More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0871 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_0871  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
290 aa  597  1e-170  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3374  Alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 
313 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  34.24 
 
 
286 aa  139  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  32.43 
 
 
289 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  32.05 
 
 
289 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  30.28 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  34.14 
 
 
318 aa  126  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  32.85 
 
 
303 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  32.85 
 
 
303 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 
303 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 
303 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 
280 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 
280 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 
277 aa  123  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  32.93 
 
 
303 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3522  alpha/beta hydrolase fold  34.88 
 
 
302 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.775525 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  31.12 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  31.12 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1513  alpha/beta hydrolase fold  32.05 
 
 
250 aa  120  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  28.62 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  28.62 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  28.62 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  35.24 
 
 
302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  35.24 
 
 
302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  27.67 
 
 
284 aa  113  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0938  alpha/beta hydrolase fold  34.76 
 
 
320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  33.81 
 
 
320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  34.76 
 
 
302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  26.95 
 
 
306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3556  alpha/beta hydrolase fold protein  34.62 
 
 
330 aa  109  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.108163 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  34.29 
 
 
306 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 
279 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  28.47 
 
 
279 aa  108  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  29.92 
 
 
276 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  28.03 
 
 
277 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  32.86 
 
 
302 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0615  alpha/beta hydrolase fold  32.96 
 
 
268 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  31.76 
 
 
294 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3691  alpha/beta hydrolase fold protein  26.59 
 
 
278 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3430  alpha/beta hydrolase fold  26.16 
 
 
267 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4904  hypothetical protein  26.84 
 
 
267 aa  99  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4654  hypothetical protein  26.42 
 
 
272 aa  99  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4878  hypothetical protein  27.27 
 
 
267 aa  99  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5009  hypothetical protein  27.27 
 
 
267 aa  99  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1347  putative lipase  30.16 
 
 
278 aa  98.6  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4492  lysophospholipase L2  26.84 
 
 
267 aa  98.6  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0371  hypothetical protein  28.02 
 
 
267 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4895  hypothetical protein  26.84 
 
 
267 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4586  lysophospholipase L2  26.18 
 
 
267 aa  97.4  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4510  lysophospholipase L2  26.02 
 
 
277 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.811294  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0248  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 
254 aa  97.8  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0197  acylglycerol lipase  29.89 
 
 
288 aa  97.8  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 
315 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2989  alpha/beta hydrolase fold  30.37 
 
 
303 aa  96.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.960197  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1597  Acylglycerol lipase  27.21 
 
 
288 aa  96.7  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7836  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 
300 aa  96.7  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4869  hypothetical protein  27.59 
 
 
267 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  26.87 
 
 
275 aa  96.3  6e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2671  alpha/beta hydrolase fold protein  29.44 
 
 
270 aa  95.1  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.661252 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3638  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
290 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0994  putative hydrolase  29.15 
 
 
301 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0402  alpha/beta hydrolase  31.2 
 
 
279 aa  94.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  27.56 
 
 
267 aa  94.7  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 
288 aa  93.2  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  26.15 
 
 
277 aa  92.4  7e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3572  Alpha/beta hydrolase fold-1  30.21 
 
 
291 aa  92.4  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3712  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 
290 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  25.77 
 
 
277 aa  90.9  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2772  alpha/beta hydrolase fold protein  27.89 
 
 
263 aa  89.7  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000235341  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  25.77 
 
 
277 aa  90.1  4e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31710  lysophospholipase  30.08 
 
 
274 aa  89.7  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 
281 aa  89  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0033  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 
245 aa  88.2  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0204897  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1409  alpha/beta hydrolase fold protein  27.48 
 
 
278 aa  87.8  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.539385 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4867  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 
328 aa  87.4  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5537  hypothetical protein  26.62 
 
 
585 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3672  Acylglycerol lipase  25.09 
 
 
279 aa  84.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1698  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
559 aa  82  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  hitchhiker  0.0000305694 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00537  lysophospholipase L2  26.19 
 
 
322 aa  82  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4384  lysophospholipase L2  23.43 
 
 
334 aa  81.6  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_6100  predicted protein  25.58 
 
 
253 aa  81.6  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00681545  normal  0.399309 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002122  lysophospholipase L2  28.21 
 
 
335 aa  82  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  26.18 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3478  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.786791  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4120  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.848417  normal  0.810632 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4659  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
590 aa  78.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00300  lysophospholipase  28.21 
 
 
329 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2360  hypothetical protein  24.73 
 
 
586 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.279052  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0525  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 
289 aa  77  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.720757 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3659  hypothetical protein  26.98 
 
 
583 aa  76.6  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.962134  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09348  probable hydrolytic enzyme  34.68 
 
 
331 aa  75.1  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5393  hypothetical protein  29.86 
 
 
316 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700115 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2697  hypothetical protein  25.97 
 
 
586 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598372  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31720  hypothetical protein  25.19 
 
 
586 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.137406  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2041  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2883  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
594 aa  72.8  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.752135  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3674  Acylglycerol lipase  21.69 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1166  alpha/beta hydrolase fold protein  31.62 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1290  hypothetical protein  21.86 
 
 
587 aa  70.5  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.620525  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3003  hypothetical protein  21.86 
 
 
587 aa  70.5  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.5786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>