131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1087 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1087  alpha/beta fold hydrolase  100 
 
 		 268 aa  548  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1051  alpha/beta hydrolase fold  76.92 
 
 		 273 aa  428  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1064  alpha/beta hydrolase fold protein  68.91 
 
 		 273 aa  374  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.456045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0968  putative hydrolase protein  68.91 
 
 		 273 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1125  putative hydrolase protein  67.8 
 
 		 273 aa  362  3e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1570  putative hydrolase  60 
 
 		 267 aa  346  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2563  alpha/beta hydrolase fold  59.55 
 
 		 267 aa  346  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19966  normal  0.119166 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2714  hydrolase  61.74 
 
 		 275 aa  345  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1891  hypothetical protein  61.74 
 
 		 275 aa  345  4e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2635  hypothetical protein  61.74 
 
 		 275 aa  345  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348998  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2580  hypothetical protein  61.36 
 
 		 275 aa  343  1e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5416  hypothetical protein  60.61 
 
 		 281 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2110  hypothetical protein  60.98 
 
 		 281 aa  342  4e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0833306  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1160  hypothetical protein  60.53 
 
 		 309 aa  342  4e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485022 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1692  hypothetical protein  60.98 
 
 		 275 aa  342  5e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.959069  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2196  hypothetical protein  60.98 
 
 		 275 aa  342  5e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.446951  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3122  hypothetical protein  60.98 
 
 		 275 aa  342  5e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.798487  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1469  hypothetical protein  60.98 
 
 		 275 aa  342  5e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.816074  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2128  hypothetical protein  60.61 
 
 		 281 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00833807  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2147  hypothetical protein  60.61 
 
 		 281 aa  340  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0977369  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2020  hypothetical protein  60.61 
 
 		 281 aa  340  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0898087 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5967  hypothetical protein  60.61 
 
 		 281 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.895466  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1442  alpha/beta hydrolase fold protein  59.62 
 
 		 264 aa  322  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2844  hypothetical protein  52.36 
 
 		 280 aa  254  9e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2045  alpha/beta hydrolase fold  50.6 
 
 		 275 aa  229  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1830  alpha/beta hydrolase  45.45 
 
 		 270 aa  226  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  47.62 
 
 		 271 aa  221  8e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.722843  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1154  alpha/beta hydrolase fold  47.22 
 
 		 271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3339  hypothetical protein  42.86 
 
 		 289 aa  215  5.9999999999999996e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3591  hypothetical protein  44.35 
 
 		 269 aa  215  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1357  hypothetical protein  42.69 
 
 		 283 aa  211  7.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0861154 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2272  alpha/beta hydrolase fold  42.8 
 
 		 286 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0854176 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1692  hypothetical protein  36.88 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1691  hypothetical protein  36.88 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4165  hypothetical protein  41.92 
 
 		 287 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1702  hypothetical protein  41.92 
 
 		 287 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0351534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3490  alpha/beta fold family hydrolase  42.31 
 
 		 262 aa  188  9e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3737  alpha/beta fold family hydrolase  41.15 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43550  putative hydrolase  41.47 
 
 		 270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2460  alpha/beta hydrolase fold  41.6 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3652  putative hydrolase  41.47 
 
 		 270 aa  178  9e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.681326  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2217  hypothetical protein  41.22 
 
 		 269 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105926  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4203  Alpha/beta hydrolase fold  41.38 
 
 		 268 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2933  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 		 279 aa  169  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0612634  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2026  hypothetical protein  40.46 
 
 		 269 aa  169  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.852935  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4105  hypothetical protein  32.82 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.710482  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2047  alpha/beta hydrolase fold  32.83 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.939702  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02422  acyltransferase 3  31.68 
 
 		 267 aa  150  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0793  putative hydrolase  29.41 
 
 		 296 aa  118  9e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1736  hypothetical protein  27.94 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000795767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0787  hydrolase  28.04 
 
 		 296 aa  116  3e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1872  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 292 aa  92.8  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2452  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 		 290 aa  92  9e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2106  alpha/beta hydrolase fold  24.26 
 
 		 292 aa  92  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2542  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 294 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897918 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0479  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 		 308 aa  87  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1678  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 		 294 aa  86.3  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0849008  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4532  alpha/beta hydrolase fold  25.46 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2450  alpha/beta hydrolase fold  23.79 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6315  hypothetical protein  25.83 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2333  alpha/beta hydrolase fold  23.66 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2013  alpha/beta hydrolase fold protein  23.13 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.096927  hitchhiker  0.0025286 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2358  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  35.12 
 
 		 300 aa  78.6  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72750  hypothetical protein  25 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118117  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3404  alpha/beta hydrolase fold  24.72 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.375307 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0430  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 300 aa  75.5  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4240  alpha/beta hydrolase fold  24.16 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.033675  hitchhiker  0.000000334465 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0592  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0252  alpha/beta hydrolase fold  34.12 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1750  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99004  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0880  alpha/beta hydrolase fold  34.76 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0089  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1534  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0162186  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0107  alpha/beta hydrolase fold  24.15 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0430682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1673  alpha/beta hydrolase fold  25.64 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478799  normal  0.0522844 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0998  alpha/beta hydrolase fold  23.22 
 
 		 303 aa  58.5  0.00000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.461316  hitchhiker  0.000000131083 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2705  alpha/beta hydrolase fold  29.31 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86220  predicted protein  23.88 
 
 		 320 aa  55.5  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  26.46 
 
 		 299 aa  53.1  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.252363  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3552  alpha/beta hydrolase fold protein  25.91 
 
 		 315 aa  52.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336946  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03661  toxin biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12320)  25.68 
 
 		 444 aa  52  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.843085 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  38.71 
 
 		 314 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2124  alpha/beta hydrolase fold  32.47 
 
 		 294 aa  49.7  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321379 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30500  predicted protein  21.7 
 
 		 390 aa  49.3  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.363686 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1050  alpha/beta hydrolase fold  26.8 
 
 		 322 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.173196  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16990  PGAP1-like protein  48 
 
 		 243 aa  46.2  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  26.61 
 
 		 264 aa  46.6  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0079  alpha/beta hydrolase superfamily protein  31.25 
 
 		 291 aa  45.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4154  alpha/beta hydrolase  28.57 
 
 		 249 aa  45.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4195  alpha/beta hydrolase fold protein  32.26 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4667  alpha/beta hydrolase fold  24.65 
 
 		 260 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113193  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2024  alpha/beta hydrolase fold  54.55 
 
 		 329 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3102  Alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 		 312 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.6937 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4088  alpha/beta hydrolase fold protein  32.46 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.90454  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1390  alpha/beta hydrolase fold protein  35.96 
 
 		 429 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0531044 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0608  alpha/beta hydrolase fold  38.78 
 
 		 311 aa  43.5  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000717376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>