46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2442 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2442  hypothetical protein  100 
 
 		 372 aa  765    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2470  exported protein  67.78 
 
 		 362 aa  482  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2944  hypothetical protein  65.1 
 
 		 360 aa  480  1e-134  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0973228 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1958  hypothetical protein  61.9 
 
 		 363 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.610738  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32350  exported protein  65.15 
 
 		 371 aa  464  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4371  hypothetical protein  58.97 
 
 		 370 aa  463  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0968843  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2089  hypothetical protein  60.67 
 
 		 357 aa  457  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000013907  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2484  hypothetical protein  60.67 
 
 		 357 aa  457  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000146545  normal  0.0573029 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2196  hypothetical protein  60.67 
 
 		 357 aa  457  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3912  hypothetical protein  57.68 
 
 		 377 aa  451  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3235  hypothetical protein  58.23 
 
 		 353 aa  427  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0685  hypothetical protein  51.63 
 
 		 387 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.798594 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1789  hypothetical protein  47.58 
 
 		 390 aa  350  2e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1988  hypothetical protein  50.72 
 
 		 396 aa  338  8e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3377  hypothetical protein  39.88 
 
 		 384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3475  hypothetical protein  35.05 
 
 		 354 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2756  hypothetical protein  34.01 
 
 		 374 aa  153  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.656062  normal  0.0454772 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2262  hypothetical protein  31.89 
 
 		 340 aa  152  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1852  hypothetical protein  29.48 
 
 		 387 aa  137  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.429604 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1152  hypothetical protein  30.62 
 
 		 345 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0594  hypothetical protein  27.79 
 
 		 368 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0927  hypothetical protein  30.77 
 
 		 371 aa  134  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0721717 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0686  hypothetical protein  29.89 
 
 		 362 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.619129 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1617  hypothetical protein  27.9 
 
 		 375 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00526645 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0249  hypothetical protein  29.94 
 
 		 345 aa  117  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.066887 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1298  hypothetical protein  28.61 
 
 		 386 aa  116  5e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5598  hypothetical protein  29.19 
 
 		 386 aa  116  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0268  hypothetical protein  28.94 
 
 		 327 aa  116  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3162  hypothetical protein  29.11 
 
 		 339 aa  106  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000090078 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2264  hypothetical protein  27.37 
 
 		 386 aa  106  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.310458  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3419  hypothetical protein  30.47 
 
 		 255 aa  98.2  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2743  putative hydrolase/carboxylic esterase  28.32 
 
 		 319 aa  96.3  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1869  hypothetical protein  29.54 
 
 		 341 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287227  normal  0.777023 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2947  hypothetical protein  26.29 
 
 		 393 aa  92  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3777  hypothetical protein  31.02 
 
 		 302 aa  82.8  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0304894  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07403  conserved hypothetical protein  26.02 
 
 		 318 aa  82.4  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3887  hypothetical protein  24.86 
 
 		 405 aa  79.7  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.394813 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3386  hypothetical protein  27.81 
 
 		 348 aa  79.7  0.00000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1500  hypothetical protein  25.14 
 
 		 447 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0277  hypothetical protein  25.08 
 
 		 455 aa  76.3  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3212  hypothetical protein  73.33 
 
 		 110 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32310  hypothetical protein  33.54 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2521  hypothetical protein  34.29 
 
 		 470 aa  62.8  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1137  hypothetical protein  37.39 
 
 		 129 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275607  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06621  conserved hypothetical protein  23.27 
 
 		 383 aa  57  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1848  alpha/beta hydrolase fold  25.6 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674995  normal  0.35019 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>