107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2217 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2217  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  550  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105926  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2026  hypothetical protein  88.48 
 
 		 269 aa  490  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.852935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4203  Alpha/beta hydrolase fold  74.14 
 
 		 268 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43550  putative hydrolase  74.35 
 
 		 270 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3652  putative hydrolase  73.33 
 
 		 270 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.681326  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4165  hypothetical protein  74.52 
 
 		 287 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2460  alpha/beta hydrolase fold  74.14 
 
 		 267 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3737  alpha/beta fold family hydrolase  74.52 
 
 		 262 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1702  hypothetical protein  73.75 
 
 		 287 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0351534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3490  alpha/beta fold family hydrolase  73.36 
 
 		 262 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1692  hypothetical protein  39.04 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1691  hypothetical protein  39.04 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2933  alpha/beta hydrolase fold  38.02 
 
 		 279 aa  188  9e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0612634  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1064  alpha/beta hydrolase fold protein  40.15 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.456045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02422  acyltransferase 3  35.25 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1570  putative hydrolase  39.46 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4105  hypothetical protein  38.13 
 
 		 301 aa  179  4.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.710482  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2047  alpha/beta hydrolase fold  34.78 
 
 		 261 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.939702  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1051  alpha/beta hydrolase fold  40.23 
 
 		 273 aa  179  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2563  alpha/beta hydrolase fold  39.08 
 
 		 267 aa  178  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19966  normal  0.119166 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1087  alpha/beta fold hydrolase  41.22 
 
 		 268 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0968  putative hydrolase protein  39 
 
 		 273 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2714  hydrolase  40.23 
 
 		 275 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1891  hypothetical protein  39.85 
 
 		 275 aa  176  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2635  hypothetical protein  40.23 
 
 		 275 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348998  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2580  hypothetical protein  39.85 
 
 		 275 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1692  hypothetical protein  39.85 
 
 		 275 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.959069  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2196  hypothetical protein  39.85 
 
 		 275 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.446951  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3122  hypothetical protein  39.85 
 
 		 275 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.798487  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1469  hypothetical protein  39.85 
 
 		 275 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.816074  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5967  hypothetical protein  38.31 
 
 		 281 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.895466  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2128  hypothetical protein  38.31 
 
 		 281 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00833807  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1125  putative hydrolase protein  39.16 
 
 		 273 aa  171  9e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2110  hypothetical protein  38.31 
 
 		 281 aa  171  9e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0833306  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5416  hypothetical protein  38.31 
 
 		 281 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2147  hypothetical protein  38.31 
 
 		 281 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0977369  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1160  hypothetical protein  40.16 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485022 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2020  hypothetical protein  38.31 
 
 		 281 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0898087 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1442  alpha/beta hydrolase fold protein  40.3 
 
 		 264 aa  170  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2844  hypothetical protein  39.45 
 
 		 280 aa  159  6e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1830  alpha/beta hydrolase  35.71 
 
 		 270 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2272  alpha/beta hydrolase fold  37.98 
 
 		 286 aa  152  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0854176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  36.14 
 
 		 271 aa  149  6e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.722843  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1154  alpha/beta hydrolase fold  35.74 
 
 		 271 aa  146  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1357  hypothetical protein  35.94 
 
 		 283 aa  145  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0861154 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3339  hypothetical protein  34.38 
 
 		 289 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2045  alpha/beta hydrolase fold  36.95 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3591  hypothetical protein  34.27 
 
 		 269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0787  hydrolase  28.47 
 
 		 296 aa  126  3e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1736  hypothetical protein  32.21 
 
 		 293 aa  127  3e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000795767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0793  putative hydrolase  28.25 
 
 		 296 aa  124  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  32.7 
 
 		 279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2450  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 		 289 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1872  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 		 292 aa  102  8e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2106  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 		 292 aa  102  8e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2333  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 		 289 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2013  alpha/beta hydrolase fold protein  27.48 
 
 		 289 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.096927  hitchhiker  0.0025286 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4532  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0479  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2542  alpha/beta hydrolase fold  24.51 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897918 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3404  alpha/beta hydrolase fold  25.4 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.375307 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2452  alpha/beta hydrolase fold  25.79 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2358  alpha/beta hydrolase fold  25.4 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1673  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478799  normal  0.0522844 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0107  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0430682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1534  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 		 285 aa  67  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0162186  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.252363  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4240  alpha/beta hydrolase fold  22.73 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.033675  hitchhiker  0.000000334465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0252  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1750  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 		 290 aa  65.5  0.0000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99004  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0430  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  27.45 
 
 		 324 aa  62.4  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72750  hypothetical protein  24.62 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6315  hypothetical protein  24.52 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1678  alpha/beta hydrolase fold protein  25.84 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0849008  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0089  alpha/beta hydrolase fold  24.11 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0592  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0998  alpha/beta hydrolase fold  22.93 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.461316  hitchhiker  0.000000131083 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3552  alpha/beta hydrolase fold protein  25.19 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336946  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0880  alpha/beta hydrolase fold  30.73 
 
 		 296 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03661  toxin biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12320)  24.59 
 
 		 444 aa  51.2  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.843085 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30500  predicted protein  21.67 
 
 		 390 aa  51.2  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.363686 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0156  bioH protein  34.38 
 
 		 256 aa  50.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3127  alpha/beta hydrolase fold protein  34.07 
 
 		 265 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  28.8 
 
 		 294 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01343  hypothetical protein  21.07 
 
 		 255 aa  46.2  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  27.36 
 
 		 278 aa  46.2  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0937  alpha/beta hydrolase fold protein  25.11 
 
 		 300 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  28.5 
 
 		 328 aa  45.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67215  predicted protein  24.63 
 
 		 388 aa  45.4  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.546499 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  26.51 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  32.32 
 
 		 281 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2705  alpha/beta hydrolase fold  25.12 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  28.4 
 
 		 397 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  21.71 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  34.21 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08025  toxin biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01450)  23.04 
 
 		 418 aa  43.9  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0687285 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4667  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113193  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0268  hypothetical protein  52.78 
 
 		 327 aa  43.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>