45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3419 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3419  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  525  1e-148  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0686  hypothetical protein  54.18 
 
 		 362 aa  257  1e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.619129 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0927  hypothetical protein  43.48 
 
 		 371 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0721717 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1617  hypothetical protein  33.6 
 
 		 375 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00526645 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2756  hypothetical protein  34.73 
 
 		 374 aa  131  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.656062  normal  0.0454772 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0249  hypothetical protein  37.22 
 
 		 345 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.066887 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3475  hypothetical protein  36.02 
 
 		 354 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0594  hypothetical protein  31.95 
 
 		 368 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2262  hypothetical protein  33.33 
 
 		 340 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5598  hypothetical protein  40.4 
 
 		 386 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2743  putative hydrolase/carboxylic esterase  35.45 
 
 		 319 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2264  hypothetical protein  39.9 
 
 		 386 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.310458  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0268  hypothetical protein  33.91 
 
 		 327 aa  105  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1298  hypothetical protein  34.54 
 
 		 386 aa  105  7e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1152  hypothetical protein  34.36 
 
 		 345 aa  104  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3887  hypothetical protein  31.27 
 
 		 405 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.394813 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2442  hypothetical protein  30.58 
 
 		 372 aa  103  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2947  hypothetical protein  38.07 
 
 		 393 aa  102  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3912  hypothetical protein  32.49 
 
 		 377 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1500  hypothetical protein  37.31 
 
 		 447 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2196  hypothetical protein  31.54 
 
 		 357 aa  95.9  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2484  hypothetical protein  31.54 
 
 		 357 aa  95.9  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000146545  normal  0.0573029 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2089  hypothetical protein  31.54 
 
 		 357 aa  95.9  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000013907  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3162  hypothetical protein  33.88 
 
 		 339 aa  93.2  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000090078 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3235  hypothetical protein  30.63 
 
 		 353 aa  93.2  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2944  hypothetical protein  31.29 
 
 		 360 aa  93.2  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0973228 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32310  hypothetical protein  39.26 
 
 		 182 aa  90.5  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32350  exported protein  29.86 
 
 		 371 aa  89  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3777  hypothetical protein  32.99 
 
 		 302 aa  87.8  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0304894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3386  hypothetical protein  30.77 
 
 		 348 aa  87  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0277  hypothetical protein  32.82 
 
 		 455 aa  86.3  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06621  conserved hypothetical protein  32.35 
 
 		 383 aa  84  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2470  exported protein  28.52 
 
 		 362 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1958  hypothetical protein  28.42 
 
 		 363 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.610738  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1789  hypothetical protein  32.2 
 
 		 390 aa  82.8  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4371  hypothetical protein  36.47 
 
 		 370 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0968843  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1988  hypothetical protein  32.16 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0685  hypothetical protein  32.39 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.798594 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1869  hypothetical protein  29.41 
 
 		 341 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287227  normal  0.777023 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07403  conserved hypothetical protein  30.88 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2521  hypothetical protein  37.76 
 
 		 470 aa  72.8  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1848  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674995  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1137  hypothetical protein  56.82 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3377  hypothetical protein  24.82 
 
 		 384 aa  57  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1852  hypothetical protein  24.71 
 
 		 387 aa  42.7  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.429604 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>