More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1236 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1236  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 
239 aa  493  1e-139  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000165889  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2132  hypothetical protein  41.53 
 
 
247 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1067  alpha/beta hydrolase fold protein  34.47 
 
 
239 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  32.42 
 
 
226 aa  122  6e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0378  alpha/beta fold family hydrolase  33.19 
 
 
244 aa  106  3e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0818284  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  33.62 
 
 
270 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  28.82 
 
 
286 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  33.19 
 
 
270 aa  99.4  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  28.82 
 
 
267 aa  98.6  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 
276 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1287  alpha/beta hydrolase fold protein  28.05 
 
 
255 aa  94.7  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00130508  normal  0.0205637 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  30.09 
 
 
280 aa  94.7  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  31.74 
 
 
270 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0882  alpha/beta hydrolase fold  32.66 
 
 
298 aa  93.6  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.663068  normal  0.16136 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6102  alpha/beta hydrolase fold  32.47 
 
 
270 aa  92  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3907  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 
269 aa  91.3  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804884  normal  0.943348 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  31 
 
 
270 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4021  alpha/beta hydrolase fold protein  29.18 
 
 
269 aa  91.3  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.000000197083  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  31 
 
 
270 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  25.43 
 
 
425 aa  90.9  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  30.13 
 
 
279 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  25.22 
 
 
283 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5458  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 
270 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306625  normal  0.0166355 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2090  putative hydrolase  39.34 
 
 
233 aa  87  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2178  hydrolase, putative  39.34 
 
 
233 aa  87.4  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  27.97 
 
 
281 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 
271 aa  86.7  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  24.67 
 
 
283 aa  86.3  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  28.27 
 
 
272 aa  85.9  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0908  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
253 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000766289  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4179  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
271 aa  80.5  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  26.49 
 
 
267 aa  79.3  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  37.39 
 
 
279 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  39.29 
 
 
272 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2461  Alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 
272 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 
275 aa  76.6  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2074  proline iminopeptidase  37.07 
 
 
323 aa  74.7  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3914  alpha/beta hydrolase fold protein  36.19 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.732284  normal  0.454673 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0125  hydrolase  23.14 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.577709  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1825  alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 
243 aa  73.2  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388616  normal  0.284005 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3027  alpha/beta hydrolase fold protein  22.46 
 
 
285 aa  73.2  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0099  alpha/beta fold family hydrolase  24.88 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000675213 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2519  alpha/beta hydrolase fold  36.19 
 
 
243 aa  72  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.54258 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  26.36 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2191  hydrolase  22.75 
 
 
265 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000799459  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2349  prolyl aminopeptidase  31.58 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34102  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2363  alpha/beta hydrolase fold  38.6 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.329927 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1567  chloride peroxidase  36.54 
 
 
274 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1714  alpha/beta hydrolase fold  23.58 
 
 
265 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  24.33 
 
 
271 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  22.36 
 
 
258 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  36.89 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3745  Alpha/beta hydrolase  37.86 
 
 
280 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.173154  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3177  alpha/beta hydrolase fold  35.78 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.862905 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  35.65 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2901  alpha/beta hydrolase fold  35.65 
 
 
272 aa  69.7  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0641701  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  37.25 
 
 
273 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8158  alpha/beta hydrolase fold protein  37.39 
 
 
282 aa  69.7  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5718  alpha/beta hydrolase fold protein  35.92 
 
 
330 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1808  hypothetical protein  26.29 
 
 
219 aa  69.3  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4965  proline iminopeptidase  33.85 
 
 
308 aa  68.9  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328745  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1534  lipolytic enzyme  33.61 
 
 
294 aa  68.9  0.00000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.277395  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  25.68 
 
 
265 aa  68.9  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3450  alpha/beta hydrolase fold  36.89 
 
 
273 aa  68.6  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1149  alpha/beta hydrolase fold  35.9 
 
 
276 aa  68.6  0.00000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.163686 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6302  alpha/beta hydrolase fold  25.69 
 
 
266 aa  68.6  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5597  non-heme haloperoxidase  37.5 
 
 
274 aa  68.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373975  normal  0.235263 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3996  alpha/beta hydrolase fold  37.11 
 
 
277 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3581  Alpha/beta hydrolase  34.71 
 
 
273 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  38.38 
 
 
261 aa  68.2  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2262  proline iminopeptidase  34.65 
 
 
335 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.181325  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 
265 aa  67.8  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  25.48 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  33.93 
 
 
273 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5028  proline iminopeptidase  34.17 
 
 
323 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3584  alpha/beta hydrolase fold protein  36.27 
 
 
274 aa  67.4  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  31.86 
 
 
270 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5078  proline iminopeptidase  34.17 
 
 
323 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4902  proline iminopeptidase  34.17 
 
 
323 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  37.25 
 
 
274 aa  67.4  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  24.42 
 
 
266 aa  67  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2835  proline iminopeptidase  33.33 
 
 
337 aa  67  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0437  proline iminopeptidase  34.17 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5414  alpha/beta hydrolase fold protein  27.52 
 
 
261 aa  66.6  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  24.89 
 
 
284 aa  67  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.466438 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1894  proline iminopeptidase  34.92 
 
 
329 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2581  proline iminopeptidase  33.33 
 
 
328 aa  67  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0630978 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4936  alpha/beta hydrolase fold  35.42 
 
 
273 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000404482 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1113  Chloride peroxidase  36.27 
 
 
324 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0601  proline iminopeptidase  26.59 
 
 
320 aa  66.6  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  26.69 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5079  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  24.58 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0371  prolyl aminopeptidase  34.17 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3969  alpha/beta hydrolase fold  34.51 
 
 
276 aa  66.2  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2315  prolyl aminopeptidase  35.29 
 
 
319 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000889953  hitchhiker  0.0000338054 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3170  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0565  alpha/beta hydrolase fold protein  27.83 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.441314  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5198  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.581838  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36840  proline iminopeptidase  37.9 
 
 
316 aa  66.2  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0362084  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>