46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_32350 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_32350  exported protein  100 
 
 
371 aa  758    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1958  hypothetical protein  77.01 
 
 
363 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.610738  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2470  exported protein  77.41 
 
 
362 aa  555  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2484  hypothetical protein  70.61 
 
 
357 aa  531  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000146545  normal  0.0573029 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2089  hypothetical protein  70.61 
 
 
357 aa  531  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000013907  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2196  hypothetical protein  70.61 
 
 
357 aa  531  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2944  hypothetical protein  64.99 
 
 
360 aa  490  1e-137  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0973228 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2442  hypothetical protein  61.85 
 
 
372 aa  473  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4371  hypothetical protein  61.31 
 
 
370 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0968843  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3912  hypothetical protein  59.44 
 
 
377 aa  451  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3235  hypothetical protein  63.22 
 
 
353 aa  445  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1789  hypothetical protein  50.71 
 
 
390 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0685  hypothetical protein  48.66 
 
 
387 aa  334  1e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.798594 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1988  hypothetical protein  49.85 
 
 
396 aa  317  2e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3377  hypothetical protein  38.16 
 
 
384 aa  237  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0686  hypothetical protein  31.54 
 
 
362 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.619129 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3475  hypothetical protein  32.35 
 
 
354 aa  133  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2756  hypothetical protein  29.59 
 
 
374 aa  129  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.656062  normal  0.0454772 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1617  hypothetical protein  30.06 
 
 
375 aa  127  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00526645 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0594  hypothetical protein  28.02 
 
 
368 aa  126  6e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1852  hypothetical protein  28.53 
 
 
387 aa  125  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.429604 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2262  hypothetical protein  27.3 
 
 
340 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1152  hypothetical protein  29.1 
 
 
345 aa  124  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0927  hypothetical protein  29.76 
 
 
371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0721717 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0249  hypothetical protein  29.68 
 
 
345 aa  107  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.066887 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0268  hypothetical protein  28.7 
 
 
327 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1298  hypothetical protein  28.71 
 
 
386 aa  100  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2743  putative hydrolase/carboxylic esterase  28.36 
 
 
319 aa  95.5  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3162  hypothetical protein  27.6 
 
 
339 aa  94.4  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000090078 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3419  hypothetical protein  36.63 
 
 
255 aa  85.1  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5598  hypothetical protein  25.8 
 
 
386 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1869  hypothetical protein  26.56 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287227  normal  0.777023 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2264  hypothetical protein  26.18 
 
 
386 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.310458  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3386  hypothetical protein  25.33 
 
 
348 aa  75.9  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2947  hypothetical protein  25.66 
 
 
393 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482462  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0277  hypothetical protein  25.16 
 
 
455 aa  70.9  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3212  hypothetical protein  68.89 
 
 
110 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07403  conserved hypothetical protein  24.84 
 
 
318 aa  69.7  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3887  hypothetical protein  23.32 
 
 
405 aa  64.7  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.394813 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1848  alpha/beta hydrolase fold  23.96 
 
 
295 aa  63.5  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674995  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1500  hypothetical protein  30.52 
 
 
447 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35176  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2521  hypothetical protein  33.14 
 
 
470 aa  62  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32310  hypothetical protein  32.58 
 
 
182 aa  61.6  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3777  hypothetical protein  28.43 
 
 
302 aa  61.6  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0304894  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1137  hypothetical protein  37.84 
 
 
129 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275607  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06621  conserved hypothetical protein  24.14 
 
 
383 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.174731 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>