More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13227 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13227  lipase lipV  100 
 
 
261 aa  514  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4667  alpha/beta hydrolase fold  62.16 
 
 
260 aa  314  8e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113193  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1402  alpha/beta hydrolase fold  66.15 
 
 
279 aa  305  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1420  alpha/beta hydrolase fold  66.15 
 
 
279 aa  305  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302874  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1456  alpha/beta hydrolase fold  66.54 
 
 
260 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.648204  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1800  alpha/beta hydrolase fold  62.75 
 
 
260 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.155348 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3502  alpha/beta hydrolase fold protein  44.15 
 
 
268 aa  184  9e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0503333  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1130  alpha/beta hydrolase fold protein  42.64 
 
 
254 aa  175  6e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.755121  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  30.19 
 
 
267 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  31.32 
 
 
264 aa  77  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  28.52 
 
 
285 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3527  alpha/beta hydrolase fold protein  42.11 
 
 
294 aa  68.9  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  37.14 
 
 
255 aa  68.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  25.57 
 
 
258 aa  68.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  33.64 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0079  alpha/beta hydrolase superfamily protein  36.64 
 
 
291 aa  65.9  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  34.71 
 
 
268 aa  65.9  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3243  alpha/beta hydrolase fold protein  34.63 
 
 
270 aa  65.5  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 
327 aa  65.5  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0043  alpha/beta hydrolase fold protein  38.6 
 
 
299 aa  64.7  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0261008  normal  0.0287829 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  37.62 
 
 
312 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  36.29 
 
 
226 aa  64.7  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1025  alpha/beta hydrolase fold protein  41.51 
 
 
301 aa  63.5  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1037  alpha/beta hydrolase fold  31.65 
 
 
226 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01088  hypothetical esterase/lipase ybfF  23.45 
 
 
230 aa  63.5  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000642463  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  33.14 
 
 
261 aa  63.2  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  39.47 
 
 
456 aa  62.8  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  27.87 
 
 
2762 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  34.82 
 
 
289 aa  62.4  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1790  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
268 aa  62.4  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.911201  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  38.32 
 
 
270 aa  62.4  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2055  alpha/beta hydrolase fold  34.75 
 
 
322 aa  62.4  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000011604 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  41.38 
 
 
3045 aa  62  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  38.1 
 
 
275 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 
340 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11771  Alpha/beta hydrolase fold  27.22 
 
 
299 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3436  alpha/beta hydrolase  36.51 
 
 
256 aa  60.8  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1835  alpha/beta hydrolase fold  36.54 
 
 
268 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0596048 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  37.86 
 
 
275 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10044  hydrolase  29.21 
 
 
298 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  35.92 
 
 
571 aa  60.5  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  37.82 
 
 
321 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3424  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  41.57 
 
 
110 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0549007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7902  alpha/beta hydrolase fold protein  36 
 
 
295 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1750  alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 
290 aa  59.7  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99004  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  39.42 
 
 
350 aa  59.7  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  38.18 
 
 
281 aa  59.7  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  35.19 
 
 
264 aa  59.3  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
340 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
340 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
340 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  38.68 
 
 
322 aa  58.9  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2165  alpha/beta hydrolase fold protein  32.03 
 
 
255 aa  59.3  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  34.02 
 
 
280 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  30.56 
 
 
264 aa  58.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1673  alpha/beta hydrolase fold protein  38.46 
 
 
294 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  37.86 
 
 
294 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4590  alpha/beta hydrolase fold protein  38.14 
 
 
327 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  38.78 
 
 
238 aa  58.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  37.07 
 
 
303 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.283426 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2024  alpha/beta hydrolase fold  41.9 
 
 
329 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 
258 aa  58.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  40.62 
 
 
264 aa  58.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.754545  normal  0.278795 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1764  alpha/beta hydrolase fold  31.33 
 
 
256 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112264  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2175  alpha/beta hydrolase fold  34.85 
 
 
259 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.823265 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
340 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  32.67 
 
 
260 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  33.33 
 
 
265 aa  57.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  28.25 
 
 
297 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1326  alpha/beta hydrolase fold protein  35.07 
 
 
279 aa  57.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5546  alpha/beta hydrolase fold protein  35.93 
 
 
264 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03843  hydrolase  27.53 
 
 
244 aa  57.4  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  37.5 
 
 
341 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3526  alpha/beta hydrolase fold  23.68 
 
 
283 aa  57.4  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09891  Alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
299 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3210  alpha/beta hydrolase fold protein  36.84 
 
 
271 aa  58.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.45774  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  38.33 
 
 
381 aa  57  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2218  hydrolase, alpha/beta fold family  28.1 
 
 
284 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0785  Alpha/beta hydrolase  24.44 
 
 
283 aa  57  0.0000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5586  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
326 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8386  hydrolase, alpha  36.84 
 
 
304 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139718  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0515  alpha/beta hydrolase fold  29.76 
 
 
290 aa  57  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3251  alpha/beta hydrolase fold  38.05 
 
 
292 aa  57  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0874027  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  39 
 
 
314 aa  57  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2954  hydrolase  32.14 
 
 
294 aa  56.6  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000251178  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  34.33 
 
 
260 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0221  putative hydrolase  24.11 
 
 
284 aa  56.6  0.0000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.555704  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1838  alpha/beta hydrolase fold  37.7 
 
 
333 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  37.38 
 
 
351 aa  56.6  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.84065  normal  0.959468 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  38.94 
 
 
278 aa  56.2  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6816  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 
282 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1935  alpha/beta fold family hydrolase  34.59 
 
 
311 aa  56.2  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2137  alpha/beta hydrolase fold protein  36.84 
 
 
363 aa  56.2  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198184  normal  0.0171478 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2661  alpha/beta hydrolase fold protein  33.8 
 
 
282 aa  55.8  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  26.98 
 
 
264 aa  55.8  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2073  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 
278 aa  55.8  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.944371  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 
283 aa  55.8  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  23.6 
 
 
257 aa  55.8  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>