46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0686 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0686  hypothetical protein  100 
 
 		 362 aa  742    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.619129 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0927  hypothetical protein  46.2 
 
 		 371 aa  295  7e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0721717 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3419  hypothetical protein  54.18 
 
 		 255 aa  248  9e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1617  hypothetical protein  39.7 
 
 		 375 aa  232  9e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00526645 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2756  hypothetical protein  37.88 
 
 		 374 aa  219  7e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.656062  normal  0.0454772 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0594  hypothetical protein  39.58 
 
 		 368 aa  216  5e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3475  hypothetical protein  37.57 
 
 		 354 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0249  hypothetical protein  34.17 
 
 		 345 aa  187  3e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.066887 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1152  hypothetical protein  37.61 
 
 		 345 aa  179  5.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2262  hypothetical protein  33.69 
 
 		 340 aa  166  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0268  hypothetical protein  32.17 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2743  putative hydrolase/carboxylic esterase  32.83 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2944  hypothetical protein  31.17 
 
 		 360 aa  143  5e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0973228 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4371  hypothetical protein  30.94 
 
 		 370 aa  143  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0968843  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1869  hypothetical protein  31.29 
 
 		 341 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287227  normal  0.777023 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3386  hypothetical protein  35.02 
 
 		 348 aa  139  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3162  hypothetical protein  32.34 
 
 		 339 aa  136  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000090078 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2484  hypothetical protein  30.95 
 
 		 357 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000146545  normal  0.0573029 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2196  hypothetical protein  30.95 
 
 		 357 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2089  hypothetical protein  30.95 
 
 		 357 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000013907  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1789  hypothetical protein  28.99 
 
 		 390 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2442  hypothetical protein  29.89 
 
 		 372 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32350  exported protein  31.7 
 
 		 371 aa  132  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3235  hypothetical protein  32.09 
 
 		 353 aa  132  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2470  exported protein  30.35 
 
 		 362 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3887  hypothetical protein  29.74 
 
 		 405 aa  126  7e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.394813 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3912  hypothetical protein  27.72 
 
 		 377 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1958  hypothetical protein  28.08 
 
 		 363 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.610738  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0685  hypothetical protein  29.23 
 
 		 387 aa  123  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.798594 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5598  hypothetical protein  29.33 
 
 		 386 aa  123  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1988  hypothetical protein  27.45 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2264  hypothetical protein  29.44 
 
 		 386 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.310458  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1298  hypothetical protein  28.47 
 
 		 386 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32310  hypothetical protein  42.33 
 
 		 182 aa  119  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2521  hypothetical protein  40.24 
 
 		 470 aa  117  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2947  hypothetical protein  43.3 
 
 		 393 aa  117  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3377  hypothetical protein  26.94 
 
 		 384 aa  107  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3777  hypothetical protein  29.09 
 
 		 302 aa  106  8e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0304894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1500  hypothetical protein  37.76 
 
 		 447 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0277  hypothetical protein  26.52 
 
 		 455 aa  99.8  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07403  conserved hypothetical protein  27.68 
 
 		 318 aa  95.5  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06621  conserved hypothetical protein  30.67 
 
 		 383 aa  89.4  8e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1848  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674995  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1852  hypothetical protein  26.02 
 
 		 387 aa  79  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.429604 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1137  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25070  hypothetical protein  57.14 
 
 		 37 aa  49.3  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>