44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3777 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3777  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  616  1e-175  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0304894  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2743  putative hydrolase/carboxylic esterase  43 
 
 
319 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2262  hypothetical protein  37.62 
 
 
340 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0268  hypothetical protein  33.77 
 
 
327 aa  182  6e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3162  hypothetical protein  39.51 
 
 
339 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000090078 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1152  hypothetical protein  32.33 
 
 
345 aa  157  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2756  hypothetical protein  29.88 
 
 
374 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.656062  normal  0.0454772 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3475  hypothetical protein  30 
 
 
354 aa  122  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1869  hypothetical protein  34 
 
 
341 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287227  normal  0.777023 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0686  hypothetical protein  29.09 
 
 
362 aa  106  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.619129 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0927  hypothetical protein  29.11 
 
 
371 aa  104  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0721717 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3386  hypothetical protein  29.41 
 
 
348 aa  102  9e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0249  hypothetical protein  30.12 
 
 
345 aa  98.6  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.066887 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1617  hypothetical protein  27.24 
 
 
375 aa  94.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00526645 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2264  hypothetical protein  33.33 
 
 
386 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.310458  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32310  hypothetical protein  34.81 
 
 
182 aa  92.8  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1298  hypothetical protein  32.61 
 
 
386 aa  91.3  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5598  hypothetical protein  32.63 
 
 
386 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3419  hypothetical protein  32.99 
 
 
255 aa  88.2  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0594  hypothetical protein  24.23 
 
 
368 aa  88.2  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1500  hypothetical protein  33.69 
 
 
447 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35176  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2947  hypothetical protein  33.15 
 
 
393 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482462  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0277  hypothetical protein  32.02 
 
 
455 aa  83.6  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2442  hypothetical protein  31.02 
 
 
372 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2089  hypothetical protein  28.88 
 
 
357 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000013907  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2484  hypothetical protein  28.88 
 
 
357 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000146545  normal  0.0573029 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2196  hypothetical protein  28.88 
 
 
357 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1988  hypothetical protein  31.58 
 
 
396 aa  77.8  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2944  hypothetical protein  31.39 
 
 
360 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0973228 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3912  hypothetical protein  29.55 
 
 
377 aa  76.3  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0685  hypothetical protein  33.15 
 
 
387 aa  74.7  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.798594 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2470  exported protein  29.58 
 
 
362 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3235  hypothetical protein  32.97 
 
 
353 aa  70.5  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1958  hypothetical protein  30.77 
 
 
363 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.610738  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4371  hypothetical protein  25.97 
 
 
370 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0968843  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07403  conserved hypothetical protein  28.44 
 
 
318 aa  65.5  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1789  hypothetical protein  28.65 
 
 
390 aa  64.7  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3377  hypothetical protein  30.22 
 
 
384 aa  63.9  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32350  exported protein  28.57 
 
 
371 aa  62  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1137  hypothetical protein  41.25 
 
 
129 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275607  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1848  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 
295 aa  60.5  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674995  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2521  hypothetical protein  37.36 
 
 
470 aa  59.7  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3887  hypothetical protein  35.8 
 
 
405 aa  58.5  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.394813 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06621  conserved hypothetical protein  27.75 
 
 
383 aa  58.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.174731 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>