43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3377 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3377  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  787    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1789  hypothetical protein  42.38 
 
 		 390 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0685  hypothetical protein  41.07 
 
 		 387 aa  249  5e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.798594 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2944  hypothetical protein  38.96 
 
 		 360 aa  249  5e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0973228 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2442  hypothetical protein  39.88 
 
 		 372 aa  244  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2196  hypothetical protein  39.78 
 
 		 357 aa  242  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4371  hypothetical protein  38.17 
 
 		 370 aa  243  6e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0968843  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2089  hypothetical protein  39.78 
 
 		 357 aa  242  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000013907  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2484  hypothetical protein  39.78 
 
 		 357 aa  242  6e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000146545  normal  0.0573029 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1958  hypothetical protein  38.28 
 
 		 363 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.610738  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3235  hypothetical protein  38.39 
 
 		 353 aa  236  7e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2470  exported protein  39.07 
 
 		 362 aa  235  9e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32350  exported protein  39.76 
 
 		 371 aa  234  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1988  hypothetical protein  40.23 
 
 		 396 aa  227  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3912  hypothetical protein  36.9 
 
 		 377 aa  223  4e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2262  hypothetical protein  32.11 
 
 		 340 aa  137  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1852  hypothetical protein  30.67 
 
 		 387 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.429604 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1152  hypothetical protein  33.05 
 
 		 345 aa  122  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0594  hypothetical protein  27.15 
 
 		 368 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1617  hypothetical protein  28.89 
 
 		 375 aa  112  9e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00526645 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0686  hypothetical protein  26.94 
 
 		 362 aa  107  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.619129 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2756  hypothetical protein  26.39 
 
 		 374 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.656062  normal  0.0454772 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3475  hypothetical protein  26.18 
 
 		 354 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0249  hypothetical protein  27.9 
 
 		 345 aa  94.4  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.066887 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0268  hypothetical protein  26.88 
 
 		 327 aa  93.6  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0927  hypothetical protein  27.75 
 
 		 371 aa  90.1  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0721717 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3162  hypothetical protein  25.07 
 
 		 339 aa  90.1  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000090078 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1298  hypothetical protein  25.07 
 
 		 386 aa  89.7  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2743  putative hydrolase/carboxylic esterase  26.74 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1869  hypothetical protein  25.14 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287227  normal  0.777023 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3887  hypothetical protein  25.48 
 
 		 405 aa  65.9  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.394813 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3777  hypothetical protein  30.22 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0304894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5598  hypothetical protein  24.64 
 
 		 386 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2264  hypothetical protein  23.91 
 
 		 386 aa  62  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.310458  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0277  hypothetical protein  26.27 
 
 		 455 aa  60.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06621  conserved hypothetical protein  24.5 
 
 		 383 aa  58.9  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3419  hypothetical protein  25.25 
 
 		 255 aa  55.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3386  hypothetical protein  23.5 
 
 		 348 aa  53.1  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1137  hypothetical protein  33.73 
 
 		 129 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2521  hypothetical protein  31.25 
 
 		 470 aa  47.8  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1500  hypothetical protein  28.34 
 
 		 447 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3212  hypothetical protein  46.51 
 
 		 110 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2947  hypothetical protein  26.02 
 
 		 393 aa  44.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482462  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>