More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2642 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2642  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 296 aa  619  1e-176  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0302  alpha/beta hydrolase fold  74.15 
 
 		 307 aa  474  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1944  proline iminopeptidase, putative  71.43 
 
 		 299 aa  455  1e-127  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.967499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0243  alpha/beta hydrolase fold  74.24 
 
 		 307 aa  456  1e-127  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000221777  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0344  alpha/beta hydrolase fold  70.17 
 
 		 308 aa  457  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0317  alpha/beta hydrolase fold  72.39 
 
 		 308 aa  456  1e-127  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.182129 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0591  proline iminopeptidase, putative  73.45 
 
 		 291 aa  441  1e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0276  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 		 292 aa  325  5e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0185  alpha/beta hydrolase fold  51.03 
 
 		 290 aa  311  7.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2736  alpha/beta hydrolase fold  52.03 
 
 		 125 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 		 282 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  27.51 
 
 		 282 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4294  alpha/beta hydrolase fold protein  23.31 
 
 		 286 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3130  alpha/beta hydrolase fold protein  25.71 
 
 		 286 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2925  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  25.16 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.886643  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3602  Alpha/beta hydrolase fold  24.17 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.183144 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0604  alpha/beta hydrolase fold  23.71 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.791043 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4122  alpha/beta hydrolase fold protein  23.22 
 
 		 287 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  33.9 
 
 		 462 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0774  esterase  24.54 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.391328  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  34.35 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1480  Alpha/beta hydrolase fold  20.79 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000123975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  35.51 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  31.36 
 
 		 462 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 276 aa  68.9  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  25.19 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4976  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  21.15 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000041043  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4368  alpha/beta hydrolase fold  23.23 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000918416  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2527  esterase-like  24.51 
 
 		 280 aa  67  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37110  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.05 
 
 		 268 aa  67  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  28.19 
 
 		 456 aa  66.2  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6126  3-oxoadipate enol-lactonase  24.82 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  33.03 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  31.25 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  24.72 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  31.78 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0611  alpha/beta hydrolase fold  24.74 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  25.84 
 
 		 381 aa  62.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  25.57 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1450  alpha/beta hydrolase fold protein  23.31 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  31.25 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4021  alpha/beta hydrolase fold  25.65 
 
 		 276 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.425727  normal  0.727928 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  26.07 
 
 		 321 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09348  probable hydrolytic enzyme  25.7 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 278 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  36.07 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3040  alpha/beta fold family hydrolase  32.65 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5225  alpha/beta hydrolase fold  36.89 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1589  alpha/beta hydrolase fold  24.22 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000678244  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  22.15 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1127  putative rutD protein  33.33 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3020  alpha/beta hydrolase fold  36.89 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  30.33 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  24.64 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4694  alpha/beta hydrolase fold  36.89 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5346  alpha/beta hydrolase fold  36.89 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00669533  normal  0.437988 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2791  alpha/beta hydrolase fold  23.83 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  29.31 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  30.33 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3383  alpha/beta hydrolase fold  36.89 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0304  Alpha/beta hydrolase  36.89 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  23.91 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1246  putative rutD protein  32.46 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  30.25 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  23.9 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4924  alpha/beta hydrolase fold  35.92 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3626  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2116  putative rutD protein  32.35 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  23.36 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04531  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02920)  29.01 
 
 		 510 aa  59.7  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00644571 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0626  alpha/beta hydrolase fold protein  25.44 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1844  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719774  normal  0.0141832 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10564  peroxidase bpoC (non-haem peroxidase)  35.25 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0807819 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1522  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.401637 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  31.3 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  28.91 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1812  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0465722  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  32.69 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0777  alpha/beta hydrolase fold protein  31.03 
 
 		 347 aa  58.9  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01012  predicted hydrolase  32.35 
 
 		 266 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2633  alpha/beta hydrolase  32.35 
 
 		 266 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.96339  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  28.25 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1124  putative rutD protein  32.35 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1699  putative hydrolase  22.81 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 260 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  30.33 
 
 		 277 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  24.05 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0974  alpha/beta hydrolase fold  34.68 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3091  alpha/beta hydrolase fold protein  26.77 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 		 277 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01019  hypothetical protein  32.35 
 
 		 266 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>