More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3387 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3387  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 306 aa  599  1e-170  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3629  alpha/beta hydrolase fold  84.64 
 
 		 306 aa  510  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030304  hitchhiker  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0541  alpha/beta hydrolase fold protein  40.07 
 
 		 344 aa  182  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.271487 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0254  alpha/beta hydrolase fold protein  39.26 
 
 		 348 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06710  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  41.38 
 
 		 296 aa  168  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1142  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  35.17 
 
 		 390 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.152589  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1174  alpha/beta hydrolase fold  35.52 
 
 		 369 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326598  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1147  alpha/beta hydrolase fold  35.52 
 
 		 369 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255082  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1164  alpha/beta hydrolase fold  35.52 
 
 		 369 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.428268 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  36.86 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.38332 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1497  alpha/beta hydrolase fold protein  36.72 
 
 		 325 aa  153  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0560  alpha/beta hydrolase fold protein  34.06 
 
 		 390 aa  152  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1485  alpha/beta hydrolase fold  33.44 
 
 		 362 aa  152  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.409347  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0625  alpha/beta hydrolase fold  36.59 
 
 		 423 aa  150  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.537293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0991  alpha/beta hydrolase fold protein  35.93 
 
 		 389 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  hitchhiker  0.00638838 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4933  alpha/beta hydrolase fold  33.67 
 
 		 362 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0728  alpha/beta hydrolase fold  36.79 
 
 		 336 aa  145  9e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000117195  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6555  alpha/beta hydrolase fold protein  34.74 
 
 		 366 aa  139  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381661  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4266  alpha/beta hydrolase fold protein  36.3 
 
 		 364 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1191  alpha/beta hydrolase fold protein  32.9 
 
 		 400 aa  136  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0901  alpha/beta hydrolase fold  33.44 
 
 		 360 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6010  alpha/beta hydrolase fold  34.87 
 
 		 421 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773155  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04600  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  36.7 
 
 		 330 aa  133  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.374511 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  35.83 
 
 		 304 aa  132  7.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0777  alpha/beta hydrolase fold protein  34.53 
 
 		 347 aa  129  9.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  34.75 
 
 		 397 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1712  alpha/beta hydrolase fold protein  32.98 
 
 		 373 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4827  alpha/beta hydrolase fold protein  34.75 
 
 		 352 aa  122  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.692638  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0879  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 349 aa  118  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6786  alpha/beta hydrolase fold  47.1 
 
 		 297 aa  115  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3856  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 		 364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.775297  normal  0.514851 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07460  lysophospholipase  36.39 
 
 		 300 aa  109  5e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1699  putative hydrolase  35.43 
 
 		 312 aa  109  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4246  alpha/beta hydrolase fold  32.51 
 
 		 364 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146629  hitchhiker  0.00549727 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1555  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 		 318 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1579  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 		 318 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1525  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 		 318 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0190867  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1865  alpha/beta hydrolase fold  35.03 
 
 		 325 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0853648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4502  alpha/beta hydrolase fold  34.02 
 
 		 353 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.297988  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3656  alpha/beta hydrolase fold protein  33.77 
 
 		 347 aa  99  8e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5476  alpha/beta hydrolase fold  30.27 
 
 		 333 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294136  normal  0.797092 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 		 266 aa  91.3  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0457  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 299 aa  90.1  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13192  non-heme haloperoxidase hpx  31.49 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.305997 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  32.09 
 
 		 265 aa  86.3  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  27.72 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5072  alpha/beta hydrolase fold protein  28.25 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157677 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  29.66 
 
 		 265 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  31.27 
 
 		 263 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  30.63 
 
 		 425 aa  77.4  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  26.39 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  26.52 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  29.3 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.12 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  29.62 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3719  alpha/beta hydrolase fold  29.07 
 
 		 260 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  hitchhiker  0.00169195 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 		 265 aa  75.5  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  30.77 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  29.04 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1330  alpha/beta hydrolase fold  29.76 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.515623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  29.01 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1897  alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.595115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0934  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.570173  hitchhiker  0.00160688 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  21.8 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  26.71 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  30.03 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  30.18 
 
 		 260 aa  72.4  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  22.78 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  27.94 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4236  alpha/beta hydrolase fold protein  29.86 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  28.78 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  30.57 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2379  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.173076  normal  0.904893 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  41.35 
 
 		 286 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2250  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase transmembrane protein  31.58 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0146051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  29.87 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  30 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  31.08 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  31.08 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  31.21 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  31.08 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 		 317 aa  67  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  26.92 
 
 		 282 aa  67  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 		 268 aa  67  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2061  alpha/beta hydrolase fold  31.29 
 
 		 368 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112445  normal  0.60255 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02640  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  38.28 
 
 		 281 aa  67  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0973655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1990  alpha/beta hydrolase fold protein  26.62 
 
 		 308 aa  67  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000207277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>