More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2175 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2175  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 259 aa  520  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.823265 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5048  alpha/beta hydrolase fold protein  34.18 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.614525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1733  alpha/beta hydrolase fold protein  30.28 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0079  alpha/beta hydrolase superfamily protein  41.82 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  42.37 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  29.1 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  38.83 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9212  alpha/beta hydrolase fold protein  42.59 
 
 		 283 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5099  haloalkane dehalogenase  34.93 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548735  normal  0.0388419 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3588  alpha/beta hydrolase fold protein  42.06 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  32.46 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 305 aa  58.9  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0774  esterase  38 
 
 		 295 aa  58.5  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.391328  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13227  lipase lipV  34.85 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  33.96 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  36.97 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1703  alpha/beta hydrolase fold  35.59 
 
 		 502 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  34.27 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  28.57 
 
 		 277 aa  57  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06710  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  36.28 
 
 		 296 aa  57  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0043  alpha/beta hydrolase fold protein  38.74 
 
 		 299 aa  57  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0261008  normal  0.0287829 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  30.63 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  37.04 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  31.03 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  37.04 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  37.04 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  37.04 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  37.04 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  36.29 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  34.58 
 
 		 299 aa  55.5  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3643  alpha/beta hydrolase fold  36.15 
 
 		 284 aa  55.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 		 264 aa  54.7  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  25.31 
 
 		 273 aa  54.7  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5667  putative esterase  32 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  34.58 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  36.19 
 
 		 273 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  38.53 
 
 		 387 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2251  3-oxoadipate enol-lactonase  36.21 
 
 		 262 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  36.11 
 
 		 324 aa  53.9  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5719  alpha/beta hydrolase fold  36.79 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  36.11 
 
 		 322 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0777  alpha/beta hydrolase fold protein  35.11 
 
 		 347 aa  54.3  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0925  3-oxoadipate enol-lactonase  36.21 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.195291 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0515  alpha/beta hydrolase fold  32.43 
 
 		 290 aa  54.7  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  36.54 
 
 		 325 aa  53.9  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0918  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 		 255 aa  54.7  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.891406  normal  0.241554 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  38.3 
 
 		 324 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 		 275 aa  53.5  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0479  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 308 aa  53.9  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  33.03 
 
 		 305 aa  53.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  36.51 
 
 		 280 aa  53.9  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  31.39 
 
 		 294 aa  53.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  31.65 
 
 		 2762 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1592  alpha/beta hydrolase fold  35.78 
 
 		 267 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121533  normal  0.0764642 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5340  alpha/beta hydrolase fold  36.79 
 
 		 267 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.24896  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  29.31 
 
 		 265 aa  53.1  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5429  alpha/beta hydrolase fold  36.79 
 
 		 254 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.814737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  30.51 
 
 		 280 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  28.5 
 
 		 275 aa  52.8  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  30.57 
 
 		 270 aa  52.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 		 350 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 		 354 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3435  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 302 aa  52.4  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.898623  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  30.48 
 
 		 288 aa  52  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  36.54 
 
 		 328 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  38.1 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  28.22 
 
 		 332 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  35.58 
 
 		 387 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7902  alpha/beta hydrolase fold protein  32.17 
 
 		 295 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  34.69 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  37.14 
 
 		 352 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  30.84 
 
 		 301 aa  51.6  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3821  alpha/beta hydrolase fold  24.8 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  27.75 
 
 		 275 aa  52  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3987  alpha/beta hydrolase fold  37 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136743  normal  0.0524037 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01136  hydrolase, alpha/beta fold family protein  27.06 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0907  putative hydrolase  21.03 
 
 		 289 aa  50.8  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  34.23 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4415  Alpha/beta hydrolase fold  31.88 
 
 		 295 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  35.96 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1763  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 		 282 aa  51.2  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.079054  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8363  hypothetical protein  36.61 
 
 		 270 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3040  alpha/beta fold family hydrolase  31.16 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7232  hypothetical protein  40.3 
 
 		 224 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.259565 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2284  2-hydroxy-6-oxohepta-24-dienoate hydrolase  27.68 
 
 		 303 aa  50.1  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.29683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  35.58 
 
 		 263 aa  50.4  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4878  alpha/beta hydrolase fold  32.73 
 
 		 281 aa  50.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345435  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  32.45 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6060  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  34.11 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  28.46 
 
 		 293 aa  50.1  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1935  alpha/beta fold family hydrolase  29.27 
 
 		 311 aa  50.4  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  28.46 
 
 		 302 aa  50.1  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1025  alpha/beta hydrolase fold protein  37.11 
 
 		 301 aa  50.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  34.34 
 
 		 275 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.178478 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>