More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_02640 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_02640  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  100 
 
 
281 aa  550  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0973655  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4028  alpha/beta hydrolase fold  41.85 
 
 
280 aa  179  4.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0626  alpha/beta hydrolase fold protein  41.84 
 
 
284 aa  153  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2287  alpha/beta hydrolase fold  37.83 
 
 
278 aa  152  5e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3216  alpha/beta hydrolase fold  33.7 
 
 
281 aa  147  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13885  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0671  alpha/beta hydrolase fold protein  33.08 
 
 
291 aa  122  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.437446  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6522  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 
302 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6756  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 
302 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.216165  normal  0.0313623 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6345  alpha/beta hydrolase fold  32.84 
 
 
302 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.588074  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3435  alpha/beta hydrolase fold  32.58 
 
 
302 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.898623  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5256  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 
302 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296577  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6109  alpha/beta hydrolase fold  32.1 
 
 
314 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6615  Alpha/beta hydrolase  33.21 
 
 
302 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0492  alpha/beta hydrolase fold  32.81 
 
 
313 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2613  alpha/beta hydrolase  32.14 
 
 
270 aa  96.7  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.101876  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 
271 aa  95.9  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  32.65 
 
 
273 aa  93.6  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  33.47 
 
 
273 aa  93.2  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  32.22 
 
 
272 aa  91.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5079  alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 
277 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3170  alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 
277 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5198  alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 
277 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.581838  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  31.1 
 
 
272 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  32.43 
 
 
274 aa  89.7  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
297 aa  89.7  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  32.63 
 
 
273 aa  89  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  31.5 
 
 
273 aa  88.2  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5718  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 
330 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2901  alpha/beta hydrolase fold  32.62 
 
 
272 aa  88.2  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0641701  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  32.47 
 
 
297 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4227  alpha/beta hydrolase fold protein  30.74 
 
 
266 aa  87.4  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  30.93 
 
 
273 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 
273 aa  86.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  32.54 
 
 
272 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  30.45 
 
 
273 aa  86.3  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 
272 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  30.83 
 
 
273 aa  85.9  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  31.73 
 
 
266 aa  85.9  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 
272 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  30.71 
 
 
272 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3320  alpha/beta hydrolase fold protein  29.76 
 
 
273 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  30.97 
 
 
324 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4368  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 
277 aa  84  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000918416  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 
324 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3458  Alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 
274 aa  83.2  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419988  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  31.23 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0603  non-heme chloroperoxidase  30.71 
 
 
273 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  32.66 
 
 
273 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1113  Chloride peroxidase  30.04 
 
 
324 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0694  non-heme chloroperoxidase  30.71 
 
 
273 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1992  non-heme chloroperoxidase  30.56 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.707909  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  31.76 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.45 
 
 
273 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4896  hydrolase, alpha/beta fold family  26.59 
 
 
269 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3736  alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 
305 aa  79.7  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265867  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  32.46 
 
 
340 aa  79.3  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4915  hydrolase, alpha/beta fold family  27.34 
 
 
269 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5410  alpha/beta hydrolase fold protein  30.52 
 
 
322 aa  79  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
272 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4670  alpha/beta fold family hydrolase  27.13 
 
 
269 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2172  Alpha/beta hydrolase fold  30.29 
 
 
276 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5030  alpha/beta fold family hydrolase  27.13 
 
 
269 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3745  Alpha/beta hydrolase  30.2 
 
 
280 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.173154  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5598  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 
273 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0874  alpha/beta hydrolase fold protein  26.91 
 
 
301 aa  78.2  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  28.82 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4606  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 
269 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4511  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  26.56 
 
 
269 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  28.34 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4897  hydrolase, alpha/beta fold family  26 
 
 
269 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4827  alpha/beta hydrolase fold protein  29.9 
 
 
352 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.692638  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0343  hydrolase, alpha/beta fold family  26 
 
 
269 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1463  alpha/beta hydrolase fold  30.98 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879851  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1465  chloride peroxidase  29.53 
 
 
326 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5814  alpha/beta hydrolase fold  33.65 
 
 
273 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.086599  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 
274 aa  77.4  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6363  chloride peroxidase  29.53 
 
 
326 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.669549  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6365  alpha/beta hydrolase fold  30.98 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0929699  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1315  alpha/beta hydrolase fold  30.86 
 
 
274 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.991982  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4530  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  26.34 
 
 
269 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00926815  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 
279 aa  77  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3450  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  29.75 
 
 
322 aa  76.6  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00616  biotin biosynthesis protein BioH  27.42 
 
 
254 aa  76.6  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3362  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 
290 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351371  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  30.08 
 
 
272 aa  76.3  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1303  chloride peroxidase  30.86 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199298  normal  0.019602 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1286  chloride peroxidase  30.86 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  30.77 
 
 
266 aa  75.5  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7030  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 
326 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429028  normal  0.417307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5197  alpha/beta hydrolase fold protein  30.84 
 
 
275 aa  75.5  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2407  alpha/beta hydrolase fold protein  32.91 
 
 
275 aa  75.5  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4929  alpha/beta fold family hydrolase  26.17 
 
 
269 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  32.39 
 
 
279 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3997  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 
338 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481692  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3177  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.862905 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3150  bromoperoxidase  27.24 
 
 
278 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.908823  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3584  alpha/beta hydrolase fold protein  30.45 
 
 
274 aa  74.7  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1659  alpha/beta hydrolase fold  25.7 
 
 
270 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00584472  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1663  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 
271 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>