More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5112 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5112  non-heme haloperoxidase  100 
 
 		 395 aa  811    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1660  alpha/beta hydrolase fold  91.37 
 
 		 278 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1276  alpha/beta hydrolase fold  87.77 
 
 		 330 aa  518  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7042  alpha/beta hydrolase fold  87.73 
 
 		 278 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.167796  normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6920  Alpha/beta hydrolase  87.41 
 
 		 278 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1450  alpha/beta hydrolase fold  87.36 
 
 		 278 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6378  alpha/beta hydrolase fold  87.36 
 
 		 278 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6475  alpha/beta hydrolase fold  89.21 
 
 		 278 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5723  alpha/beta hydrolase fold  89.21 
 
 		 278 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4742  alpha/beta hydrolase fold  83.45 
 
 		 278 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2396  alpha/beta hydrolase fold  74.77 
 
 		 338 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2990  alpha/beta hydrolase fold  83.09 
 
 		 278 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5376  alpha/beta hydrolase fold  83.09 
 
 		 278 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4894  alpha/beta hydrolase fold  83.09 
 
 		 278 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3920  alpha/beta hydrolase fold protein  83.03 
 
 		 278 aa  490  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0185  Alpha/beta hydrolase  83.03 
 
 		 280 aa  484  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3910  alpha/beta hydrolase fold  84.12 
 
 		 278 aa  488  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0228163  normal  0.0833507 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1087  alpha/beta hydrolase fold  72.5 
 
 		 342 aa  481  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0532953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3628  alpha/beta hydrolase fold  83.03 
 
 		 278 aa  478  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.226548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0194  Alpha/beta hydrolase  80.51 
 
 		 280 aa  474  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2506  alpha/beta hydrolase fold protein  76.17 
 
 		 278 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.505331  normal  0.76574 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2211  alpha/beta hydrolase fold  74.73 
 
 		 278 aa  450  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2363  alpha/beta hydrolase fold  72.51 
 
 		 328 aa  446  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329927 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3969  alpha/beta hydrolase fold  74.82 
 
 		 276 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4668  non-heme chloroperoxidase  75 
 
 		 276 aa  431  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0299  alpha/beta hydrolase fold  64.91 
 
 		 343 aa  430  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7479  Alpha/beta hydrolase  72.66 
 
 		 276 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0764  alpha/beta hydrolase  71.94 
 
 		 277 aa  425  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5825  alpha/beta hydrolase fold  70.65 
 
 		 276 aa  425  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0224159  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3102  Alpha/beta hydrolase  71.58 
 
 		 276 aa  422  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5684  alpha/beta hydrolase fold  71.94 
 
 		 276 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6048  alpha/beta hydrolase fold  71.94 
 
 		 276 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.850826 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1700  alpha/beta hydrolase fold  71.84 
 
 		 276 aa  422  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148356  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  68.81 
 
 		 322 aa  418  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal  0.0190305 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3995  chloroperoxidase precursor  68.95 
 
 		 276 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1889  non-heme chloroperoxidase  70.86 
 
 		 274 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1812  alpha/beta hydrolase fold  68.71 
 
 		 276 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0465722  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29020  chloroperoxidase precursor  67.87 
 
 		 276 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.995557  hitchhiker  0.000198264 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1844  alpha/beta hydrolase fold  69.06 
 
 		 276 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719774  normal  0.0141832 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2172  Alpha/beta hydrolase fold  68.95 
 
 		 276 aa  410  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2461  Alpha/beta hydrolase fold  70.55 
 
 		 272 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3626  alpha/beta hydrolase fold  68.71 
 
 		 276 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1315  alpha/beta hydrolase fold  69.06 
 
 		 274 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.991982  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4021  alpha/beta hydrolase fold  67.99 
 
 		 276 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.425727  normal  0.727928 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4420  alpha/beta hydrolase fold  67.75 
 
 		 274 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0455  alpha/beta hydrolase fold  70.76 
 
