More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3466 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 304 aa  590  1e-167  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0625  alpha/beta hydrolase fold  42.03 
 
 		 423 aa  209  4e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.537293  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  42.23 
 
 		 350 aa  206  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.38332 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1142  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  42.47 
 
 		 390 aa  206  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.152589  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4266  alpha/beta hydrolase fold protein  45.57 
 
 		 364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  44.59 
 
 		 397 aa  196  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0541  alpha/beta hydrolase fold protein  43.2 
 
 		 344 aa  190  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.271487 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0901  alpha/beta hydrolase fold  40.32 
 
 		 360 aa  191  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6010  alpha/beta hydrolase fold  39.48 
 
 		 421 aa  183  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773155  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1174  alpha/beta hydrolase fold  37.97 
 
 		 369 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326598  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1147  alpha/beta hydrolase fold  37.97 
 
 		 369 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255082  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0991  alpha/beta hydrolase fold protein  37.84 
 
 		 389 aa  183  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  hitchhiker  0.00638838 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1164  alpha/beta hydrolase fold  37.97 
 
 		 369 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.428268 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4933  alpha/beta hydrolase fold  38 
 
 		 362 aa  181  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0560  alpha/beta hydrolase fold protein  39.14 
 
 		 390 aa  178  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1712  alpha/beta hydrolase fold protein  38.8 
 
 		 373 aa  175  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1485  alpha/beta hydrolase fold  36.7 
 
 		 362 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.409347  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0728  alpha/beta hydrolase fold  44.41 
 
 		 336 aa  173  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000117195  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04600  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  41.33 
 
 		 330 aa  171  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.374511 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1191  alpha/beta hydrolase fold protein  36.1 
 
 		 400 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1497  alpha/beta hydrolase fold protein  39.24 
 
 		 325 aa  162  9e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0254  alpha/beta hydrolase fold protein  38.24 
 
 		 348 aa  161  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3629  alpha/beta hydrolase fold  39.74 
 
 		 306 aa  161  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030304  hitchhiker  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3856  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 		 364 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.775297  normal  0.514851 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0879  alpha/beta hydrolase fold protein  37 
 
 		 349 aa  149  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4246  alpha/beta hydrolase fold  37.72 
 
 		 364 aa  149  7e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146629  hitchhiker  0.00549727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6555  alpha/beta hydrolase fold protein  39.14 
 
 		 366 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381661  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3387  alpha/beta hydrolase fold  37.54 
 
 		 306 aa  139  7e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6786  alpha/beta hydrolase fold  43.5 
 
 		 297 aa  125  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1525  alpha/beta hydrolase fold  35.28 
 
 		 318 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0190867  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1555  alpha/beta hydrolase fold  34.95 
 
 		 318 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1579  alpha/beta hydrolase fold  34.95 
 
 		 318 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06710  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  36.46 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1699  putative hydrolase  37.24 
 
 		 312 aa  112  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0777  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 347 aa  103  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4502  alpha/beta hydrolase fold  32.39 
 
 		 353 aa  102  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.297988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1865  alpha/beta hydrolase fold  34.24 
 
 		 325 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0853648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5476  alpha/beta hydrolase fold  31.79 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294136  normal  0.797092 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0457  alpha/beta hydrolase fold protein  32.62 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4827  alpha/beta hydrolase fold protein  31.72 
 
 		 352 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.692638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13192  non-heme haloperoxidase hpx  32.44 
 
 		 299 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.305997 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  30.42 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  27.27 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2455  3-oxoadipate enol-lactonase  28.73 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.2187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  31.8 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2062  3-oxoadipate enol-lactonase  28.36 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  28.08 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  27.15 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  30.82 
 
 		 350 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  29.59 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07460  lysophospholipase  30.91 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  29.97 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  28.92 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2250  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase transmembrane protein  29.45 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0146051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  26.2 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  29.92 
 
 		 425 aa  68.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  26.32 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  30.24 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.09 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2061  alpha/beta hydrolase fold  31.74 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112445  normal  0.60255 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3897  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0275193  normal  0.323769 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  30.46 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  30.46 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  30.3 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  26.86 
 
 		 263 aa  65.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  30.46 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3656  alpha/beta hydrolase fold protein  28.48 
 
 		 347 aa  64.7  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  29.47 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1692  3-oxoadipate enol-lactonase  27.37 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  28.37 
 
 		 392 aa  63.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  27.92 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  28.38 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  28.12 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  26.9 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 265 aa  62  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  29.31 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  27.57 
 
 		 268 aa  62.4  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  29.31 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  28.2 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  29.33 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  38.38 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  27.7 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  31.6 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  28.16 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  25.52 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  24.91 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  25 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3171  proline iminopeptidase  30.33 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  28.97 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3826  3-oxoadipate enol-lactonase  30.28 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  26.22 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  22.3 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  26 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>