More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0914 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
255 aa  508  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  74.51 
 
 
263 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  64.45 
 
 
263 aa  295  5e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0670  alpha/beta hydrolase fold  52.44 
 
 
254 aa  207  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  47.88 
 
 
248 aa  199  5e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  47.41 
 
 
265 aa  195  7e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  45.28 
 
 
263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  44.88 
 
 
263 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  44.49 
 
 
263 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  42.58 
 
 
264 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  41.96 
 
 
265 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  40.42 
 
 
264 aa  176  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  39.13 
 
 
266 aa  168  8e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  36.19 
 
 
266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  37.94 
 
 
264 aa  163  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  36.33 
 
 
264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  37.74 
 
 
266 aa  161  9e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  37.11 
 
 
265 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  30.43 
 
 
277 aa  158  7e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1087  alpha/beta hydrolase fold protein  43.97 
 
 
245 aa  156  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0523898  normal  0.954451 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  32.81 
 
 
283 aa  154  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1326  alpha/beta hydrolase fold protein  41.09 
 
 
279 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3108  alpha/beta hydrolase fold protein  43.97 
 
 
248 aa  152  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962894  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2426  alpha/beta hydrolase fold protein  40.09 
 
 
267 aa  150  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.423437  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  38.78 
 
 
237 aa  149  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.809032  normal  0.841425 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  35.32 
 
 
280 aa  148  8e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10250  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  43.55 
 
 
289 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1941  alpha/beta hydrolase fold  35.04 
 
 
261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  37.01 
 
 
265 aa  137  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6107  alpha/beta hydrolase fold protein  40.74 
 
 
231 aa  135  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.519556  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  37.77 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  35.69 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 
261 aa  132  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  36.3 
 
 
271 aa  129  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 
262 aa  124  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1735  alpha/beta hydrolase fold protein  39.29 
 
 
261 aa  123  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2276  alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 
264 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.253162  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  34.51 
 
 
263 aa  122  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  33.19 
 
 
263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1152  alpha/beta hydrolase fold protein  33.05 
 
 
239 aa  117  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 
279 aa  115  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1989  alpha/beta hydrolase fold  35.98 
 
 
235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.512291  normal  0.434462 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  33.05 
 
 
262 aa  113  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  29.96 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  32.42 
 
 
279 aa  108  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  36.92 
 
 
254 aa  108  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 
271 aa  107  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  30.71 
 
 
282 aa  106  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 
262 aa  103  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  32.68 
 
 
279 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  31.5 
 
 
279 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  33.88 
 
 
425 aa  102  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  31.92 
 
 
278 aa  101  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0986  prolyl aminopeptidase  29.81 
 
 
285 aa  100  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.298096  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3642  alpha/beta fold family hydrolase  28.46 
 
 
262 aa  100  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  30.49 
 
 
276 aa  100  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 
300 aa  99.8  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3372  alpha/beta hydrolase fold  28.3 
 
 
294 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.771296 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 
277 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 
276 aa  99.4  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 
277 aa  99  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 
258 aa  98.6  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  30.8 
 
 
292 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  29.96 
 
 
263 aa  97.8  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  27.65 
 
 
277 aa  97.8  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  30.6 
 
 
266 aa  97.8  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 
275 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  30.74 
 
 
261 aa  97.1  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2527  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
264 aa  97.1  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104657  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  29.6 
 
 
277 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2613  alpha/beta hydrolase  26.67 
 
 
270 aa  96.3  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.101876  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0314  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 
303 aa  95.9  5e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000332733  normal  0.010488 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  30.49 
 
 
273 aa  95.9  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  29.12 
 
 
270 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  32.26 
 
 
256 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1589  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
297 aa  94.4  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000678244  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1860  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 
277 aa  94  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  34.54 
 
 
258 aa  94  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
270 aa  94  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  27.59 
 
 
275 aa  94.4  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  30.47 
 
 
262 aa  94  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2125  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 
280 aa  93.6  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0271359  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
270 aa  92  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0777  alpha/beta hydrolase fold protein  30.34 
 
 
347 aa  92  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3960  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 
272 aa  91.3  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 
297 aa  91.3  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
270 aa  91.7  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 
278 aa  91.3  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  29.34 
 
 
260 aa  91.3  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  29.34 
 
 
260 aa  91.3  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  31.91 
 
 
373 aa  90.9  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2766  alpha/beta hydrolase fold protein  27.82 
 
 
277 aa  90.9  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3736  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 
305 aa  90.5  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265867  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  27.85 
 
 
263 aa  90.9  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  26.54 
 
 
278 aa  90.1  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3004  3-oxoadipate enol-lactonase  33.73 
 
 
390 aa  90.1  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1799  Alpha/beta hydrolase fold  26.58 
 
 
275 aa  90.1  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  27.52 
 
 
275 aa  89.7  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  31.68 
 
 
260 aa  89.7  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 
226 aa  89.7  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>