51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1152 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1152  hypothetical protein  100 
 
 
345 aa  711    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2262  hypothetical protein  48.07 
 
 
340 aa  324  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0268  hypothetical protein  42.45 
 
 
327 aa  251  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2743  putative hydrolase/carboxylic esterase  38.68 
 
 
319 aa  227  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3162  hypothetical protein  38.12 
 
 
339 aa  226  6e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000090078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1869  hypothetical protein  38.51 
 
 
341 aa  193  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287227  normal  0.777023 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2756  hypothetical protein  36.86 
 
 
374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.656062  normal  0.0454772 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0686  hypothetical protein  37.61 
 
 
362 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.619129 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3475  hypothetical protein  37.77 
 
 
354 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0927  hypothetical protein  32.31 
 
 
371 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0721717 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3777  hypothetical protein  32.33 
 
 
302 aa  157  4e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0304894  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0594  hypothetical protein  31.78 
 
 
368 aa  156  6e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0249  hypothetical protein  29.53 
 
 
345 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.066887 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1617  hypothetical protein  30.54 
 
 
375 aa  144  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00526645 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4371  hypothetical protein  31.44 
 
 
370 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0968843  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2442  hypothetical protein  30.62 
 
 
372 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2470  exported protein  31.64 
 
 
362 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2944  hypothetical protein  30.75 
 
 
360 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0973228 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1988  hypothetical protein  29.25 
 
 
396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3912  hypothetical protein  28.61 
 
 
377 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2484  hypothetical protein  30.08 
 
 
357 aa  125  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000146545  normal  0.0573029 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2196  hypothetical protein  30.08 
 
 
357 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2089  hypothetical protein  30.08 
 
 
357 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000013907  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1789  hypothetical protein  30.26 
 
 
390 aa  123  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0685  hypothetical protein  29.41 
 
 
387 aa  123  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.798594 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3377  hypothetical protein  33.05 
 
 
384 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32350  exported protein  29.21 
 
 
371 aa  119  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3235  hypothetical protein  30.54 
 
 
353 aa  116  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1958  hypothetical protein  29.58 
 
 
363 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.610738  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1298  hypothetical protein  31.79 
 
 
386 aa  107  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3419  hypothetical protein  33.67 
 
 
255 aa  101  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3386  hypothetical protein  27.7 
 
 
348 aa  99.8  7e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5598  hypothetical protein  29.32 
 
 
386 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2264  hypothetical protein  29.71 
 
 
386 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.310458  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1500  hypothetical protein  32.2 
 
 
447 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35176  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0277  hypothetical protein  26.73 
 
 
455 aa  89.7  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2947  hypothetical protein  30.68 
 
 
393 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482462  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32310  hypothetical protein  33.7 
 
 
182 aa  87  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07403  conserved hypothetical protein  25.93 
 
 
318 aa  85.1  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3887  hypothetical protein  24.93 
 
 
405 aa  84.7  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.394813 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06621  conserved hypothetical protein  27.45 
 
 
383 aa  77.8  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2521  hypothetical protein  35.95 
 
 
470 aa  67.8  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1137  hypothetical protein  41.3 
 
 
129 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275607  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1852  hypothetical protein  26.37 
 
 
387 aa  65.5  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.429604 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1848  alpha/beta hydrolase fold  25.24 
 
 
295 aa  65.5  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674995  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2743  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
331 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.529791  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2970  alpha/beta hydrolase fold protein  35.42 
 
 
331 aa  44.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25070  hypothetical protein  60.61 
 
 
37 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3212  hypothetical protein  43.9 
 
 
110 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0204  alpha/beta hydrolase fold  38.81 
 
 
264 aa  43.1  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2865  alpha/beta hydrolase fold  35.42 
 
 
331 aa  42.7  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>