More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0541 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0541  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
344 aa  671    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.271487 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0254  alpha/beta hydrolase fold protein  63.09 
 
 
348 aa  365  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328235  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  44.92 
 
 
350 aa  260  3e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.38332 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1142  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  44.07 
 
 
390 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.152589  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4266  alpha/beta hydrolase fold protein  42.25 
 
 
364 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0901  alpha/beta hydrolase fold  41.25 
 
 
360 aa  208  9e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1497  alpha/beta hydrolase fold protein  43.83 
 
 
325 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0625  alpha/beta hydrolase fold  40.97 
 
 
423 aa  205  8e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.537293  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0991  alpha/beta hydrolase fold protein  37.39 
 
 
389 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  hitchhiker  0.00638838 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6010  alpha/beta hydrolase fold  42 
 
 
421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773155  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  42.07 
 
 
397 aa  195  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3629  alpha/beta hydrolase fold  42.47 
 
 
306 aa  193  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030304  hitchhiker  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0560  alpha/beta hydrolase fold protein  38.49 
 
 
390 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  43.2 
 
 
304 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6555  alpha/beta hydrolase fold protein  39.94 
 
 
366 aa  182  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381661  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3387  alpha/beta hydrolase fold  40.07 
 
 
306 aa  182  7e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1712  alpha/beta hydrolase fold protein  38.72 
 
 
373 aa  176  5e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0728  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000117195  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1174  alpha/beta hydrolase fold  36.96 
 
 
369 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326598  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1147  alpha/beta hydrolase fold  36.96 
 
 
369 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255082  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1164  alpha/beta hydrolase fold  36.96 
 
 
369 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.428268 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04600  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  38.26 
 
 
330 aa  169  9e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.374511 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4933  alpha/beta hydrolase fold  37.79 
 
 
362 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1485  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
362 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.409347  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4246  alpha/beta hydrolase fold  39.27 
 
 
364 aa  161  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146629  hitchhiker  0.00549727 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3856  alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 
364 aa  160  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.775297  normal  0.514851 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06710  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  40.28 
 
 
296 aa  157  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1191  alpha/beta hydrolase fold protein  34.17 
 
 
400 aa  156  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0777  alpha/beta hydrolase fold protein  38.14 
 
 
347 aa  154  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4827  alpha/beta hydrolase fold protein  38.78 
 
 
352 aa  152  8e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.692638  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0879  alpha/beta hydrolase fold protein  34.92 
 
 
349 aa  132  6.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1699  putative hydrolase  37.77 
 
 
312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07460  lysophospholipase  38.28 
 
 
300 aa  126  5e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3656  alpha/beta hydrolase fold protein  35.45 
 
 
347 aa  124  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6786  alpha/beta hydrolase fold  40.53 
 
 
297 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0457  alpha/beta hydrolase fold protein  34.55 
 
 
299 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5476  alpha/beta hydrolase fold  32.99 
 
 
333 aa  113  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294136  normal  0.797092 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4502  alpha/beta hydrolase fold  34.97 
 
 
353 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.297988  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1525  alpha/beta hydrolase fold  35.31 
 
 
318 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0190867  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1555  alpha/beta hydrolase fold  34.98 
 
 
318 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1579  alpha/beta hydrolase fold  34.98 
 
 
318 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1865  alpha/beta hydrolase fold  33.65 
 
 
325 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0853648  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13192  non-heme haloperoxidase hpx  31.99 
 
 
299 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.305997 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 
317 aa  84.7  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  30.47 
 
 
263 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  30.61 
 
 
274 aa  80.1  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  31.14 
 
 
273 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  28.22 
 
 
258 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  31.42 
 
 
271 aa  79.3  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  26.75 
 
 
286 aa  79.7  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  30.32 
 
 
254 aa  78.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  30.39 
 
 
273 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 
265 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 
297 aa  76.6  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 
352 aa  76.3  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  29.41 
 
 
260 aa  75.5  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2061  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 
368 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112445  normal  0.60255 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  30.53 
 
 
256 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 
350 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  28.15 
 
 
277 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  28.26 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  30.07 
 
 
320 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  26.3 
 
 
267 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  29.82 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  29.82 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  29.82 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  25.2 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 
277 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 
277 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  31.37 
 
 
297 aa  73.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  28.73 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 
273 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5079  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 
277 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3170  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 
277 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5198  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 
277 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.581838  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  31.53 
 
 
334 aa  72.8  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  28.17 
 
 
266 aa  72  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  28.25 
 
 
292 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  28.72 
 
 
272 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  27.8 
 
 
322 aa  72  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 
273 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7407  Alpha/beta hydrolase  29.5 
 
 
274 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4622  alpha/beta hydrolase fold  27.67 
 
 
299 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.772942 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  29.24 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3026  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  28.47 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  27.65 
 
 
302 aa  70.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 
271 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5072  alpha/beta hydrolase fold protein  29.18 
 
 
281 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.157677 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  30.86 
 
 
425 aa  70.5  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6690  alpha/beta hydrolase fold  29.05 
 
 
328 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  29.23 
 
 
265 aa  70.5  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 
277 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 
272 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  27.89 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  26.16 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  28.15 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>