More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0276 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0276  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
292 aa  605  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0185  alpha/beta hydrolase fold  67.02 
 
 
290 aa  403  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2642  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 
296 aa  325  5e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0302  alpha/beta hydrolase fold  51.02 
 
 
307 aa  325  7e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0243  alpha/beta hydrolase fold  50.68 
 
 
307 aa  322  6e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000221777  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1944  proline iminopeptidase, putative  50.68 
 
 
299 aa  318  9e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.967499  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0344  alpha/beta hydrolase fold  50.51 
 
 
308 aa  311  5.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0317  alpha/beta hydrolase fold  48.98 
 
 
308 aa  306  3e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.182129 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0591  proline iminopeptidase, putative  49.13 
 
 
291 aa  301  6.000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2736  alpha/beta hydrolase fold  62.9 
 
 
125 aa  152  5e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3602  Alpha/beta hydrolase fold  27.06 
 
 
306 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.183144 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
282 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  30.37 
 
 
282 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4294  alpha/beta hydrolase fold protein  27.97 
 
 
286 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0774  esterase  28.36 
 
 
295 aa  89.4  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.391328  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0604  alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 
297 aa  89.4  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.791043 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3130  alpha/beta hydrolase fold protein  27.82 
 
 
286 aa  85.5  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2925  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  25.42 
 
 
298 aa  84.3  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.886643  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 
273 aa  83.6  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4122  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 
287 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3091  alpha/beta hydrolase fold protein  25.8 
 
 
305 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2527  esterase-like  25.28 
 
 
280 aa  80.9  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3029  alpha/beta hydrolase fold protein  25.8 
 
 
305 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1450  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
306 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1480  Alpha/beta hydrolase fold  23.51 
 
 
304 aa  75.9  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000123975  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4976  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  23.42 
 
 
304 aa  74.3  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000041043  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  24.12 
 
 
284 aa  72.8  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  25.48 
 
 
387 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  24.36 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  24.74 
 
 
287 aa  69.3  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  26.81 
 
 
381 aa  68.9  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.81 
 
 
265 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
340 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
343 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.38 
 
 
370 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  24.24 
 
 
340 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  24.81 
 
 
268 aa  67  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  23.88 
 
 
295 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
405 aa  66.6  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
330 aa  65.9  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04531  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02920)  26.19 
 
 
510 aa  65.5  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00644571 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 
462 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1166  alpha/beta hydrolase fold protein  26.41 
 
 
333 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3040  alpha/beta fold family hydrolase  34.48 
 
 
258 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 
339 aa  64.7  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1699  putative hydrolase  31.75 
 
 
312 aa  64.7  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
270 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1320  alpha/beta hydrolase fold  23.47 
 
 
345 aa  64.3  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.543574  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  24.81 
 
 
265 aa  64.3  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0273  alpha/beta fold family hydrolase  25.09 
 
 
258 aa  63.9  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000365907  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  24.35 
 
 
262 aa  63.9  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0777  alpha/beta hydrolase fold protein  32 
 
 
347 aa  64.3  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  32.09 
 
 
250 aa  63.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6440  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 
268 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  31.62 
 
 
279 aa  63.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  31.03 
 
 
462 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0177  alpha/beta hydrolase fold protein  23.57 
 
 
329 aa  62.8  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2766  alpha/beta hydrolase fold protein  25.64 
 
 
277 aa  62.4  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  31.25 
 
 
294 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  25.77 
 
 
261 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  26.06 
 
 
425 aa  62.4  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  24.12 
 
 
278 aa  62.4  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  22.76 
 
 
273 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  22.97 
 
 
262 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  24.74 
 
 
270 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  31.48 
 
 
256 aa  62.4  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  30.88 
 
 
279 aa  62  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  29.46 
 
 
265 aa  62  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  22.26 
 
 
371 aa  61.6  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  21.24 
 
 
270 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1132  putative hydrolase  30.91 
 
 
285 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96812  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  25.38 
 
 
261 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06710  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.81 
 
 
296 aa  61.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  24.31 
 
 
263 aa  60.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  25.38 
 
 
261 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4827  alpha/beta hydrolase fold protein  24.73 
 
 
352 aa  60.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.692638  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  26.33 
 
 
261 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  26.33 
 
 
261 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37050  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  24.35 
 
 
285 aa  60.1  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  24.69 
 
 
271 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  26.33 
 
 
261 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  24.08 
 
 
270 aa  60.5  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  24.52 
 
 
310 aa  60.5  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  26.33 
 
 
261 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  26.33 
 
 
261 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  26.33 
 
 
261 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  25.09 
 
 
270 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  25.77 
 
 
261 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  24.14 
 
 
255 aa  59.7  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 
312 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  23.02 
 
 
240 aa  59.7  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  25.77 
 
 
261 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0502  alpha/beta hydrolase fold  22.39 
 
 
263 aa  59.7  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  25.77 
 
 
261 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  23.6 
 
 
387 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0064  alpha/beta hydrolase fold  25.43 
 
 
330 aa  59.7  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2211  putative hydrolase  28.05 
 
 
320 aa  59.3  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  22.03 
 
 
276 aa  59.3  0.00000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  23.43 
 
 
270 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09348  probable hydrolytic enzyme  24.47 
 
 
331 aa  58.9  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>