43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3887 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3887  hypothetical protein  100 
 
 		 405 aa  840    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.394813 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1617  hypothetical protein  36.73 
 
 		 375 aa  210  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00526645 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0594  hypothetical protein  35.28 
 
 		 368 aa  202  7e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2756  hypothetical protein  31.87 
 
 		 374 aa  179  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.656062  normal  0.0454772 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3475  hypothetical protein  30.64 
 
 		 354 aa  176  8e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0686  hypothetical protein  29.58 
 
 		 362 aa  137  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.619129 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0927  hypothetical protein  28.38 
 
 		 371 aa  133  6e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0721717 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32310  hypothetical protein  35.68 
 
 		 182 aa  109  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2262  hypothetical protein  26.11 
 
 		 340 aa  103  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1152  hypothetical protein  25.71 
 
 		 345 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2743  putative hydrolase/carboxylic esterase  26.43 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3419  hypothetical protein  31.27 
 
 		 255 aa  99  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0249  hypothetical protein  25.45 
 
 		 345 aa  97.4  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.066887 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2521  hypothetical protein  26.11 
 
 		 470 aa  92.4  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1988  hypothetical protein  26.12 
 
 		 396 aa  85.9  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4371  hypothetical protein  22.73 
 
 		 370 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0968843  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1789  hypothetical protein  25.34 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0268  hypothetical protein  23.14 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3235  hypothetical protein  25.41 
 
 		 353 aa  82  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0685  hypothetical protein  25.44 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.798594 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2442  hypothetical protein  24.86 
 
 		 372 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2944  hypothetical protein  23.61 
 
 		 360 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0973228 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3912  hypothetical protein  23.79 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2470  exported protein  23.13 
 
 		 362 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3377  hypothetical protein  24.57 
 
 		 384 aa  72.4  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1298  hypothetical protein  31.69 
 
 		 386 aa  72  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2196  hypothetical protein  23.63 
 
 		 357 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2484  hypothetical protein  23.63 
 
 		 357 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000146545  normal  0.0573029 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2089  hypothetical protein  23.63 
 
 		 357 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000013907  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1958  hypothetical protein  22.74 
 
 		 363 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.610738  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32350  exported protein  23.23 
 
 		 371 aa  66.6  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2947  hypothetical protein  27.45 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5598  hypothetical protein  33.61 
 
 		 386 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1137  hypothetical protein  31.48 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1500  hypothetical protein  32.52 
 
 		 447 aa  63.2  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2264  hypothetical protein  41.18 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.310458  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3162  hypothetical protein  24.16 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000090078 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3777  hypothetical protein  30.91 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0304894  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07403  conserved hypothetical protein  37.5 
 
 		 318 aa  55.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1869  hypothetical protein  21.72 
 
 		 341 aa  55.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287227  normal  0.777023 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0277  hypothetical protein  35.94 
 
 		 455 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06621  conserved hypothetical protein  27.52 
 
 		 383 aa  51.2  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1848  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 		 295 aa  45.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674995  normal  0.35019 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>