50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0268 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0268  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  679    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2262  hypothetical protein  46.01 
 
 
340 aa  290  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3162  hypothetical protein  44.21 
 
 
339 aa  283  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000090078 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1152  hypothetical protein  42.45 
 
 
345 aa  251  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2743  putative hydrolase/carboxylic esterase  36.19 
 
 
319 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3777  hypothetical protein  33.77 
 
 
302 aa  182  7e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0304894  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1869  hypothetical protein  32.49 
 
 
341 aa  162  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287227  normal  0.777023 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3475  hypothetical protein  33.23 
 
 
354 aa  162  9e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1617  hypothetical protein  31.93 
 
 
375 aa  157  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00526645 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0686  hypothetical protein  32.17 
 
 
362 aa  155  9e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.619129 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0927  hypothetical protein  31.36 
 
 
371 aa  154  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0721717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2756  hypothetical protein  30.47 
 
 
374 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.656062  normal  0.0454772 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0249  hypothetical protein  28.27 
 
 
345 aa  143  5e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.066887 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0594  hypothetical protein  29.61 
 
 
368 aa  136  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0685  hypothetical protein  30 
 
 
387 aa  122  8e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.798594 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2089  hypothetical protein  29.43 
 
 
357 aa  119  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000013907  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2484  hypothetical protein  29.43 
 
 
357 aa  119  7e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000146545  normal  0.0573029 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2196  hypothetical protein  29.43 
 
 
357 aa  119  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2944  hypothetical protein  31.65 
 
 
360 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0973228 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3235  hypothetical protein  28.07 
 
 
353 aa  117  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2442  hypothetical protein  28.94 
 
 
372 aa  116  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4371  hypothetical protein  29.6 
 
 
370 aa  116  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0968843  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3912  hypothetical protein  30.37 
 
 
377 aa  115  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1988  hypothetical protein  29.05 
 
 
396 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32350  exported protein  28.7 
 
 
371 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3386  hypothetical protein  26.06 
 
 
348 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1789  hypothetical protein  28.22 
 
 
390 aa  103  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2470  exported protein  28.9 
 
 
362 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3419  hypothetical protein  33.04 
 
 
255 aa  100  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1298  hypothetical protein  33.46 
 
 
386 aa  101  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2947  hypothetical protein  26.04 
 
 
393 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482462  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1958  hypothetical protein  26.84 
 
 
363 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.610738  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3377  hypothetical protein  26.88 
 
 
384 aa  93.6  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5598  hypothetical protein  31.86 
 
 
386 aa  87  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1500  hypothetical protein  32.5 
 
 
447 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35176  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2264  hypothetical protein  31.03 
 
 
386 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.310458  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07403  conserved hypothetical protein  27.12 
 
 
318 aa  84.3  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3887  hypothetical protein  23.3 
 
 
405 aa  74.7  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.394813 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06621  conserved hypothetical protein  26.27 
 
 
383 aa  72.4  0.000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0277  hypothetical protein  23.17 
 
 
455 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32310  hypothetical protein  33.58 
 
 
182 aa  70.5  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1852  hypothetical protein  22.28 
 
 
387 aa  57.4  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.429604 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1137  hypothetical protein  40.43 
 
 
129 aa  57  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275607  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2521  hypothetical protein  33.91 
 
 
470 aa  55.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1848  alpha/beta hydrolase fold  36.07 
 
 
295 aa  46.2  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674995  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2045  alpha/beta hydrolase fold  60.61 
 
 
275 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2026  hypothetical protein  55.56 
 
 
269 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.852935  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2272  alpha/beta hydrolase fold  52.5 
 
 
286 aa  43.5  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0854176 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2217  hypothetical protein  52.78 
 
 
269 aa  43.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105926  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  39.34 
 
 
431 aa  43.1  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>