold family hydrolase  31.62 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.163104  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1030  alpha/beta hydrolase fold  41.3 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2011  alpha/beta hydrolase fold  41.03 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2186  alpha/beta fold family hydrolase  31.62 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1173  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.95564  decreased coverage  0.000000135804 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2704  alpha/beta fold family hydrolase  31.62 
 
 		 340 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  38.18 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2625  alpha/beta fold family hydrolase  31.62 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738195  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3131  alpha/beta fold family hydrolase  31.62 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1459  alpha/beta fold family hydrolase  31.62 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2138  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1744  alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 		 318 aa  58.9  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1900  alpha/beta fold family hydrolase  31.62 
 
 		 296 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2571  alpha/beta fold family hydrolase  31.62 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  20.83 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5407  Alpha/beta hydrolase  30.77 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.632759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1121  alpha/beta hydrolase fold protein  36.04 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2314  alpha/beta hydrolase fold  31 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.75454  normal  0.0695894 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0871  alpha/beta hydrolase fold protein  34.82 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0918  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.891406  normal  0.241554 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3251  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0874027  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2073  alpha/beta hydrolase fold protein  37.61 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0653  alpha/beta hydrolase fold  39.77 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.748775  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  24.86 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  24.86 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01343  hypothetical protein  26.41 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4415  Alpha/beta hydrolase fold  34.51 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  37 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  37.25 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0638  alpha/beta hydrolase fold  39.77 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3298  hypothetical protein  25.1 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.24994 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1498  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0821  esterase/lipase/thioesterase  30.89 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6541  alpha/beta hydrolase fold protein  38.46 
 
 		 288 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.403554  normal  0.0826923 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  36.61 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  26.24 
 
 		 2762 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0437  alpha/beta hydrolase fold protein  32.43 
 
 		 300 aa  57  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.885291  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3821  alpha/beta hydrolase fold  36.52 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2479  alpha/beta hydrolase fold  30.89 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.261597 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  23.53 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>