 		 278 aa  405  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.372349  normal  0.120056 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1286  chloride peroxidase  68.71 
 
 		 274 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3584  alpha/beta hydrolase fold protein  69.42 
 
 		 274 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1303  chloride peroxidase  68.71 
 
 		 274 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199298  normal  0.019602 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3146  alpha/beta hydrolase fold  69.06 
 
 		 274 aa  403  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0704  alpha/beta hydrolase fold  66.55 
 
 		 276 aa  399  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.166516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3914  alpha/beta hydrolase fold protein  66.91 
 
 		 273 aa  395  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.732284  normal  0.454673 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1046  alpha/beta hydrolase fold protein  64.39 
 
 		 274 aa  390  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5597  non-heme haloperoxidase  68.95 
 
 		 274 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373975  normal  0.235263 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1567  chloride peroxidase  66.43 
 
 		 274 aa  390  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4179  alpha/beta hydrolase fold  63.9 
 
 		 271 aa  384  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3581  Alpha/beta hydrolase  62.59 
 
 		 273 aa  379  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3745  Alpha/beta hydrolase  64.39 
 
 		 280 aa  377  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.173154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3458  Alpha/beta hydrolase fold  64.75 
 
 		 274 aa  375  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  63.67 
 
 		 273 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  62.32 
 
 		 273 aa  361  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5718  alpha/beta hydrolase fold protein  56.43 
 
 		 330 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  63.31 
 
 		 273 aa  353  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  61.87 
 
 		 273 aa  352  7e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  62.23 
 
 		 273 aa  351  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  55.81 
 
 		 317 aa  351  1e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  60.79 
 
 		 273 aa  350  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  58.54 
 
 		 324 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  60.43 
 
 		 273 aa  349  5e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  59.01 
 
 		 324 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3450  alpha/beta hydrolase fold  59.71 
 
 		 273 aa  342  9e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  58.63 
 
 		 273 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5030  Alpha/beta hydrolase fold  59.71 
 
 		 274 aa  341  2e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.414449 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  57.58 
 
 		 322 aa  340  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5410  alpha/beta hydrolase fold protein  53.09 
 
 		 322 aa  339  5.9999999999999996e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1465  chloride peroxidase  60.28 
 
 		 326 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7030  alpha/beta hydrolase fold  58.82 
 
 		 326 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429028  normal  0.417307 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6363  chloride peroxidase  60.28 
 
 		 326 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.669549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3362  alpha/beta hydrolase fold  57.76 
 
 		 290 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3320  alpha/beta hydrolase fold protein  61.15 
 
 		 273 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3170  alpha/beta hydrolase fold  59.35 
 
 		 277 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5198  alpha/beta hydrolase fold  59.35 
 
 		 277 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.581838  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5079  alpha/beta hydrolase fold  59.35 
 
 		 277 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0603  non-heme chloroperoxidase  61.15 
 
 		 273 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0694  non-heme chloroperoxidase  61.15 
 
 		 273 aa  333  4e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1992  non-heme chloroperoxidase  61.15 
 
 		 273 aa  332  5e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.707909  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  59.06 
 
 		 274 aa  332  5e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  57.19 
 
 		 274 aa  330  3e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3239  chloride peroxidase  57.91 
 
 		 273 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.826064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3997  alpha/beta hydrolase fold  51.43 
 
 		 338 aa  330  3e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  59.49 
 
 		 274 aa  329  5.0000000000000004e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3177  alpha/beta hydrolase fold  57.04 
 
 		 273 aa  329  6e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.862905 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  58.27 
 
 		 273 aa  327  2.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  57.91 
 
 		 277 aa  327  3e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  50.32 
 
 		 340 aa  325  6e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1113  Chloride peroxidase  50.16 
 
 		 324 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6690  alpha/beta hydrolase fold  50.47 
 
 		 328 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  57.45 
 
 		 273 aa  319  6e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4936  alpha/beta hydrolase fold  56.32 
 
 		 273 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000404482 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  52.88 
 
 		 334 aa  305  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>