More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5122 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5122  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
302 aa  622  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2370  proline iminopeptidase  28.9 
 
 
296 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2962  proline iminopeptidase  27.01 
 
 
296 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.305011  normal  0.0401306 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2662  proline-specific peptidase  30.15 
 
 
323 aa  90.1  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000838232  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8158  alpha/beta hydrolase fold protein  27.7 
 
 
282 aa  84  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 
283 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1173  proline iminopeptidase, putative  37.9 
 
 
278 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12478  proline iminopeptidase, putative  25.62 
 
 
306 aa  83.2  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0825  alpha/beta hydrolase fold protein  43.1 
 
 
287 aa  83.2  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135627  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1623  alpha/beta hydrolase fold  23.61 
 
 
291 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0689  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 
303 aa  82.4  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.574556  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3126  hydrolase, alpha/beta fold family  24.65 
 
 
301 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.83373  normal  0.0124269 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2247  alpha/beta fold family hydrolase  24.65 
 
 
291 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371226  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2000  proline iminopeptidase  24.65 
 
 
301 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118293  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1849  prolyl aminopeptidase  27.45 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000467937  hitchhiker  0.000191217 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2042  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
291 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2061  alpha/beta fold family hydrolase  24.65 
 
 
301 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2217  alpha/beta fold family hydrolase  24.65 
 
 
303 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.716655  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2001  proline iminopeptidase  24.65 
 
 
301 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000475333  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  28.15 
 
 
302 aa  79.7  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0193  alpha/beta hydrolase fold  35.04 
 
 
305 aa  79.3  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.306421 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2245  hydrolase, alpha/beta fold family  24.31 
 
 
301 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1528899999999994e-27 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2199  hydrolase, alpha/beta fold family  24.31 
 
 
291 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0035  proline-specific peptidase  29.33 
 
 
320 aa  78.6  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0847997  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 
264 aa  79  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  29.52 
 
 
286 aa  77.4  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0592  alpha/beta hydrolase fold  36.75 
 
 
294 aa  76.3  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3362  proline-specific peptidase  25.18 
 
 
346 aa  76.6  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.158182 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6195  proline-specific peptidase  25 
 
 
296 aa  76.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.816289 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3901  proline-specific peptidase  27.14 
 
 
369 aa  75.9  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0490645 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0371  prolyl aminopeptidase  36.36 
 
 
323 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2163  proline-specific peptidase  35.58 
 
 
295 aa  75.1  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6375  proline-specific peptidase  24.67 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.713939 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2329  hydrolase, alpha/beta fold family  23.61 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000968473  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1531  alpha/beta hydrolase fold protein  34.88 
 
 
285 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.895965  normal  0.548298 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10858  proline iminopeptidase pip  24.22 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000563068 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 
272 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0261  proline-specific peptidase  25 
 
 
348 aa  69.7  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1914  proline-specific peptidase  26.46 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.094773 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0858  proline-specific peptidase  33.86 
 
 
303 aa  69.3  0.00000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5028  proline iminopeptidase  34.85 
 
 
323 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 
272 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0437  proline iminopeptidase  34.85 
 
 
323 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4902  proline iminopeptidase  34.85 
 
 
323 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  28.4 
 
 
272 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1876  proline iminopeptidase  34.43 
 
 
312 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756215  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4916  proline iminopeptidase  34.38 
 
 
312 aa  67.8  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2344  proline iminopeptidase  33.33 
 
 
316 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.634485  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2151  proline iminopeptidase  34.43 
 
 
312 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1626  proline iminopeptidase  33.33 
 
 
316 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0241  alpha/beta fold family hydrolase  38.74 
 
 
292 aa  68.2  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.313892  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0576  tricorn interacting factor F1  33.07 
 
 
303 aa  68.2  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2440  proline iminopeptidase  33.33 
 
 
316 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1728  proline iminopeptidase  34.43 
 
 
436 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1984  proline-specific peptidase  35.24 
 
 
339 aa  67  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1173  proline iminopeptidase  34.43 
 
 
429 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0279  proline iminopeptidase  34.43 
 
 
429 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237584  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1940  proline iminopeptidase  32.48 
 
 
317 aa  67  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0373  proline iminopeptidase  34.43 
 
 
312 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0886  proline iminopeptidase  34.43 
 
 
429 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.424986  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4474  proline iminopeptidase  35.25 
 
 
310 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.261766  normal  0.674436 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5078  proline iminopeptidase  34.09 
 
 
323 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4009  proline iminopeptidase  36.44 
 
 
310 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.241684 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5164  proline iminopeptidase  32.61 
 
 
323 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0375  peptidase S33, proline iminopeptidase 1  31.88 
 
 
323 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  25.2 
 
 
290 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0552  prolyl aminopeptidase  32.82 
 
 
323 aa  65.5  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429543  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3526  proline iminopeptidase  36.44 
 
 
310 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103107  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  32.2 
 
 
253 aa  64.7  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1929  prolyl aminopeptidase  34.75 
 
 
310 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2315  prolyl aminopeptidase  31.47 
 
 
319 aa  64.7  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000889953  hitchhiker  0.0000338054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3171  proline iminopeptidase  25.8 
 
 
298 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0052  prolyl aminopeptidase  32.84 
 
 
304 aa  64.7  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.946601  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1648  proline-specific peptidase  32.84 
 
 
303 aa  64.7  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0601  proline iminopeptidase  33.87 
 
 
320 aa  64.3  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0513  proline iminopeptidase  39.05 
 
 
323 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2521  proline-specific peptidase  26.28 
 
 
292 aa  63.9  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0825  alpha/beta hydrolase fold protein  36.22 
 
 
364 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210613  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2084  alpha/beta hydrolase fold protein  28.1 
 
 
275 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446473  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3408  proline iminopeptidase  33.88 
 
 
310 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.872292  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4251  proline iminopeptidase  33.88 
 
 
310 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130879  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4115  proline iminopeptidase  33.88 
 
 
310 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1589  alpha/beta hydrolase fold  26.3 
 
 
297 aa  63.5  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000678244  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4568  alpha/beta hydrolase fold protein  40.43 
 
 
311 aa  63.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.364074 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1582  Alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 
376 aa  63.5  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  31.01 
 
 
289 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  31.01 
 
 
289 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  22.49 
 
 
271 aa  63.2  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03529  proline iminopeptidase  37.86 
 
 
325 aa  62.8  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00239792  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3629  Alpha/beta hydrolase fold  36.29 
 
 
292 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.611576  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5137  alpha/beta hydrolase fold protein  23.94 
 
 
315 aa  62.8  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2193  proline iminopeptidase  31.97 
 
 
414 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  37.04 
 
 
266 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  23.02 
 
 
310 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0502  alpha/beta hydrolase fold  24.72 
 
 
263 aa  62  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1799  Alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 
275 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1603  prolyl aminopeptidase  33.33 
 
 
329 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  25 
 
 
387 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1797  alpha/beta hydrolase fold protein  27.7 
 
 
280 aa  62  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.287372  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0771  proline iminopeptidase  36.61 
 
 
320 aa  62  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.270138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>