More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0626 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0626  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
284 aa  565  1e-160  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02640  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  41.84 
 
 
281 aa  153  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0973655  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3216  alpha/beta hydrolase fold  35.22 
 
 
281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13885  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4028  alpha/beta hydrolase fold  34.77 
 
 
280 aa  118  9e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2287  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 
278 aa  107  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0492  alpha/beta hydrolase fold  31.02 
 
 
313 aa  97.4  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 
324 aa  95.9  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
272 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  29.14 
 
 
272 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 
324 aa  92.8  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
272 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  28.21 
 
 
272 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  31.14 
 
 
297 aa  87.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  29.24 
 
 
273 aa  87  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2901  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
272 aa  86.7  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0641701  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
272 aa  85.5  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  27.9 
 
 
272 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 
271 aa  84  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 
272 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5598  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 
273 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2941  bromoperoxidase  32.44 
 
 
278 aa  84  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2915  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  32.44 
 
 
278 aa  84  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3173  bromoperoxidase  32.44 
 
 
278 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3165  bromoperoxidase  32.44 
 
 
278 aa  84  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0230592  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 
281 aa  83.2  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  30.63 
 
 
340 aa  82.8  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1463  alpha/beta hydrolase fold  30.32 
 
 
273 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879851  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6365  alpha/beta hydrolase fold  30.32 
 
 
273 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0929699  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7032  alpha/beta hydrolase fold  30.69 
 
 
273 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137031  normal  0.207733 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3158  bromoperoxidase  32.44 
 
 
278 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00429075  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  28.57 
 
 
273 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  28.96 
 
 
273 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  30.32 
 
 
273 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 
334 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  27.96 
 
 
273 aa  80.5  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  27.87 
 
 
274 aa  80.1  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0764  alpha/beta hydrolase  27.76 
 
 
277 aa  80.1  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5814  alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 
273 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.086599  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3150  bromoperoxidase  31.68 
 
 
278 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.908823  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3997  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 
338 aa  79  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481692  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5079  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 
277 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3170  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 
277 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5198  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 
277 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.581838  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0671  alpha/beta hydrolase fold protein  28.88 
 
 
291 aa  78.2  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.437446  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2172  Alpha/beta hydrolase fold  31.49 
 
 
276 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2084  alpha/beta hydrolase fold protein  28.77 
 
 
275 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446473  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12958  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  29.1 
 
 
276 aa  78.6  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2407  alpha/beta hydrolase fold protein  28.82 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  29.31 
 
 
272 aa  78.2  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 
273 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  27.39 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4179  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 
271 aa  77  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  28.72 
 
 
273 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0887  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
290 aa  77.4  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0583236  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  29.8 
 
 
278 aa  76.3  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  27.84 
 
 
322 aa  75.5  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3177  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
273 aa  75.5  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.862905 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  28.77 
 
 
274 aa  75.1  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  27.4 
 
 
273 aa  75.5  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3855  alpha/beta hydrolase fold  32.1 
 
 
270 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  29.07 
 
 
274 aa  75.1  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 
278 aa  75.1  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3146  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 
274 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351869  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 
273 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2090  bromoperoxidase  30.53 
 
 
278 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
297 aa  74.7  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4368  alpha/beta hydrolase fold  25.08 
 
 
277 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000918416  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3320  alpha/beta hydrolase fold protein  29.71 
 
 
273 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1276  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 
330 aa  73.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4148  alpha/beta hydrolase fold protein  37.96 
 
 
278 aa  73.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1700  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148356  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  26.87 
 
 
317 aa  72.8  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  26.87 
 
 
277 aa  72.4  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29 
 
 
273 aa  72.4  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5112  non-heme haloperoxidase  28.57 
 
 
395 aa  72.4  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3157  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
273 aa  72.4  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1844  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 
276 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719774  normal  0.0141832 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3458  Alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 
274 aa  71.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419988  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  28.67 
 
 
270 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
267 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5684  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 
276 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4742  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 
278 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29020  chloroperoxidase precursor  32.37 
 
 
276 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.995557  hitchhiker  0.000198264 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6048  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 
276 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.850826 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  29.83 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3995  chloroperoxidase precursor  31.17 
 
 
276 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1113  Chloride peroxidase  26.35 
 
 
324 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1087  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
342 aa  70.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0532953  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3910  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0228163  normal  0.0833507 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5718  alpha/beta hydrolase fold protein  28.78 
 
 
330 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0128  Chloride peroxidase  37.7 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00372982  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6690  alpha/beta hydrolase fold  36.8 
 
 
328 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3362  alpha/beta hydrolase fold  31.32 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351371  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7030  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 
326 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429028  normal  0.417307 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1992  non-heme chloroperoxidase  30.32 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.707909  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3239  chloride peroxidase  30.48 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.826064  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  28.26 
 
 
281 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1465  chloride peroxidase  28.22 
 
 
326 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>