More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3424 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3424  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  100 
 
 
110 aa  229  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0549007 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  50.65 
 
 
259 aa  75.9  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  39.25 
 
 
260 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  39.25 
 
 
260 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  43.14 
 
 
256 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  43.14 
 
 
256 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  43.14 
 
 
256 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  48.72 
 
 
260 aa  72.8  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  37.5 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  40 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  48.15 
 
 
361 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  44.44 
 
 
298 aa  70.9  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  41.46 
 
 
271 aa  70.5  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  43.21 
 
 
260 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  43.9 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 
350 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  41.18 
 
 
341 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  41.86 
 
 
309 aa  69.3  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  44.44 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  35.71 
 
 
282 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  43.9 
 
 
263 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  45.45 
 
 
314 aa  67.8  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  40.24 
 
 
261 aa  67.8  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  40.74 
 
 
260 aa  67.8  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  42.68 
 
 
259 aa  67.8  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01088  hypothetical esterase/lipase ybfF  39.24 
 
 
230 aa  67  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000642463  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  44.16 
 
 
333 aa  67  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  44 
 
 
340 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  44 
 
 
340 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  44 
 
 
340 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2890  hydrolase  36.84 
 
 
294 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  42.86 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  39.53 
 
 
272 aa  66.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  44.87 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  48.65 
 
 
301 aa  65.5  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1434  alpha/beta hydrolase  41.46 
 
 
261 aa  65.9  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  39.02 
 
 
282 aa  65.5  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  45.45 
 
 
322 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2323  alpha/beta hydrolase fold protein  42.5 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.262735  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  40.26 
 
 
287 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  40.24 
 
 
261 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2963  alpha/beta fold family hydrolase  36.84 
 
 
294 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0480024  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  42.67 
 
 
340 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3194  hydrolase, alpha/beta fold family  36.84 
 
 
294 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3187  alpha/beta fold family hydrolase  36.84 
 
 
294 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2870  3-oxoadipate enol-lactonase  34 
 
 
266 aa  65.1  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  40.24 
 
 
261 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  36 
 
 
267 aa  64.7  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  39.74 
 
 
256 aa  64.3  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  43.75 
 
 
371 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  43.75 
 
 
371 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  43.59 
 
 
229 aa  64.3  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  39.73 
 
 
373 aa  63.9  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  42.67 
 
 
340 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1182  3-oxoadipate enol-lactonase  41.46 
 
 
265 aa  63.9  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2954  hydrolase  35.79 
 
 
294 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000251178  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  39.02 
 
 
263 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  43.75 
 
 
371 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  40.24 
 
 
263 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  41.56 
 
 
295 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1274  3-oxoadipate enol-lactonase  34.94 
 
 
263 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1088  alpha/beta fold family hydrolase  36.9 
 
 
261 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  40.24 
 
 
261 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3547  3-oxoadipate enol-lactonase  35 
 
 
266 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
259 aa  63.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  35.64 
 
 
265 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  36.67 
 
 
265 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1913  alpha/beta hydrolase fold  41.03 
 
 
257 aa  63.5  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000359899  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3826  3-oxoadipate enol-lactonase  41.46 
 
 
265 aa  63.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02909  3-oxoadipate enol-lactonase  34.31 
 
 
255 aa  63.2  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  41.77 
 
 
312 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  40.24 
 
 
261 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
291 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5097  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  45.57 
 
 
308 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  35.8 
 
 
268 aa  62  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  44.87 
 
 
261 aa  62  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  38.1 
 
 
372 aa  61.6  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0837  putative esterase  36.05 
 
 
258 aa  62  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  38 
 
 
290 aa  62  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  39.02 
 
 
256 aa  62  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  47.06 
 
 
263 aa  61.6  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1842  alpha/beta hydrolase fold  39.08 
 
 
267 aa  62  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.384608 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  42.5 
 
 
371 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  38.16 
 
 
270 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2891  alpha/beta hydrolase fold  39.74 
 
 
288 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.265351 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1773  alpha/beta hydrolase fold  36.96 
 
 
243 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000223645  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  38.96 
 
 
284 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  40.26 
 
 
262 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2904  3-oxoadipate enol-lactonase  40 
 
 
377 aa  61.2  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.475956  normal  0.271333 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 
263 aa  61.2  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  38.96 
 
 
286 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2240  alpha/beta hydrolase fold protein  41.18 
 
 
258 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000309374  hitchhiker  0.000000000781643 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.79 
 
 
370 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00059  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  40.91 
 
 
238 aa  61.2  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0330214  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  42.68 
 
 
273 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  33.68 
 
 
263 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  37.18 
 
 
226 aa  60.8  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  43.06 
 
 
369 aa  60.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  42.68 
 
 
273 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  42.68 
 
 
328 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>