More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0243 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0243  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 307 aa  635    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000221777  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0302  alpha/beta hydrolase fold  77.12 
 
 		 307 aa  495  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2642  alpha/beta hydrolase fold  74.24 
 
 		 296 aa  476  1e-133  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1944  proline iminopeptidase, putative  72.91 
 
 		 299 aa  464  9.999999999999999e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.967499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0317  alpha/beta hydrolase fold  72.97 
 
 		 308 aa  457  1e-127  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.182129 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0344  alpha/beta hydrolase fold  71.19 
 
 		 308 aa  457  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0591  proline iminopeptidase, putative  68.28 
 
 		 291 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0276  alpha/beta hydrolase fold  50.68 
 
 		 292 aa  330  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0185  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 		 290 aa  296  4e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2736  alpha/beta hydrolase fold  50.41 
 
 		 125 aa  123  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  30.12 
 
 		 282 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  29.73 
 
 		 282 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0604  alpha/beta hydrolase fold  25.08 
 
 		 297 aa  89.7  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.791043 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3602  Alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 		 306 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.183144 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2925  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  26.6 
 
 		 298 aa  88.2  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.886643  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4294  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 		 286 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3130  alpha/beta hydrolase fold protein  26.39 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0774  esterase  26.69 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.391328  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  28.4 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4368  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000918416  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  34.26 
 
 		 462 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4122  alpha/beta hydrolase fold protein  23.94 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  24.46 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1480  Alpha/beta hydrolase fold  20.74 
 
 		 304 aa  65.9  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000123975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 		 273 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 462 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4976  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  22.63 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000041043  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2527  esterase-like  22.1 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  26.24 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0011  alpha/beta hydrolase fold protein  24.9 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  25.44 
 
 		 261 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  25.44 
 
 		 261 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  25.44 
 
 		 261 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04531  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02920)  32.5 
 
 		 510 aa  61.2  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00644571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  33.59 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3029  alpha/beta hydrolase fold protein  20.66 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3091  alpha/beta hydrolase fold protein  20.66 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  31.93 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  31.67 
 
 		 396 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1154  hydrolase, alpha/beta fold family  33.64 
 
 		 259 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1450  alpha/beta hydrolase fold protein  21.07 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1124  putative rutD protein  26.71 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 		 275 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  27.88 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2586  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0660312 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01012  predicted hydrolase  26.71 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2633  alpha/beta hydrolase  26.71 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.96339  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37110  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.65 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01019  hypothetical protein  26.71 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  24.04 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3049  alpha/beta hydrolase fold  32.41 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.652408  normal  0.351837 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2364  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  22.59 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  35.87 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10564  peroxidase bpoC (non-haem peroxidase)  32.23 
 
 		 262 aa  57  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0807819 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  30.77 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  25.6 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1699  putative hydrolase  30.83 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  23.48 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  23.69 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  31.93 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  35.87 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0387  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  30.47 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  23.69 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1246  putative rutD protein  26.03 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0996  Alpha/beta hydrolase fold  32.69 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  28.93 
 
 		 292 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4001  alpha/beta hydrolase fold protein  22.38 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0309  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2407  alpha/beta hydrolase fold protein  21.89 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12958  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  30.97 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1127  putative rutD protein  26.03 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 		 278 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0626  alpha/beta hydrolase fold protein  35.83 
 
 		 284 aa  55.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 		 272 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3040  alpha/beta fold family hydrolase  35.29 
 
 		 258 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 		 276 aa  55.5  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  24.48 
 
 		 405 aa  55.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0064  alpha/beta hydrolase fold  33.9 
 
 		 330 aa  55.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  25.68 
 
 		 334 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  25.8 
 
 		 295 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  33.68 
 
 		 266 aa  54.7  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 		 294 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  29.75 
 
 		 282 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1166  alpha/beta hydrolase fold protein  23.61 
 
 		 333 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  25 
 
 		 321 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1879  alpha/beta hydrolase fold  31.86 
 
 		 270 aa  55.1  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0307  alpha/beta hydrolase  25.19 
 
 		 322 aa  54.3  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  30 
 
 		 275 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  29.91 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.158146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>