46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1617 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1617  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  772    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00526645 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0594  hypothetical protein  51.22 
 
 		 368 aa  372  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3475  hypothetical protein  45.38 
 
 		 354 aa  301  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2756  hypothetical protein  41.1 
 
 		 374 aa  291  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.656062  normal  0.0454772 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0927  hypothetical protein  40 
 
 		 371 aa  236  7e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0721717 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0686  hypothetical protein  39.11 
 
 		 362 aa  235  9e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.619129 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3887  hypothetical protein  35.9 
 
 		 405 aa  211  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.394813 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0249  hypothetical protein  35.24 
 
 		 345 aa  176  7e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.066887 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2262  hypothetical protein  31.23 
 
 		 340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0268  hypothetical protein  31.93 
 
 		 327 aa  157  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4371  hypothetical protein  31.5 
 
 		 370 aa  149  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0968843  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32310  hypothetical protein  44.83 
 
 		 182 aa  149  9e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1152  hypothetical protein  31.34 
 
 		 345 aa  145  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3235  hypothetical protein  31.64 
 
 		 353 aa  139  6e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3419  hypothetical protein  33.6 
 
 		 255 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1789  hypothetical protein  32.39 
 
 		 390 aa  133  6e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3912  hypothetical protein  30.16 
 
 		 377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2944  hypothetical protein  28.27 
 
 		 360 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0973228 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32350  exported protein  30.17 
 
 		 371 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2442  hypothetical protein  27.39 
 
 		 372 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1958  hypothetical protein  29.12 
 
 		 363 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.610738  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1988  hypothetical protein  29.5 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2743  putative hydrolase/carboxylic esterase  29.59 
 
 		 319 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0685  hypothetical protein  30.03 
 
 		 387 aa  121  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.798594 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1869  hypothetical protein  28.07 
 
 		 341 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287227  normal  0.777023 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3162  hypothetical protein  27.6 
 
 		 339 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000090078 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1298  hypothetical protein  27.47 
 
 		 386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2470  exported protein  29.51 
 
 		 362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3377  hypothetical protein  28.89 
 
 		 384 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2196  hypothetical protein  27.95 
 
 		 357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2484  hypothetical protein  27.95 
 
 		 357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000146545  normal  0.0573029 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2089  hypothetical protein  27.95 
 
 		 357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000013907  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3386  hypothetical protein  28.17 
 
 		 348 aa  104  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1137  hypothetical protein  46.43 
 
 		 129 aa  95.5  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3777  hypothetical protein  27.24 
 
 		 302 aa  94.4  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0304894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2521  hypothetical protein  38.82 
 
 		 470 aa  93.2  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2264  hypothetical protein  35.29 
 
 		 386 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.310458  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07403  conserved hypothetical protein  24.7 
 
 		 318 aa  72.4  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0277  hypothetical protein  26.23 
 
 		 455 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5598  hypothetical protein  33.58 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2947  hypothetical protein  28.95 
 
 		 393 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482462  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06621  conserved hypothetical protein  24.21 
 
 		 383 aa  67  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1848  alpha/beta hydrolase fold  24.09 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674995  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1500  hypothetical protein  27.8 
 
 		 447 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1852  hypothetical protein  21.72 
 
 		 387 aa  50.1  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.429604 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25070  hypothetical protein  54.29 
 
 		 37 aa  49.3  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>