46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3235 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3235  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  725    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3912  hypothetical protein  70.06 
 
 		 377 aa  530  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32350  exported protein  63.22 
 
 		 371 aa  445  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2484  hypothetical protein  58.5 
 
 		 357 aa  438  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000146545  normal  0.0573029 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2089  hypothetical protein  58.5 
 
 		 357 aa  438  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000013907  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2196  hypothetical protein  58.5 
 
 		 357 aa  438  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1958  hypothetical protein  59.37 
 
 		 363 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.610738  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2442  hypothetical protein  56.13 
 
 		 372 aa  432  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2470  exported protein  59.34 
 
 		 362 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2944  hypothetical protein  53.8 
 
 		 360 aa  412  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0973228 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4371  hypothetical protein  54.29 
 
 		 370 aa  411  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0968843  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1988  hypothetical protein  45.14 
 
 		 396 aa  324  1e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0685  hypothetical protein  46.34 
 
 		 387 aa  322  5e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.798594 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1789  hypothetical protein  45.99 
 
 		 390 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3377  hypothetical protein  38.39 
 
 		 384 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3475  hypothetical protein  32.15 
 
 		 354 aa  150  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2756  hypothetical protein  32.45 
 
 		 374 aa  149  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.656062  normal  0.0454772 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0594  hypothetical protein  30.79 
 
 		 368 aa  144  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1617  hypothetical protein  31.64 
 
 		 375 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00526645 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0686  hypothetical protein  31.5 
 
 		 362 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.619129 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2262  hypothetical protein  27.95 
 
 		 340 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1852  hypothetical protein  31.28 
 
 		 387 aa  130  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.429604 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1298  hypothetical protein  33.24 
 
 		 386 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0927  hypothetical protein  28.02 
 
 		 371 aa  122  9e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0721717 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1152  hypothetical protein  30.54 
 
 		 345 aa  122  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0268  hypothetical protein  27.59 
 
 		 327 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0249  hypothetical protein  30.35 
 
 		 345 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.066887 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2743  putative hydrolase/carboxylic esterase  28.57 
 
 		 319 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5598  hypothetical protein  25.63 
 
 		 386 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2264  hypothetical protein  26.22 
 
 		 386 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.310458  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3162  hypothetical protein  28.08 
 
 		 339 aa  92  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000090078 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3419  hypothetical protein  36.52 
 
 		 255 aa  92  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07403  conserved hypothetical protein  27.88 
 
 		 318 aa  87.4  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2947  hypothetical protein  31.41 
 
 		 393 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3887  hypothetical protein  25.07 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.394813 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1869  hypothetical protein  25.56 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287227  normal  0.777023 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3386  hypothetical protein  27.08 
 
 		 348 aa  75.1  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0277  hypothetical protein  25.83 
 
 		 455 aa  74.3  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1500  hypothetical protein  35.67 
 
 		 447 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32310  hypothetical protein  28.8 
 
 		 182 aa  71.2  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2521  hypothetical protein  34.88 
 
 		 470 aa  71.2  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3777  hypothetical protein  32.97 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0304894  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06621  conserved hypothetical protein  25.45 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1848  alpha/beta hydrolase fold  25.62 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674995  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3212  hypothetical protein  68.89 
 
 		 110 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1137  hypothetical protein  37.78 
 
 		 129 aa  67  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275607  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>