47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2484 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_2196  hypothetical protein  100 
 
 
357 aa  735    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2484  hypothetical protein  100 
 
 
357 aa  735    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000146545  normal  0.0573029 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2089  hypothetical protein  100 
 
 
357 aa  735    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000013907  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32350  exported protein  73.48 
 
 
371 aa  525  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2470  exported protein  73.86 
 
 
362 aa  522  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1958  hypothetical protein  69.71 
 
 
363 aa  518  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.610738  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2944  hypothetical protein  67.07 
 
 
360 aa  478  1e-134  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0973228 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2442  hypothetical protein  60.67 
 
 
372 aa  457  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3235  hypothetical protein  57.93 
 
 
353 aa  432  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4371  hypothetical protein  57.42 
 
 
370 aa  431  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0968843  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3912  hypothetical protein  58.07 
 
 
377 aa  423  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1789  hypothetical protein  51.93 
 
 
390 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0685  hypothetical protein  46.65 
 
 
387 aa  311  1e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.798594 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1988  hypothetical protein  47.32 
 
 
396 aa  308  8e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3377  hypothetical protein  39.78 
 
 
384 aa  242  6e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2756  hypothetical protein  29.17 
 
 
374 aa  139  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.656062  normal  0.0454772 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0686  hypothetical protein  30.95 
 
 
362 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.619129 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0594  hypothetical protein  27.86 
 
 
368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3475  hypothetical protein  29.51 
 
 
354 aa  132  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1852  hypothetical protein  30.23 
 
 
387 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.429604 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2262  hypothetical protein  28.3 
 
 
340 aa  126  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1152  hypothetical protein  30.08 
 
 
345 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0249  hypothetical protein  32.76 
 
 
345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.066887 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0927  hypothetical protein  29.68 
 
 
371 aa  119  6e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0721717 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0268  hypothetical protein  29.43 
 
 
327 aa  119  7.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1617  hypothetical protein  28.57 
 
 
375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00526645 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2743  putative hydrolase/carboxylic esterase  27.06 
 
 
319 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3162  hypothetical protein  27.24 
 
 
339 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000090078 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1298  hypothetical protein  29.19 
 
 
386 aa  107  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3419  hypothetical protein  31.54 
 
 
255 aa  92  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2264  hypothetical protein  24.15 
 
 
386 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.310458  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5598  hypothetical protein  25.79 
 
 
386 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2947  hypothetical protein  26 
 
 
393 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482462  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07403  conserved hypothetical protein  26.67 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3777  hypothetical protein  28.88 
 
 
302 aa  80.9  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0304894  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0277  hypothetical protein  26.6 
 
 
455 aa  76.6  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3386  hypothetical protein  25.82 
 
 
348 aa  72.8  0.000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3887  hypothetical protein  23.63 
 
 
405 aa  70.9  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.394813 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1869  hypothetical protein  24.53 
 
 
341 aa  66.6  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287227  normal  0.777023 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1848  alpha/beta hydrolase fold  21.36 
 
 
295 aa  66.2  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674995  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3212  hypothetical protein  45.45 
 
 
110 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1500  hypothetical protein  31.58 
 
 
447 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35176  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2521  hypothetical protein  38.1 
 
 
470 aa  63.2  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06621  conserved hypothetical protein  23.73 
 
 
383 aa  62.8  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32310  hypothetical protein  32.09 
 
 
182 aa  61.6  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1137  hypothetical protein  35.96 
 
 
129 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275607  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4476  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  26.9 
 
 
376 aa  43.9  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>