45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5598 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2264  hypothetical protein  93.01 
 
 		 386 aa  743    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.310458  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5598  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  793    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2947  hypothetical protein  78.02 
 
 		 393 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1500  hypothetical protein  64.82 
 
 		 447 aa  498  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1298  hypothetical protein  40.99 
 
 		 386 aa  263  3e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06621  conserved hypothetical protein  38.46 
 
 		 383 aa  252  7e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07403  conserved hypothetical protein  41.9 
 
 		 318 aa  243  6e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0277  hypothetical protein  35.59 
 
 		 455 aa  207  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0686  hypothetical protein  29.33 
 
 		 362 aa  123  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.619129 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2442  hypothetical protein  29.19 
 
 		 372 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2756  hypothetical protein  30.08 
 
 		 374 aa  113  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.656062  normal  0.0454772 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0594  hypothetical protein  26.51 
 
 		 368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3419  hypothetical protein  40.4 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3912  hypothetical protein  26.62 
 
 		 377 aa  107  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0927  hypothetical protein  34.78 
 
 		 371 aa  107  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0721717 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3475  hypothetical protein  32.68 
 
 		 354 aa  101  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1958  hypothetical protein  26.55 
 
 		 363 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.610738  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2470  exported protein  27.78 
 
 		 362 aa  99.8  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1988  hypothetical protein  28.2 
 
 		 396 aa  99.4  9e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1152  hypothetical protein  29.32 
 
 		 345 aa  98.2  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0685  hypothetical protein  25.77 
 
 		 387 aa  98.2  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.798594 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0249  hypothetical protein  30.34 
 
 		 345 aa  98.2  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.066887 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2743  putative hydrolase/carboxylic esterase  31.11 
 
 		 319 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2262  hypothetical protein  30.8 
 
 		 340 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2944  hypothetical protein  27.61 
 
 		 360 aa  96.7  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0973228 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3235  hypothetical protein  26.02 
 
 		 353 aa  93.6  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3777  hypothetical protein  32.63 
 
 		 302 aa  90.5  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0304894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3162  hypothetical protein  32.08 
 
 		 339 aa  89  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000090078 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2196  hypothetical protein  25.79 
 
 		 357 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2484  hypothetical protein  25.79 
 
 		 357 aa  88.2  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000146545  normal  0.0573029 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2089  hypothetical protein  25.79 
 
 		 357 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000013907  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1789  hypothetical protein  26.24 
 
 		 390 aa  87.4  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0268  hypothetical protein  31.86 
 
 		 327 aa  87  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4371  hypothetical protein  26.76 
 
 		 370 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0968843  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32350  exported protein  27.15 
 
 		 371 aa  83.6  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3386  hypothetical protein  30.37 
 
 		 348 aa  80.1  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1848  alpha/beta hydrolase fold  23.96 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674995  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32310  hypothetical protein  32.74 
 
 		 182 aa  75.1  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1869  hypothetical protein  30.74 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287227  normal  0.777023 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2521  hypothetical protein  31.74 
 
 		 470 aa  68.2  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1617  hypothetical protein  33.98 
 
 		 375 aa  67  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00526645 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3377  hypothetical protein  24.64 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3887  hypothetical protein  41.18 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.394813 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1137  hypothetical protein  35.71 
 
 		 129 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2950  alpha/beta hydrolase fold  27.16 
 
 		 461 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>