More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5429 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5340  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
267 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.24896  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5429  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
254 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.814737  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5719  alpha/beta hydrolase fold  98.82 
 
 
267 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6060  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  61.29 
 
 
268 aa  301  8.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2047  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 
303 aa  74.7  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.254802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8768  putative hydrolase  40.74 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7956  haloalkane dehalogenase  36.36 
 
 
292 aa  72  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  32.32 
 
 
275 aa  70.1  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  38.76 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 
283 aa  68.9  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  28.15 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  38.76 
 
 
270 aa  67  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5458  alpha/beta hydrolase fold protein  37.8 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306625  normal  0.0166355 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0273  alpha/beta fold family hydrolase  29.52 
 
 
258 aa  65.9  0.0000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000365907  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 
264 aa  65.5  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1808  hypothetical protein  26.49 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  44.55 
 
 
270 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2122  alpha/beta hydrolase fold  33.94 
 
 
249 aa  63.5  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.237751 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 
256 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  43.56 
 
 
270 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  43.56 
 
 
270 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6469  haloalkane dehalogenase  38.6 
 
 
287 aa  63.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805806  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  34.65 
 
 
271 aa  62.8  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 
275 aa  62.8  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  33.98 
 
 
257 aa  62.4  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  33.64 
 
 
268 aa  62.8  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0369  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
262 aa  62.4  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.598497 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  37.07 
 
 
277 aa  62.4  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4401  alpha/beta hydrolase fold  38.14 
 
 
275 aa  62  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1025  alpha/beta hydrolase fold protein  36.8 
 
 
301 aa  61.6  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  34.38 
 
 
281 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1236  alpha/beta fold family hydrolase  32.43 
 
 
239 aa  61.6  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000165889  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  37.11 
 
 
262 aa  61.2  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  28.57 
 
 
295 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6597  haloalkane dehalogenase  33.33 
 
 
296 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000200949 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6522  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
302 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2314  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.75454  normal  0.0695894 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  35.88 
 
 
276 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6756  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
302 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.216165  normal  0.0313623 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 
282 aa  61.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3435  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 
302 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.898623  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0774  esterase  35.94 
 
 
295 aa  60.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.391328  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  30.85 
 
 
286 aa  60.1  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0079  alpha/beta hydrolase superfamily protein  40.74 
 
 
291 aa  60.1  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4415  Alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 
295 aa  59.7  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5099  haloalkane dehalogenase  38.74 
 
 
295 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548735  normal  0.0388419 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  29.84 
 
 
425 aa  59.7  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4611  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 
259 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 
267 aa  59.3  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  40.71 
 
 
258 aa  58.9  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  29.2 
 
 
277 aa  58.9  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  33.11 
 
 
271 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  35.92 
 
 
331 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  35.19 
 
 
431 aa  58.9  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6102  alpha/beta hydrolase fold  37.98 
 
 
270 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0502  alpha/beta hydrolase fold  35.35 
 
 
263 aa  58.9  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 
285 aa  58.9  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4144  alpha/beta hydrolase fold protein  28.28 
 
 
269 aa  58.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09891  Alpha/beta hydrolase fold  30.06 
 
 
299 aa  58.5  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  32.32 
 
 
253 aa  58.5  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  35.11 
 
 
279 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  33.94 
 
 
271 aa  58.5  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  29.09 
 
 
264 aa  58.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 
272 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 
273 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  27.9 
 
 
299 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5256  alpha/beta hydrolase fold  28.15 
 
 
302 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296577  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 
257 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2263  alpha/beta hydrolase fold protein  34.82 
 
 
287 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.7542  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6345  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 
302 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.588074  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  33.03 
 
 
258 aa  57.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  35.85 
 
 
302 aa  57.4  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7423  alpha/beta hydrolase fold protein  33.8 
 
 
294 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4227  alpha/beta hydrolase fold protein  32.35 
 
 
266 aa  56.6  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3881  alpha/beta hydrolase fold protein  34.48 
 
 
300 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.909678  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  36.89 
 
 
331 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1703  alpha/beta hydrolase fold  31.2 
 
 
502 aa  57  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  25.22 
 
 
277 aa  57  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  32.67 
 
 
270 aa  56.6  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5122  alpha/beta hydrolase fold protein  30.58 
 
 
302 aa  56.6  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  35.92 
 
 
286 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6109  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 
314 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 
272 aa  56.2  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 
278 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0565  alpha/beta hydrolase fold protein  25.18 
 
 
270 aa  55.8  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.441314  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  32.74 
 
 
323 aa  55.8  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  31 
 
 
265 aa  55.8  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  31.96 
 
 
300 aa  55.5  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3202  Alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 
274 aa  55.5  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.030051 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 
284 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4921  alpha/beta hydrolase fold  26.18 
 
 
322 aa  55.5  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  33.64 
 
 
260 aa  55.5  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  25.73 
 
 
334 aa  55.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  32.76 
 
 
277 aa  55.5  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  32.67 
 
 
266 aa  55.5  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3907  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
269 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804884  normal  0.943348 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  31.96 
 
 
300 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2315  prolyl aminopeptidase  30.06 
 
 
319 aa  54.7  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000889953  hitchhiker  0.0000338054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0849  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  31.07 
 
 
263 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0261  alpha/beta hydrolase fold protein  33.58 
 
 
281 aa  55.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.812291  normal  0.698005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>