More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3435 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3435  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 302 aa  617  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.898623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5256  alpha/beta hydrolase fold  95.36 
 
 		 302 aa  594  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296577  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6615  Alpha/beta hydrolase  78.48 
 
 		 302 aa  488  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6109  alpha/beta hydrolase fold  77.48 
 
 		 314 aa  488  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6345  alpha/beta hydrolase fold  77.48 
 
 		 302 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.588074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6522  alpha/beta hydrolase fold  77.48 
 
 		 302 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6756  alpha/beta hydrolase fold  77.48 
 
 		 302 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.216165  normal  0.0313623 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0492  alpha/beta hydrolase fold  37.63 
 
 		 313 aa  174  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3216  alpha/beta hydrolase fold  34.57 
 
 		 281 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2287  alpha/beta hydrolase fold  32.6 
 
 		 278 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02640  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.58 
 
 		 281 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0973655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0671  alpha/beta hydrolase fold protein  29.68 
 
 		 291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.437446  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4028  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 		 280 aa  112  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 		 340 aa  95.9  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3997  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 338 aa  95.5  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481692  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  29.35 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 		 272 aa  94  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 		 273 aa  92.4  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  26.96 
 
 		 322 aa  91.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  29.47 
 
 		 273 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5079  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 		 277 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3170  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 		 277 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 272 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5198  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 		 277 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.581838  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3239  chloride peroxidase  28.62 
 
 		 273 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.826064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 		 274 aa  89.7  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 272 aa  89  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0387  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 		 269 aa  88.6  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0326  alpha/beta fold family hydrolase  26.57 
 
 		 267 aa  87.4  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.339818  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  27.37 
 
 		 272 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5718  alpha/beta hydrolase fold protein  25.7 
 
 		 330 aa  87  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 		 272 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4227  alpha/beta hydrolase fold protein  27.72 
 
 		 266 aa  85.9  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4148  alpha/beta hydrolase fold protein  28.06 
 
 		 278 aa  85.1  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0764  alpha/beta hydrolase  27.02 
 
 		 277 aa  85.5  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3881  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.909678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3736  alpha/beta hydrolase fold  25.46 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265867  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0879  alpha/beta fold family hydrolase  24.25 
 
 		 267 aa  84.3  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.889021  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5197  alpha/beta hydrolase fold protein  27.92 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4001  alpha/beta hydrolase fold protein  27.94 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  31.29 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  28.28 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2613  alpha/beta hydrolase  28.04 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.101876  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3146  alpha/beta hydrolase fold  28.98 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  28.99 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3458  Alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0256  alpha/beta hydrolase fold protein  27.74 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.022774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3177  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.862905 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  26.41 
 
 		 324 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  27.3 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2901  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0641701  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  25.99 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1286  chloride peroxidase  28.77 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1303  chloride peroxidase  28.77 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199298  normal  0.019602 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  28.39 
 
 		 317 aa  79.3  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  28.07 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3157  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  26.06 
 
 		 324 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  25.19 
 
 		 281 aa  79  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  26.87 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2242  alpha/beta hydrolase fold  24.67 
 
 		 301 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.545637  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1113  Chloride peroxidase  25.89 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3584  alpha/beta hydrolase fold protein  27.46 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  29.04 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 		 266 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2172  Alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0874  alpha/beta hydrolase fold protein  26.09 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3372  alpha/beta hydrolase fold  29.24 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.771296 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.17 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  27.21 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  25.7 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3581  Alpha/beta hydrolase  25.8 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 		 334 aa  77  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  27.57 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  25.64 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0741  alpha/beta fold family hydrolase  23.21 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00132598  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1700  alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5112  non-heme haloperoxidase  28.36 
 
 		 395 aa  76.3  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5684  alpha/beta hydrolase fold  26.76 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4936  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000404482 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6048  alpha/beta hydrolase fold  26.76 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.850826 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0704  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.166516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1046  alpha/beta hydrolase fold protein  27.72 
 
 		 274 aa  75.9  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  26.07 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  25.7 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2363  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 328 aa  75.1  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329927 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1567  chloride peroxidase  28.11 
 
 		 274 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5410  alpha/beta hydrolase fold protein  26.23 
 
 		 322 aa  75.5  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3745  Alpha/beta hydrolase  24.38 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.173154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0603  non-heme chloroperoxidase  28.87 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>