More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4461 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 397 aa  770    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1142  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  44.35 
 
 		 390 aa  252  8.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.152589  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  46.28 
 
 		 350 aa  246  4e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.38332 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4266  alpha/beta hydrolase fold protein  48.89 
 
 		 364 aa  245  9e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0625  alpha/beta hydrolase fold  43.46 
 
 		 423 aa  237  3e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.537293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1191  alpha/beta hydrolase fold protein  41.21 
 
 		 400 aa  233  5e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1174  alpha/beta hydrolase fold  42.21 
 
 		 369 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326598  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1147  alpha/beta hydrolase fold  42.21 
 
 		 369 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255082  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1164  alpha/beta hydrolase fold  42.21 
 
 		 369 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.428268 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4933  alpha/beta hydrolase fold  44.98 
 
 		 362 aa  228  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6010  alpha/beta hydrolase fold  42.77 
 
 		 421 aa  219  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773155  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1485  alpha/beta hydrolase fold  43.37 
 
 		 362 aa  216  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.409347  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6555  alpha/beta hydrolase fold protein  43.23 
 
 		 366 aa  215  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381661  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0560  alpha/beta hydrolase fold protein  40.98 
 
 		 390 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04600  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  43.52 
 
 		 330 aa  211  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.374511 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0901  alpha/beta hydrolase fold  42.22 
 
 		 360 aa  206  6e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0991  alpha/beta hydrolase fold protein  37.6 
 
 		 389 aa  206  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  hitchhiker  0.00638838 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0541  alpha/beta hydrolase fold protein  42.07 
 
 		 344 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.271487 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0879  alpha/beta hydrolase fold protein  39.24 
 
 		 349 aa  187  4e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  44.59 
 
 		 304 aa  186  5e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0728  alpha/beta hydrolase fold  45.31 
 
 		 336 aa  186  6e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000117195  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1712  alpha/beta hydrolase fold protein  35.66 
 
 		 373 aa  178  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4246  alpha/beta hydrolase fold  40.28 
 
 		 364 aa  170  5e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146629  hitchhiker  0.00549727 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3856  alpha/beta hydrolase fold  38.82 
 
 		 364 aa  169  6e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.775297  normal  0.514851 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1497  alpha/beta hydrolase fold protein  39.16 
 
 		 325 aa  167  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0254  alpha/beta hydrolase fold protein  38.85 
 
 		 348 aa  164  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6786  alpha/beta hydrolase fold  48.63 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06710  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  35.65 
 
 		 296 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3629  alpha/beta hydrolase fold  36.04 
 
 		 306 aa  134  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030304  hitchhiker  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3387  alpha/beta hydrolase fold  34.75 
 
 		 306 aa  127  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1699  putative hydrolase  37.22 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3656  alpha/beta hydrolase fold protein  33.02 
 
 		 347 aa  110  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1555  alpha/beta hydrolase fold  31.94 
 
 		 318 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1579  alpha/beta hydrolase fold  31.94 
 
 		 318 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0777  alpha/beta hydrolase fold protein  33.94 
 
 		 347 aa  105  9e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5476  alpha/beta hydrolase fold  31.61 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294136  normal  0.797092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1525  alpha/beta hydrolase fold  31.94 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0190867  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4827  alpha/beta hydrolase fold protein  33.23 
 
 		 352 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.692638  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0457  alpha/beta hydrolase fold protein  33.66 
 
 		 299 aa  92.8  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4502  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 		 353 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.297988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07460  lysophospholipase  33.33 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1865  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0853648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0907  putative hydrolase  29.08 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  29.84 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13192  non-heme haloperoxidase hpx  27.9 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.305997 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3216  alpha/beta hydrolase fold  27.67 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  27.63 
 
 		 265 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  26.42 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  27.72 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  32.18 
 
 		 251 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3626  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  28.62 
 
 		 396 aa  62  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2172  Alpha/beta hydrolase fold  28.94 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1007  3-oxoadipate enol-lactonase  29.53 
 
 		 268 aa  62  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  26.77 
 
 		 264 aa  62  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33830  short chain dehydrogenase  40.54 
 
 		 568 aa  62  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  25.96 
 
 		 328 aa  62  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0919  alpha/beta hydrolase fold  24.75 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.495242  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4021  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.425727  normal  0.727928 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0774  esterase  25.16 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.391328  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4742  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  28.21 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  28.67 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  26.16 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6302  alpha/beta hydrolase fold  38.83 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1812  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0465722  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  28.43 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  26.92 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2427  alpha/beta hydrolase fold protein  29.22 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1797  alpha/beta hydrolase fold protein  29.8 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.287372  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  30.07 
 
 		 260 aa  59.3  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1087  alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0532953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2097  alpha/beta hydrolase fold  23.28 
 
 		 324 aa  59.3  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  25.87 
 
 		 283 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7159  alpha/beta family hydrolase  27.27 
 
 		 308 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  25.26 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3567  3-oxoadipate enol-lactonase  27.48 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0409722 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3210  alpha/beta hydrolase fold protein  26.95 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.45774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  26.48 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1844  alpha/beta hydrolase fold  27.9 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719774  normal  0.0141832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8760  alpha/beta hydrolase fold protein  42.99 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  30.6 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  27.71 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3826  3-oxoadipate enol-lactonase  37.14 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  28.98 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  29.22 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  27.09 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4676  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  22.73 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318593  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  27.21 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  25.67 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  25.21 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  26.52 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  27.21 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  35.04 
 
 		 431 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>