47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0594 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0594  hypothetical protein  100 
 
 		 368 aa  763    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1617  hypothetical protein  51.88 
 
 		 375 aa  360  2e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00526645 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2756  hypothetical protein  41.14 
 
 		 374 aa  290  3e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.656062  normal  0.0454772 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3475  hypothetical protein  40.4 
 
 		 354 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0927  hypothetical protein  36.8 
 
 		 371 aa  227  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0721717 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0686  hypothetical protein  39.58 
 
 		 362 aa  216  5e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.619129 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3887  hypothetical protein  35.04 
 
 		 405 aa  199  6e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.394813 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0249  hypothetical protein  33.06 
 
 		 345 aa  189  9e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.066887 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1152  hypothetical protein  31.78 
 
 		 345 aa  156  7e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2262  hypothetical protein  32.36 
 
 		 340 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32310  hypothetical protein  45.56 
 
 		 182 aa  145  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3235  hypothetical protein  31.2 
 
 		 353 aa  139  7.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0685  hypothetical protein  28.13 
 
 		 387 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.798594 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4371  hypothetical protein  28.32 
 
 		 370 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0968843  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0268  hypothetical protein  29.61 
 
 		 327 aa  136  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2442  hypothetical protein  27.79 
 
 		 372 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1988  hypothetical protein  28.68 
 
 		 396 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1958  hypothetical protein  27.27 
 
 		 363 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.610738  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2196  hypothetical protein  27.86 
 
 		 357 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2484  hypothetical protein  27.86 
 
 		 357 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000146545  normal  0.0573029 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2089  hypothetical protein  27.86 
 
 		 357 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000013907  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3912  hypothetical protein  29.26 
 
 		 377 aa  133  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1298  hypothetical protein  29.5 
 
 		 386 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1869  hypothetical protein  29.66 
 
 		 341 aa  129  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287227  normal  0.777023 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2944  hypothetical protein  26.17 
 
 		 360 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0973228 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3162  hypothetical protein  28.12 
 
 		 339 aa  127  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000090078 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32350  exported protein  27.98 
 
 		 371 aa  123  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2743  putative hydrolase/carboxylic esterase  27.3 
 
 		 319 aa  122  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3377  hypothetical protein  27.15 
 
 		 384 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2470  exported protein  25.57 
 
 		 362 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1789  hypothetical protein  25.69 
 
 		 390 aa  114  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5598  hypothetical protein  26.51 
 
 		 386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3419  hypothetical protein  31.58 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2264  hypothetical protein  26.58 
 
 		 386 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.310458  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3386  hypothetical protein  29.28 
 
 		 348 aa  103  6e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2521  hypothetical protein  39.44 
 
 		 470 aa  95.1  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2947  hypothetical protein  25.07 
 
 		 393 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1137  hypothetical protein  43.24 
 
 		 129 aa  90.9  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3777  hypothetical protein  24.23 
 
 		 302 aa  88.2  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0304894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0277  hypothetical protein  23.73 
 
 		 455 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06621  conserved hypothetical protein  22.57 
 
 		 383 aa  75.5  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1848  alpha/beta hydrolase fold  25.57 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674995  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1500  hypothetical protein  25.53 
 
 		 447 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1852  hypothetical protein  23.03 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.429604 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07403  conserved hypothetical protein  34.33 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3212  hypothetical protein  39.39 
 
 		 110 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25070  hypothetical protein  52.94 
 
 		 37 aa  43.9  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>