More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_06710 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_06710  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  100 
 
 		 296 aa  591  1e-168  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3629  alpha/beta hydrolase fold  43.43 
 
 		 306 aa  176  6e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030304  hitchhiker  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3387  alpha/beta hydrolase fold  41.38 
 
 		 306 aa  168  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0254  alpha/beta hydrolase fold protein  40.62 
 
 		 348 aa  161  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0541  alpha/beta hydrolase fold protein  40.28 
 
 		 344 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.271487 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04600  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  39.66 
 
 		 330 aa  154  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.374511 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1142  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  37.24 
 
 		 390 aa  152  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.152589  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6555  alpha/beta hydrolase fold protein  39.07 
 
 		 366 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381661  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1497  alpha/beta hydrolase fold protein  36.01 
 
 		 325 aa  146  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  38.18 
 
 		 350 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.38332 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4266  alpha/beta hydrolase fold protein  38.52 
 
 		 364 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0625  alpha/beta hydrolase fold  35.37 
 
 		 423 aa  136  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.537293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  35.65 
 
 		 397 aa  135  8e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6010  alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 		 421 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773155  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0901  alpha/beta hydrolase fold  36.86 
 
 		 360 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0991  alpha/beta hydrolase fold protein  36.8 
 
 		 389 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  hitchhiker  0.00638838 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0560  alpha/beta hydrolase fold protein  32.53 
 
 		 390 aa  123  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4827  alpha/beta hydrolase fold protein  36.59 
 
 		 352 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.692638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4933  alpha/beta hydrolase fold  34.77 
 
 		 362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3856  alpha/beta hydrolase fold  35.74 
 
 		 364 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.775297  normal  0.514851 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0879  alpha/beta hydrolase fold protein  35.54 
 
 		 349 aa  116  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0777  alpha/beta hydrolase fold protein  35.49 
 
 		 347 aa  116  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1712  alpha/beta hydrolase fold protein  34.33 
 
 		 373 aa  116  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1174  alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 		 369 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326598  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1147  alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 		 369 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255082  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1164  alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 		 369 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.428268 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1191  alpha/beta hydrolase fold protein  32.9 
 
 		 400 aa  112  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1485  alpha/beta hydrolase fold  32.99 
 
 		 362 aa  113  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.409347  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0728  alpha/beta hydrolase fold  35.77 
 
 		 336 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000117195  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  35.36 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1699  putative hydrolase  37.24 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5476  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 		 333 aa  106  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294136  normal  0.797092 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4246  alpha/beta hydrolase fold  36.1 
 
 		 364 aa  105  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146629  hitchhiker  0.00549727 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6786  alpha/beta hydrolase fold  40.76 
 
 		 297 aa  102  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0457  alpha/beta hydrolase fold protein  35.27 
 
 		 299 aa  102  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1865  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0853648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1555  alpha/beta hydrolase fold  33.94 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1579  alpha/beta hydrolase fold  33.94 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1525  alpha/beta hydrolase fold  33.94 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0190867  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4502  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 		 353 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.297988  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3656  alpha/beta hydrolase fold protein  33.68 
 
 		 347 aa  88.2  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07460  lysophospholipase  32.76 
 
 		 300 aa  86.7  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13192  non-heme haloperoxidase hpx  31.44 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.305997 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  30.24 
 
 		 264 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  29.43 
 
 		 462 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  30.15 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  31.98 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  29.22 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.37 
 
 		 602 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  28.07 
 
 		 462 aa  69.3  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  30.74 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  30.74 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  30.74 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5072  alpha/beta hydrolase fold protein  30.86 
 
 		 281 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157677 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  24.75 
 
 		 275 aa  68.9  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  28.73 
 
 		 456 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  27.67 
 
 		 273 aa  67  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  46.88 
 
 		 260 aa  67  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  29.93 
 
 		 263 aa  67  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2937  short chain dehydrogenase  47.96 
 
 		 543 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  28.29 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 272 aa  65.5  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  27.73 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 		 352 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  31.7 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  43.69 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  47.31 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.4 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.4 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  27.67 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  28.51 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  24.48 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  23.91 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  45.26 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2251  3-oxoadipate enol-lactonase  38.33 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  25.75 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0925  3-oxoadipate enol-lactonase  38.33 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.195291 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.4 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  23.91 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  30.56 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1735  alpha/beta hydrolase fold protein  29.01 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  28.04 
 
 		 350 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  42.59 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2011  alpha/beta hydrolase fold  36.57 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2172  Alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 		 276 aa  62  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.84 
 
 		 248 aa  62  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 		 262 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0670  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 		 254 aa  62  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  28.3 
 
 		 259 aa  62.4  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  29.66 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  31.05 
 
 		 425 aa  62  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0913  short chain dehydrogenase  33.61 
 
 		 596 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0276  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>