More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1434 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1434  alpha/beta hydrolase  100 
 
 
261 aa  530  1e-150  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1130  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  42.58 
 
 
295 aa  204  8e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1392  Poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  40.15 
 
 
301 aa  169  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.507189  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2136  Poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  41.13 
 
 
280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.264144  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4878  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  39.68 
 
 
305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.636657 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5054  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  39.68 
 
 
283 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0393  Poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  38.46 
 
 
284 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.208502 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5004  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  39.68 
 
 
283 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0460  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  38.87 
 
 
285 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434689  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0529  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  37.76 
 
 
285 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5795  poly(3-hydroxyalkanoic acid) depolymerase  35.89 
 
 
285 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66830  poly(3-hydroxyalkanoic acid) depolymerase  35.89 
 
 
285 aa  155  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5144  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  37.35 
 
 
285 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3966  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  34.87 
 
 
298 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4596  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 
260 aa  149  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  37.55 
 
 
294 aa  145  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1944  alpha/beta hydrolase fold  36.86 
 
 
249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 
271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2786  Alpha/beta hydrolase fold  29.91 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  33.2 
 
 
250 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  32.4 
 
 
277 aa  97.4  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  29.34 
 
 
275 aa  93.2  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  28.44 
 
 
267 aa  90.5  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  31.18 
 
 
340 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 
309 aa  88.6  9e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  31.18 
 
 
340 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  31.18 
 
 
340 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 
340 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
340 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  31.2 
 
 
309 aa  85.9  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 
270 aa  81.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  28.52 
 
 
341 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 
275 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 
271 aa  79  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2477  Alpha/beta hydrolase fold  30.2 
 
 
289 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  32.53 
 
 
274 aa  78.2  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
266 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1274  3-oxoadipate enol-lactonase  27.82 
 
 
263 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  28.81 
 
 
282 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 
275 aa  77.4  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  30.65 
 
 
350 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  28.69 
 
 
285 aa  77  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 
266 aa  77  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  29.13 
 
 
263 aa  77  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5269  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 
287 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  30.24 
 
 
282 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
275 aa  76.6  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  29.77 
 
 
350 aa  76.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  28.93 
 
 
260 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0317  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  27.64 
 
 
263 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  26.72 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2623  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 
269 aa  75.1  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.211158  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3587  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
296 aa  75.1  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848755 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  29.25 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 
284 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  26.53 
 
 
425 aa  73.9  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  27.49 
 
 
265 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  26 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 
361 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1382  alpha/beta hydrolase fold  28.51 
 
 
287 aa  73.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327578  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
264 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  28.28 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 
304 aa  73.2  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4731  alpha/beta hydrolase fold  27.67 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  27.17 
 
 
259 aa  72.8  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5097  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  28.81 
 
 
308 aa  72.8  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  25.73 
 
 
263 aa  72.8  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  30.74 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  26.48 
 
 
262 aa  72  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  26.21 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  33.21 
 
 
316 aa  71.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349645  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  28.68 
 
 
266 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 
333 aa  71.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  26.61 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02909  3-oxoadipate enol-lactonase  27.54 
 
 
255 aa  70.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  25.89 
 
 
296 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1735  alpha/beta hydrolase fold  27.49 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  29.66 
 
 
393 aa  71.2  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  26.21 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 
350 aa  70.5  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 
315 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  28.8 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  24.03 
 
 
345 aa  69.3  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 
290 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  29.72 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0111  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 
287 aa  68.9  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7714  alpha/beta hydrolase fold protein  30.5 
 
 
286 aa  68.9  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
280 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1581  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 
259 aa  68.6  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1441  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 
267 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481122  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  26.39 
 
 
277 aa  68.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  26.83 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1255  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 
334 aa  68.2  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000653812  decreased coverage  0.00236014 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  24.17 
 
 
262 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  26.67 
 
 
397 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  27.97 
 
 
258 aa  68.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5177  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
284 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.299682  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  29.41 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  27.39 
 
 
269 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  26.18 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>