44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1869 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1869  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  665    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287227  normal  0.777023 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1152  hypothetical protein  39.44 
 
 		 345 aa  198  9e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2262  hypothetical protein  36.67 
 
 		 340 aa  185  8e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0268  hypothetical protein  33.12 
 
 		 327 aa  173  5e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2743  putative hydrolase/carboxylic esterase  34.58 
 
 		 319 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3162  hypothetical protein  37.76 
 
 		 339 aa  159  9e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000090078 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0686  hypothetical protein  32.72 
 
 		 362 aa  144  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.619129 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2756  hypothetical protein  29.65 
 
 		 374 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.656062  normal  0.0454772 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0594  hypothetical protein  29.36 
 
 		 368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0927  hypothetical protein  28.66 
 
 		 371 aa  130  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0721717 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3777  hypothetical protein  34.4 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0304894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3475  hypothetical protein  30.79 
 
 		 354 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1617  hypothetical protein  28.57 
 
 		 375 aa  117  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00526645 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3386  hypothetical protein  31.49 
 
 		 348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0249  hypothetical protein  27.1 
 
 		 345 aa  98.6  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.066887 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2442  hypothetical protein  29.04 
 
 		 372 aa  94  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1988  hypothetical protein  27.16 
 
 		 396 aa  92  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4371  hypothetical protein  25.75 
 
 		 370 aa  89.4  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0968843  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0277  hypothetical protein  28.01 
 
 		 455 aa  86.7  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0685  hypothetical protein  26.61 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.798594 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3235  hypothetical protein  25.29 
 
 		 353 aa  79  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2947  hypothetical protein  33.01 
 
 		 393 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5598  hypothetical protein  31.56 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3912  hypothetical protein  25.21 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2264  hypothetical protein  31.1 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.310458  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3419  hypothetical protein  29.2 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2944  hypothetical protein  25 
 
 		 360 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0973228 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32310  hypothetical protein  33.94 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1500  hypothetical protein  32.54 
 
 		 447 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2470  exported protein  25.65 
 
 		 362 aa  72.8  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1789  hypothetical protein  24.5 
 
 		 390 aa  72.8  0.000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3377  hypothetical protein  25.14 
 
 		 384 aa  72  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32350  exported protein  26.22 
 
 		 371 aa  71.2  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1298  hypothetical protein  24.66 
 
 		 386 aa  69.7  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2484  hypothetical protein  25.16 
 
 		 357 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000146545  normal  0.0573029 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2196  hypothetical protein  25.16 
 
 		 357 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2089  hypothetical protein  25.16 
 
 		 357 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000013907  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1958  hypothetical protein  25.21 
 
 		 363 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.610738  normal  0.23795 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06621  conserved hypothetical protein  28.37 
 
 		 383 aa  62  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07403  conserved hypothetical protein  28.9 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3887  hypothetical protein  23.32 
 
 		 405 aa  53.9  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.394813 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1137  hypothetical protein  32.14 
 
 		 129 aa  52.8  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2521  hypothetical protein  37.84 
 
 		 470 aa  44.7  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1848  alpha/beta hydrolase fold  35.38 
 
 		 295 aa  44.3  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674995  normal  0.35019 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>