43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3386 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012030  Hlac_3386  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  704    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0686  hypothetical protein  35.02 
 
 		 362 aa  143  5e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.619129 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0927  hypothetical protein  31.43 
 
 		 371 aa  137  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0721717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2756  hypothetical protein  31.06 
 
 		 374 aa  123  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.656062  normal  0.0454772 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2262  hypothetical protein  28.66 
 
 		 340 aa  116  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0249  hypothetical protein  31.11 
 
 		 345 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.066887 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1869  hypothetical protein  31.19 
 
 		 341 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287227  normal  0.777023 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2743  putative hydrolase/carboxylic esterase  32.17 
 
 		 319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3475  hypothetical protein  27.72 
 
 		 354 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0594  hypothetical protein  29.28 
 
 		 368 aa  107  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0268  hypothetical protein  26.5 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1617  hypothetical protein  27.8 
 
 		 375 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00526645 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1152  hypothetical protein  28.28 
 
 		 345 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3777  hypothetical protein  29.56 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0304894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3162  hypothetical protein  29.93 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000090078 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3419  hypothetical protein  33.86 
 
 		 255 aa  88.6  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1298  hypothetical protein  34.82 
 
 		 386 aa  87.8  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32310  hypothetical protein  38.36 
 
 		 182 aa  86.7  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0277  hypothetical protein  27.03 
 
 		 455 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4371  hypothetical protein  27.92 
 
 		 370 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0968843  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3912  hypothetical protein  26.12 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2442  hypothetical protein  28.48 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5598  hypothetical protein  30.37 
 
 		 386 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2947  hypothetical protein  25.34 
 
 		 393 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1500  hypothetical protein  32.87 
 
 		 447 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3235  hypothetical protein  27.68 
 
 		 353 aa  77.4  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1789  hypothetical protein  26.73 
 
 		 390 aa  76.3  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1958  hypothetical protein  26.32 
 
 		 363 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.610738  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2264  hypothetical protein  30.91 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.310458  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2196  hypothetical protein  26.49 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2484  hypothetical protein  26.49 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000146545  normal  0.0573029 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2089  hypothetical protein  26.49 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000013907  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1988  hypothetical protein  25.84 
 
 		 396 aa  72.8  0.000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32350  exported protein  27.24 
 
 		 371 aa  72.8  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2470  exported protein  27.18 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2944  hypothetical protein  25.8 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0973228 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0685  hypothetical protein  28.98 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.798594 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06621  conserved hypothetical protein  24.87 
 
 		 383 aa  65.9  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07403  conserved hypothetical protein  22.98 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3377  hypothetical protein  25 
 
 		 384 aa  58.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1848  alpha/beta hydrolase fold  25.8 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674995  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0564  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 		 281 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25070  hypothetical protein  57.58 
 
 		 37 aa  43.5  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>