46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1789 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1789  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  793    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1958  hypothetical protein  50.14 
 
 		 363 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.610738  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0685  hypothetical protein  51.49 
 
 		 387 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.798594 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2089  hypothetical protein  51.93 
 
 		 357 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000013907  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2484  hypothetical protein  51.93 
 
 		 357 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000146545  normal  0.0573029 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2196  hypothetical protein  51.93 
 
 		 357 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2470  exported protein  52.51 
 
 		 362 aa  351  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2442  hypothetical protein  47.58 
 
 		 372 aa  350  2e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32350  exported protein  51.48 
 
 		 371 aa  350  3e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1988  hypothetical protein  47.94 
 
 		 396 aa  347  3e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2944  hypothetical protein  47.84 
 
 		 360 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0973228 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4371  hypothetical protein  48.99 
 
 		 370 aa  325  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0968843  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3235  hypothetical protein  45.99 
 
 		 353 aa  304  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3912  hypothetical protein  45.7 
 
 		 377 aa  290  3e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3377  hypothetical protein  42.38 
 
 		 384 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1852  hypothetical protein  33.51 
 
 		 387 aa  157  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.429604 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2756  hypothetical protein  32.02 
 
 		 374 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.656062  normal  0.0454772 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3475  hypothetical protein  31.4 
 
 		 354 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0686  hypothetical protein  28.99 
 
 		 362 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.619129 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1617  hypothetical protein  32.39 
 
 		 375 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00526645 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2262  hypothetical protein  30.08 
 
 		 340 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1152  hypothetical protein  30.26 
 
 		 345 aa  123  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0927  hypothetical protein  30.42 
 
 		 371 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0721717 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0594  hypothetical protein  25.69 
 
 		 368 aa  114  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0249  hypothetical protein  29.64 
 
 		 345 aa  113  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.066887 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1298  hypothetical protein  27.91 
 
 		 386 aa  106  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0268  hypothetical protein  28.22 
 
 		 327 aa  103  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2743  putative hydrolase/carboxylic esterase  27.7 
 
 		 319 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3162  hypothetical protein  27.5 
 
 		 339 aa  91.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000090078 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5598  hypothetical protein  26.24 
 
 		 386 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2264  hypothetical protein  26.8 
 
 		 386 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.310458  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3887  hypothetical protein  25.34 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.394813 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07403  conserved hypothetical protein  28.01 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2947  hypothetical protein  25.37 
 
 		 393 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3419  hypothetical protein  32.2 
 
 		 255 aa  82.4  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0277  hypothetical protein  27.42 
 
 		 455 aa  82.8  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3386  hypothetical protein  26.73 
 
 		 348 aa  75.9  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06621  conserved hypothetical protein  25.75 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32310  hypothetical protein  31.36 
 
 		 182 aa  68.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1869  hypothetical protein  24 
 
 		 341 aa  66.2  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287227  normal  0.777023 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3777  hypothetical protein  28.65 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0304894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1500  hypothetical protein  24.28 
 
 		 447 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2521  hypothetical protein  38.78 
 
 		 470 aa  59.7  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1137  hypothetical protein  35.63 
 
 		 129 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3212  hypothetical protein  55.56 
 
 		 110 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1848  alpha/beta hydrolase fold  22.85 
 
 		 295 aa  49.3  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674995  normal  0.35019 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>