More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2263 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2263  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 287 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.7542  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0016  alpha/beta hydrolase fold protein  85.3 
 
 		 288 aa  520  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1698  alpha/beta hydrolase fold  34.3 
 
 		 397 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  26.74 
 
 		 340 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  31.85 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 340 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  25.43 
 
 		 314 aa  75.9  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  25.36 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  32.06 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 		 277 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  25.95 
 
 		 639 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  33.11 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  26.54 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  25.77 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  27.9 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4600  alpha/beta hydrolase fold protein  27.72 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 		 350 aa  69.3  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  27.65 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  25.36 
 
 		 390 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3049  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.652408  normal  0.351837 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  25.86 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  23.83 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  26.59 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  24.52 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  26.87 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  26.92 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  26.87 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  26.87 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  32.21 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  28.78 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  24.22 
 
 		 562 aa  67.4  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  25.29 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  23.79 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  21.94 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1077  alpha/beta hydrolase fold protein  27.01 
 
 		 290 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749091  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  26.98 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  23.42 
 
 		 295 aa  67  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  24.14 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3600  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  24.91 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  24.82 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1559  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 		 284 aa  65.5  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0478161  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  35.04 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  36.67 
 
 		 278 aa  65.5  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  24.06 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1677  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  26.15 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  23.27 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  24.01 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  34.19 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  34.11 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  25 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  30.29 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  34.19 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.61 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  24.83 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  22.1 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2061  alpha/beta hydrolase fold  32.65 
 
 		 368 aa  62.8  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112445  normal  0.60255 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  22.98 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3027  alpha/beta hydrolase fold protein  23.19 
 
 		 285 aa  62.4  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.43 
 
 		 374 aa  62.4  0.000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  23.66 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  34.85 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2854  alpha/beta hydrolase fold protein  33.07 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  26.45 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  24 
 
 		 345 aa  62  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2154  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 		 257 aa  62.4  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016859 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  28.22 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  32.67 
 
 		 321 aa  62  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  25.43 
 
 		 282 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6462  alpha/beta hydrolase fold protein  31.43 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.056485  normal  0.485183 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3232  3-oxoadipate enol-lactonase  26.26 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  37.9 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  28.41 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  23.19 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4144  alpha/beta hydrolase fold protein  25.48 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7174  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  21.09 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0990  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  25.46 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>