More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1750 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1750  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
290 aa  576  1.0000000000000001e-163  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99004  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2705  alpha/beta hydrolase fold  37.25 
 
 
305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1534  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 
285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0162186  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0479  alpha/beta hydrolase fold  29.87 
 
 
308 aa  102  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  31.96 
 
 
300 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0880  alpha/beta hydrolase fold  32.99 
 
 
296 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0252  alpha/beta hydrolase fold  32.25 
 
 
305 aa  92.8  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4252  alpha/beta hydrolase fold  29.78 
 
 
300 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.733578  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3552  alpha/beta hydrolase fold protein  31.22 
 
 
315 aa  89.4  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336946  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2020  hypothetical protein  31 
 
 
281 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0898087 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2147  hypothetical protein  31 
 
 
281 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0977369  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5416  hypothetical protein  30.63 
 
 
281 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539112  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5967  hypothetical protein  30.63 
 
 
281 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.895466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2110  hypothetical protein  30.63 
 
 
281 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0833306  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2128  hypothetical protein  30.63 
 
 
281 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00833807  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1673  alpha/beta hydrolase fold  27.36 
 
 
296 aa  78.2  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478799  normal  0.0522844 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43550  putative hydrolase  28.73 
 
 
270 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4240  alpha/beta hydrolase fold  24.58 
 
 
296 aa  77  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.033675  hitchhiker  0.000000334465 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1160  hypothetical protein  29.89 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485022 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2933  alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0612634  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2635  hypothetical protein  28.62 
 
 
275 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348998  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2714  hydrolase  28.62 
 
 
275 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  28.95 
 
 
271 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.722843  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4165  hypothetical protein  28.27 
 
 
287 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4105  hypothetical protein  25.94 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.710482  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1692  hypothetical protein  28.57 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.959069  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2196  hypothetical protein  28.57 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.446951  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3122  hypothetical protein  28.57 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.798487  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2580  hypothetical protein  28.57 
 
 
275 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1154  alpha/beta hydrolase fold  28.95 
 
 
271 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269729  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1469  hypothetical protein  28.57 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.816074  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  29.36 
 
 
279 aa  74.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1702  hypothetical protein  27.53 
 
 
287 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0351534  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2045  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2563  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19966  normal  0.119166 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  27.9 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.252363  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1051  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 
273 aa  72.8  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380491  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1064  alpha/beta hydrolase fold protein  27.01 
 
 
273 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.456045  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3737  alpha/beta fold family hydrolase  27.24 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1891  hypothetical protein  28.21 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0592  alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0430  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1570  putative hydrolase  26.87 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4532  alpha/beta hydrolase fold  26.18 
 
 
292 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3652  putative hydrolase  29.15 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.681326  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0968  putative hydrolase protein  26.01 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3490  alpha/beta fold family hydrolase  28 
 
 
262 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2047  alpha/beta hydrolase fold  23.97 
 
 
261 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.939702  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6315  hypothetical protein  24.06 
 
 
292 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1442  alpha/beta hydrolase fold protein  27.82 
 
 
264 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1389  alpha/beta hydrolase fold protein  35.66 
 
 
287 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.48672  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1830  alpha/beta hydrolase  25.67 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2460  alpha/beta hydrolase fold  30.09 
 
 
267 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1087  alpha/beta fold hydrolase  26.69 
 
 
268 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3339  hypothetical protein  25.28 
 
 
289 aa  66.2  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1125  putative hydrolase protein  25.63 
 
 
273 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  28.31 
 
 
387 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  27.64 
 
 
387 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2217  hypothetical protein  27.14 
 
 
269 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105926  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72750  hypothetical protein  23.24 
 
 
292 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118117  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3251  alpha/beta hydrolase fold  36.67 
 
 
292 aa  64.3  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0874027  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2939  Alpha/beta hydrolase  39.25 
 
 
345 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02422  acyltransferase 3  24.44 
 
 
267 aa  64.3  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  36.94 
 
 
381 aa  63.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2106  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 
292 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 
285 aa  63.2  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  26.84 
 
 
387 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  25.34 
 
 
312 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4523  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  41.24 
 
 
271 aa  63.2  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104364  normal  0.231171 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3993  alpha/beta hydrolase fold protein  28.16 
 
 
280 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4035  alpha/beta hydrolase fold protein  28.16 
 
 
280 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.688921  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0064  alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 
330 aa  62.4  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  32.53 
 
 
285 aa  62.4  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  38 
 
 
275 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1764  alpha/beta fold family hydrolase  32.68 
 
 
429 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2272  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 
286 aa  61.6  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0854176 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0615  alpha/beta hydrolase fold  34.56 
 
 
268 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2026  hypothetical protein  27.07 
 
 
269 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.852935  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3025  alpha/beta hydrolase fold  38.32 
 
 
344 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.4911  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09348  probable hydrolytic enzyme  33.33 
 
 
331 aa  61.6  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4203  Alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 
268 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  38.38 
 
 
268 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1678  alpha/beta hydrolase fold protein  26.42 
 
 
294 aa  60.8  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0849008  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  29.92 
 
 
280 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86220  predicted protein  23.7 
 
 
320 aa  61.2  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3132  alpha/beta hydrolase fold protein  39.25 
 
 
344 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20322  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  38 
 
 
275 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 
294 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  41.35 
 
 
387 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08025  toxin biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01450)  32.2 
 
 
418 aa  59.7  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0687285 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13227  lipase lipV  31.78 
 
 
261 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3436  alpha/beta hydrolase  32.93 
 
 
256 aa  59.7  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1357  hypothetical protein  25.55 
 
 
283 aa  59.7  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0861154 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 
265 aa  59.7  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3048  alpha/beta hydrolase fold  36.28 
 
 
331 aa  59.3  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.685817  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2452  alpha/beta hydrolase fold  24.35 
 
 
290 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0581  alpha/beta fold family hydrolase  31.48 
 
 
342 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.346537  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1872  alpha/beta hydrolase fold  26.01 
 
 
292 aa  59.3  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1580  alpha/beta hydrolase fold  38.32 
 
 
368 aa  59.3  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.541417  normal  0.0105004 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2856  alpha/beta fold family hydrolase  31.48 
 
 
441 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>