52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2743 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2743  putative hydrolase/carboxylic esterase  100 
 
 
319 aa  644    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3777  hypothetical protein  43 
 
 
302 aa  238  8e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0304894  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1152  hypothetical protein  38.68 
 
 
345 aa  227  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2262  hypothetical protein  36.77 
 
 
340 aa  206  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0268  hypothetical protein  36.19 
 
 
327 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3162  hypothetical protein  36.75 
 
 
339 aa  189  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000090078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1869  hypothetical protein  33.96 
 
 
341 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287227  normal  0.777023 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0686  hypothetical protein  32.83 
 
 
362 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.619129 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2756  hypothetical protein  31.49 
 
 
374 aa  146  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.656062  normal  0.0454772 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3475  hypothetical protein  31.71 
 
 
354 aa  135  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0249  hypothetical protein  31.71 
 
 
345 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.066887 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0594  hypothetical protein  27.3 
 
 
368 aa  122  8e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1617  hypothetical protein  29.59 
 
 
375 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00526645 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0927  hypothetical protein  27.98 
 
 
371 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0721717 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1298  hypothetical protein  30.51 
 
 
386 aa  113  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3386  hypothetical protein  32.17 
 
 
348 aa  112  9e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2944  hypothetical protein  31.37 
 
 
360 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0973228 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2089  hypothetical protein  27.06 
 
 
357 aa  108  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000013907  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2484  hypothetical protein  27.06 
 
 
357 aa  108  9.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000146545  normal  0.0573029 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2196  hypothetical protein  27.06 
 
 
357 aa  108  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3419  hypothetical protein  37.63 
 
 
255 aa  106  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2470  exported protein  28.86 
 
 
362 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1789  hypothetical protein  27.7 
 
 
390 aa  103  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2264  hypothetical protein  26.36 
 
 
386 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.310458  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2947  hypothetical protein  37.77 
 
 
393 aa  102  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482462  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3235  hypothetical protein  28.57 
 
 
353 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1988  hypothetical protein  28.86 
 
 
396 aa  99.8  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3887  hypothetical protein  26.05 
 
 
405 aa  99.8  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.394813 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5598  hypothetical protein  31.11 
 
 
386 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2442  hypothetical protein  28.32 
 
 
372 aa  96.3  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3912  hypothetical protein  27.73 
 
 
377 aa  95.9  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32350  exported protein  28.36 
 
 
371 aa  95.9  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4371  hypothetical protein  26.61 
 
 
370 aa  92  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0968843  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1958  hypothetical protein  28.57 
 
 
363 aa  89.7  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.610738  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1500  hypothetical protein  31.89 
 
 
447 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35176  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0685  hypothetical protein  25.74 
 
 
387 aa  84.3  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.798594 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32310  hypothetical protein  31.05 
 
 
182 aa  84.3  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3377  hypothetical protein  26.74 
 
 
384 aa  77  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0277  hypothetical protein  30 
 
 
455 aa  73.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06621  conserved hypothetical protein  23.46 
 
 
383 aa  72  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.174731 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07403  conserved hypothetical protein  25.08 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2521  hypothetical protein  43.66 
 
 
470 aa  63.9  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1137  hypothetical protein  40 
 
 
129 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275607  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13227  lipase lipV  40 
 
 
261 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1848  alpha/beta hydrolase fold  25.43 
 
 
295 aa  49.3  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674995  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4667  alpha/beta hydrolase fold  51.85 
 
 
260 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113193  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  45.1 
 
 
303 aa  46.2  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.283426 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3210  alpha/beta hydrolase fold protein  34.21 
 
 
271 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.45774  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1800  alpha/beta hydrolase fold  35.8 
 
 
260 aa  44.3  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.155348 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8386  hydrolase, alpha  44.23 
 
 
304 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139718  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1972  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  31.68 
 
 
263 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1130  alpha/beta hydrolase fold protein  46.81 
 
 
254 aa  42.7  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.755121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>