46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2947 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2947  hypothetical protein  100 
 
 
393 aa  793    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482462  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5598  hypothetical protein  75.77 
 
 
386 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2264  hypothetical protein  74.36 
 
 
386 aa  608  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.310458  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1500  hypothetical protein  64.69 
 
 
447 aa  496  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35176  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06621  conserved hypothetical protein  41.21 
 
 
383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1298  hypothetical protein  43.59 
 
 
386 aa  263  4e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07403  conserved hypothetical protein  43.9 
 
 
318 aa  261  1e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0277  hypothetical protein  36.52 
 
 
455 aa  206  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0686  hypothetical protein  43.3 
 
 
362 aa  117  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.619129 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0927  hypothetical protein  30.99 
 
 
371 aa  110  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0721717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2756  hypothetical protein  26.94 
 
 
374 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.656062  normal  0.0454772 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3419  hypothetical protein  38.07 
 
 
255 aa  102  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2743  putative hydrolase/carboxylic esterase  37.77 
 
 
319 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2262  hypothetical protein  28.11 
 
 
340 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0249  hypothetical protein  25.33 
 
 
345 aa  97.1  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.066887 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1988  hypothetical protein  25.58 
 
 
396 aa  95.9  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2442  hypothetical protein  26.33 
 
 
372 aa  94.4  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0594  hypothetical protein  25.07 
 
 
368 aa  93.6  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2470  exported protein  27.2 
 
 
362 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3912  hypothetical protein  30.52 
 
 
377 aa  90.9  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3475  hypothetical protein  32.74 
 
 
354 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0685  hypothetical protein  23.77 
 
 
387 aa  90.1  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.798594 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2944  hypothetical protein  27.25 
 
 
360 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0973228 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1152  hypothetical protein  30.68 
 
 
345 aa  87.8  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2196  hypothetical protein  26 
 
 
357 aa  85.9  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2484  hypothetical protein  26 
 
 
357 aa  85.9  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000146545  normal  0.0573029 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2089  hypothetical protein  26 
 
 
357 aa  85.9  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000013907  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3777  hypothetical protein  33.15 
 
 
302 aa  85.5  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0304894  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1789  hypothetical protein  25.37 
 
 
390 aa  83.6  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1958  hypothetical protein  25.96 
 
 
363 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.610738  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3235  hypothetical protein  31.41 
 
 
353 aa  82  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0268  hypothetical protein  29.74 
 
 
327 aa  82  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1848  alpha/beta hydrolase fold  25.79 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674995  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3162  hypothetical protein  35.2 
 
 
339 aa  79.3  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000090078 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3386  hypothetical protein  25.76 
 
 
348 aa  76.3  0.0000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1869  hypothetical protein  31.17 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287227  normal  0.777023 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32350  exported protein  24.61 
 
 
371 aa  75.1  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4371  hypothetical protein  28.25 
 
 
370 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0968843  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32310  hypothetical protein  40.54 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1617  hypothetical protein  27.95 
 
 
375 aa  71.6  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00526645 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2521  hypothetical protein  37.5 
 
 
470 aa  64.7  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3887  hypothetical protein  40.54 
 
 
405 aa  64.7  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.394813 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1137  hypothetical protein  40 
 
 
129 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275607  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3377  hypothetical protein  26.02 
 
 
384 aa  44.7  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2581  putative hydrolase  32.56 
 
 
333 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2567  putative hydrolase protein  32.71 
 
 
275 aa  43.9  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.230369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>