More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2736 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2736  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0185  alpha/beta hydrolase fold  96.69 
 
 		 290 aa  245  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0276  alpha/beta hydrolase fold  62.9 
 
 		 292 aa  166  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2642  alpha/beta hydrolase fold  52.03 
 
 		 296 aa  142  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0243  alpha/beta hydrolase fold  50.41 
 
 		 307 aa  133  6.0000000000000005e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000221777  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1944  proline iminopeptidase, putative  52.85 
 
 		 299 aa  133  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.967499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0317  alpha/beta hydrolase fold  52.8 
 
 		 308 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.182129 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0302  alpha/beta hydrolase fold  50.41 
 
 		 307 aa  130  7.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0344  alpha/beta hydrolase fold  50.81 
 
 		 308 aa  127  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0591  proline iminopeptidase, putative  49.59 
 
 		 291 aa  124  6e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  38.3 
 
 		 273 aa  73.6  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0774  esterase  37.86 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.391328  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3602  Alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 		 306 aa  67  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.183144 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  31.09 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  37.11 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  32.26 
 
 		 282 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  32.26 
 
 		 282 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  34.02 
 
 		 278 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3040  alpha/beta fold family hydrolase  34.74 
 
 		 258 aa  60.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 		 275 aa  60.5  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  32.5 
 
 		 265 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0177  alpha/beta hydrolase fold protein  33.88 
 
 		 329 aa  59.7  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4122  alpha/beta hydrolase fold protein  35.42 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1763  alpha/beta hydrolase fold  36.11 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.079054  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0011  alpha/beta hydrolase fold protein  34.04 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04531  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02920)  27.34 
 
 		 510 aa  58.5  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00644571 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  29.66 
 
 		 274 aa  58.2  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  32.99 
 
 		 256 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  32.17 
 
 		 340 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  33.05 
 
 		 263 aa  58.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 		 343 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  32.71 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 		 340 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  32.79 
 
 		 302 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 		 300 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  31.58 
 
 		 279 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  35.59 
 
 		 272 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  27.35 
 
 		 294 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  32.99 
 
 		 256 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  35.51 
 
 		 272 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  32.99 
 
 		 256 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  31.53 
 
 		 330 aa  57.4  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2791  alpha/beta hydrolase fold  30.97 
 
 		 316 aa  57  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1450  alpha/beta hydrolase fold protein  31.36 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  34.58 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52615  predicted protein  30.16 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0440889  normal  0.692936 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  34.26 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  34.58 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  28.81 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2714  alpha/beta hydrolase fold protein  33.9 
 
 		 284 aa  55.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216364  normal  0.0171077 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  31.68 
 
 		 456 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  33.61 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4368  alpha/beta hydrolase fold  28.95 
 
 		 277 aa  55.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000918416  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3626  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 276 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1132  putative hydrolase  33.7 
 
 		 285 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1320  alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 		 345 aa  55.1  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.543574  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  32.17 
 
 		 334 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  34.65 
 
 		 310 aa  55.1  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2901  alpha/beta hydrolase fold  34.78 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0641701  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2925  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  27.86 
 
 		 298 aa  54.7  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.886643  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  25.42 
 
 		 335 aa  54.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  32.41 
 
 		 284 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1812  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 		 276 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0465722  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  35 
 
 		 255 aa  55.1  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3391  alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 		 336 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445153  normal  0.48468 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  29.13 
 
 		 300 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0604  alpha/beta hydrolase fold  30.89 
 
 		 297 aa  54.3  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.791043 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  31.18 
 
 		 265 aa  54.7  0.0000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5527  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 		 307 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.563792  normal  0.509486 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4112  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 277 aa  53.9  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000359232  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4294  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 286 aa  53.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 279 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1246  putative rutD protein  27.72 
 
 		 266 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 268 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  34.26 
 
 		 272 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 		 300 aa  53.9  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  28.35 
 
 		 300 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  31.78 
 
 		 387 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  31.48 
 
 		 284 aa  53.5  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2586  alpha/beta hydrolase fold  26.73 
 
 		 266 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0660312 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3458  Alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 		 274 aa  52.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 276 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  30.56 
 
 		 462 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1124  putative rutD protein  26.73 
 
 		 266 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1127  putative rutD protein  26.73 
 
 		 266 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2404  alpha/beta hydrolase fold  32.41 
 
 		 301 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367269 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2116  putative rutD protein  26.73 
 
 		 270 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3365  alpha/beta hydrolase fold  30.95 
 
 		 265 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.6363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  33 
 
 		 381 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.539909 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01012  predicted hydrolase  26.73 
 
 		 266 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  28.8 
 
 		 253 aa  52.4  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  29.63 
 
 		 462 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  29.47 
 
 		 277 aa  52.8  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  32.5 
 
 		 264 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01019  hypothetical protein  26.73 
 
 		 266 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  35.64 
 
 		 260 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  27.5 
 
 		 267 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5476  alpha/beta hydrolase fold  33.65 
 
 		 333 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294136  normal  0.797092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>