More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3656 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3656  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 347 aa  696    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0777  alpha/beta hydrolase fold protein  38.51 
 
 		 347 aa  193  4e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4827  alpha/beta hydrolase fold protein  38.91 
 
 		 352 aa  179  8e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.692638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1699  putative hydrolase  38.78 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0457  alpha/beta hydrolase fold protein  37.88 
 
 		 299 aa  139  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0541  alpha/beta hydrolase fold protein  35.45 
 
 		 344 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.271487 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0254  alpha/beta hydrolase fold protein  35.34 
 
 		 348 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3629  alpha/beta hydrolase fold  35.02 
 
 		 306 aa  113  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030304  hitchhiker  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4502  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 353 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.297988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1555  alpha/beta hydrolase fold  30.67 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1525  alpha/beta hydrolase fold  30.67 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0190867  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1579  alpha/beta hydrolase fold  30.67 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  32.38 
 
 		 397 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0879  alpha/beta hydrolase fold protein  32.47 
 
 		 349 aa  108  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1147  alpha/beta hydrolase fold  30.52 
 
 		 369 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255082  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1174  alpha/beta hydrolase fold  30.52 
 
 		 369 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326598  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1164  alpha/beta hydrolase fold  30.52 
 
 		 369 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.428268 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4933  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 		 362 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1865  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 		 325 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0853648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1712  alpha/beta hydrolase fold protein  31.38 
 
 		 373 aa  103  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3856  alpha/beta hydrolase fold  30.97 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.775297  normal  0.514851 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1485  alpha/beta hydrolase fold  31.31 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.409347  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3387  alpha/beta hydrolase fold  33.77 
 
 		 306 aa  98.6  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1142  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  28.93 
 
 		 390 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.152589  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13192  non-heme haloperoxidase hpx  32.3 
 
 		 299 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.305997 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0625  alpha/beta hydrolase fold  31.65 
 
 		 423 aa  96.7  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.537293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1191  alpha/beta hydrolase fold protein  29.65 
 
 		 400 aa  96.7  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0991  alpha/beta hydrolase fold protein  29.37 
 
 		 389 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  hitchhiker  0.00638838 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4246  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 364 aa  91.7  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146629  hitchhiker  0.00549727 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0560  alpha/beta hydrolase fold protein  29.48 
 
 		 390 aa  90.9  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04600  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.59 
 
 		 330 aa  89.7  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.374511 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7479  Alpha/beta hydrolase  28.52 
 
 		 276 aa  89.7  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28 
 
 		 273 aa  89.4  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0728  alpha/beta hydrolase fold  32.34 
 
 		 336 aa  89  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000117195  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  29.59 
 
 		 350 aa  89  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.38332 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06710  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.33 
 
 		 296 aa  88.2  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1497  alpha/beta hydrolase fold protein  30.7 
 
 		 325 aa  87  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29020  chloroperoxidase precursor  27.49 
 
 		 276 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.995557  hitchhiker  0.000198264 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1700  alpha/beta hydrolase fold  26.78 
 
 		 276 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5718  alpha/beta hydrolase fold protein  29.49 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6010  alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 		 421 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773155  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5684  alpha/beta hydrolase fold  27.49 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6048  alpha/beta hydrolase fold  27.49 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.850826 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1286  chloride peroxidase  29.17 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3997  alpha/beta hydrolase fold  34.81 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1303  chloride peroxidase  29.17 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199298  normal  0.019602 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1113  Chloride peroxidase  27.36 
 
 		 324 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0194  Alpha/beta hydrolase  27.24 
 
 		 280 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2172  Alpha/beta hydrolase fold  25.69 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3995  chloroperoxidase precursor  26.46 
 
 		 276 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0901  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5410  alpha/beta hydrolase fold protein  27.76 
 
 		 322 aa  81.6  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1046  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  36.89 
 
 		 340 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1315  alpha/beta hydrolase fold  28.38 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.991982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2396  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 		 338 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1276  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  29.07 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 		 273 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4420  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 		 274 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  27.95 
 
 		 273 aa  79  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4021  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.425727  normal  0.727928 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0879  alpha/beta fold family hydrolase  35.09 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.889021  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0185  Alpha/beta hydrolase  26.64 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  28.52 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3626  alpha/beta hydrolase fold  27.49 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4742  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1844  alpha/beta hydrolase fold  27.15 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719774  normal  0.0141832 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 		 324 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  28.92 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1812  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0465722  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  26.01 
 
 		 324 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6555  alpha/beta hydrolase fold protein  30.46 
 
 		 366 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381661  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3745  Alpha/beta hydrolase  26.56 
 
 		 280 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.173154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4266  alpha/beta hydrolase fold protein  29.65 
 
 		 364 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3584  alpha/beta hydrolase fold protein  27.42 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4915  hydrolase, alpha/beta fold family  25.51 
 
 		 269 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7042  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.167796  normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6920  Alpha/beta hydrolase  27.21 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3146  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351869  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4670  alpha/beta fold family hydrolase  25.68 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0299  alpha/beta hydrolase fold  25.08 
 
 		 343 aa  73.6  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  27.27 
 
 		 273 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5030  alpha/beta fold family hydrolase  25.68 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4511  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  25.34 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0764  alpha/beta hydrolase  26.3 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3435  alpha/beta hydrolase fold  39.66 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.898623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  31.75 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  31.75 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  28.73 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1450  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4606  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  25.93 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6378  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4179  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 		 271 aa  72.4  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>