45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3162 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3162  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  689    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000090078 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0268  hypothetical protein  44.21 
 
 		 327 aa  283  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2262  hypothetical protein  38.65 
 
 		 340 aa  246  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1152  hypothetical protein  38.12 
 
 		 345 aa  227  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2743  putative hydrolase/carboxylic esterase  37.61 
 
 		 319 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3777  hypothetical protein  39.51 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0304894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1869  hypothetical protein  37.06 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287227  normal  0.777023 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0686  hypothetical protein  32.34 
 
 		 362 aa  136  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.619129 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0249  hypothetical protein  30.79 
 
 		 345 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.066887 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0594  hypothetical protein  28.12 
 
 		 368 aa  125  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3475  hypothetical protein  30.03 
 
 		 354 aa  124  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1617  hypothetical protein  28.25 
 
 		 375 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00526645 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2756  hypothetical protein  30.82 
 
 		 374 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.656062  normal  0.0454772 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2089  hypothetical protein  28.21 
 
 		 357 aa  113  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000013907  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2484  hypothetical protein  28.21 
 
 		 357 aa  113  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000146545  normal  0.0573029 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2196  hypothetical protein  28.21 
 
 		 357 aa  113  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0927  hypothetical protein  27.62 
 
 		 371 aa  113  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0721717 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4371  hypothetical protein  26.11 
 
 		 370 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0968843  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2470  exported protein  30.45 
 
 		 362 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2442  hypothetical protein  29.11 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3386  hypothetical protein  29.93 
 
 		 348 aa  105  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2944  hypothetical protein  29.23 
 
 		 360 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0973228 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32350  exported protein  28.25 
 
 		 371 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3235  hypothetical protein  28.08 
 
 		 353 aa  99  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1298  hypothetical protein  29.14 
 
 		 386 aa  98.6  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1789  hypothetical protein  29.13 
 
 		 390 aa  96.7  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3912  hypothetical protein  27.87 
 
 		 377 aa  95.9  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0277  hypothetical protein  29.3 
 
 		 455 aa  95.9  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2264  hypothetical protein  27.58 
 
 		 386 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.310458  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5598  hypothetical protein  27.2 
 
 		 386 aa  94  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0685  hypothetical protein  27.46 
 
 		 387 aa  93.2  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.798594 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3419  hypothetical protein  33.88 
 
 		 255 aa  93.2  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3377  hypothetical protein  25.36 
 
 		 384 aa  90.5  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1500  hypothetical protein  27.38 
 
 		 447 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1958  hypothetical protein  25.21 
 
 		 363 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.610738  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2947  hypothetical protein  28.99 
 
 		 393 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1988  hypothetical protein  26.32 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07403  conserved hypothetical protein  26.3 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32310  hypothetical protein  32.12 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06621  conserved hypothetical protein  26.05 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3887  hypothetical protein  23.42 
 
 		 405 aa  60.1  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.394813 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2521  hypothetical protein  37.68 
 
 		 470 aa  52  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1852  hypothetical protein  23.42 
 
 		 387 aa  52  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.429604 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1137  hypothetical protein  43.75 
 
 		 129 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1848  alpha/beta hydrolase fold  43.75 
 
 		 295 aa  43.5  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674995  normal  0.35019 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>