46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2262 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2262  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  699    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1152  hypothetical protein  48.07 
 
 		 345 aa  324  1e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0268  hypothetical protein  46.01 
 
 		 327 aa  290  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3162  hypothetical protein  38.04 
 
 		 339 aa  245  8e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000090078 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2743  putative hydrolase/carboxylic esterase  36.77 
 
 		 319 aa  206  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3777  hypothetical protein  37.62 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0304894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1869  hypothetical protein  36.36 
 
 		 341 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287227  normal  0.777023 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0927  hypothetical protein  33.43 
 
 		 371 aa  171  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0721717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2756  hypothetical protein  32.6 
 
 		 374 aa  169  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.656062  normal  0.0454772 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3475  hypothetical protein  35.03 
 
 		 354 aa  166  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0686  hypothetical protein  33.69 
 
 		 362 aa  166  5e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.619129 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1617  hypothetical protein  31.23 
 
 		 375 aa  164  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00526645 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2442  hypothetical protein  31.89 
 
 		 372 aa  152  7e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0594  hypothetical protein  32.36 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4371  hypothetical protein  30.7 
 
 		 370 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0968843  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2470  exported protein  29.97 
 
 		 362 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0249  hypothetical protein  31.31 
 
 		 345 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.066887 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2944  hypothetical protein  31.37 
 
 		 360 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0973228 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3377  hypothetical protein  32.11 
 
 		 384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1789  hypothetical protein  30.08 
 
 		 390 aa  130  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3235  hypothetical protein  28.2 
 
 		 353 aa  128  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3912  hypothetical protein  28.04 
 
 		 377 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0685  hypothetical protein  28.9 
 
 		 387 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.798594 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2196  hypothetical protein  28.3 
 
 		 357 aa  126  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2089  hypothetical protein  28.3 
 
 		 357 aa  126  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000013907  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2484  hypothetical protein  28.3 
 
 		 357 aa  126  5e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000146545  normal  0.0573029 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32350  exported protein  28.81 
 
 		 371 aa  122  7e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1988  hypothetical protein  26.22 
 
 		 396 aa  119  9e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1958  hypothetical protein  28.34 
 
 		 363 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.610738  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3386  hypothetical protein  28.12 
 
 		 348 aa  114  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3419  hypothetical protein  33.33 
 
 		 255 aa  112  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1298  hypothetical protein  27.27 
 
 		 386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2947  hypothetical protein  28.27 
 
 		 393 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5598  hypothetical protein  30.8 
 
 		 386 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1500  hypothetical protein  32.92 
 
 		 447 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2264  hypothetical protein  31.52 
 
 		 386 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.310458  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32310  hypothetical protein  34.27 
 
 		 182 aa  93.6  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06621  conserved hypothetical protein  25 
 
 		 383 aa  92  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3887  hypothetical protein  26.39 
 
 		 405 aa  91.3  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.394813 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07403  conserved hypothetical protein  26.25 
 
 		 318 aa  90.9  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0277  hypothetical protein  28.33 
 
 		 455 aa  90.9  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1852  hypothetical protein  23.38 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.429604 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1137  hypothetical protein  34.34 
 
 		 129 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1703  alpha/beta hydrolase fold  33.71 
 
 		 502 aa  51.6  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2521  hypothetical protein  31.48 
 
 		 470 aa  48.5  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1848  alpha/beta hydrolase fold  32.93 
 
 		 295 aa  48.1  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674995  normal  0.35019 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>