48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0277 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0277  hypothetical protein  100 
 
 		 455 aa  947    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2264  hypothetical protein  35.88 
 
 		 386 aa  211  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.310458  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5598  hypothetical protein  35.59 
 
 		 386 aa  207  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2947  hypothetical protein  36.52 
 
 		 393 aa  206  9e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1500  hypothetical protein  35.42 
 
 		 447 aa  200  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1298  hypothetical protein  35.71 
 
 		 386 aa  189  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06621  conserved hypothetical protein  34.88 
 
 		 383 aa  158  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07403  conserved hypothetical protein  33.54 
 
 		 318 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0927  hypothetical protein  27.65 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0721717 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0686  hypothetical protein  26.52 
 
 		 362 aa  99.8  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.619129 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2756  hypothetical protein  26.34 
 
 		 374 aa  96.7  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.656062  normal  0.0454772 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1848  alpha/beta hydrolase fold  28.61 
 
 		 295 aa  94  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674995  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2262  hypothetical protein  28.33 
 
 		 340 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3162  hypothetical protein  29.3 
 
 		 339 aa  90.9  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000090078 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1152  hypothetical protein  26.73 
 
 		 345 aa  89.7  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3475  hypothetical protein  27.27 
 
 		 354 aa  89  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3419  hypothetical protein  32.82 
 
 		 255 aa  86.7  9e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3386  hypothetical protein  26.74 
 
 		 348 aa  84.7  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3912  hypothetical protein  26.17 
 
 		 377 aa  84.3  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3777  hypothetical protein  32.02 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0304894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1789  hypothetical protein  27.42 
 
 		 390 aa  82.8  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1869  hypothetical protein  28.01 
 
 		 341 aa  81.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287227  normal  0.777023 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0594  hypothetical protein  23.73 
 
 		 368 aa  81.6  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0685  hypothetical protein  27.74 
 
 		 387 aa  79.3  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.798594 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2470  exported protein  27.38 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2196  hypothetical protein  26.6 
 
 		 357 aa  76.6  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2484  hypothetical protein  26.6 
 
 		 357 aa  76.6  0.0000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000146545  normal  0.0573029 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2089  hypothetical protein  26.6 
 
 		 357 aa  76.6  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000013907  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2442  hypothetical protein  25.08 
 
 		 372 aa  76.3  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1958  hypothetical protein  26.65 
 
 		 363 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.610738  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3235  hypothetical protein  25.83 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2743  putative hydrolase/carboxylic esterase  30 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2944  hypothetical protein  26.33 
 
 		 360 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0973228 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1617  hypothetical protein  26.23 
 
 		 375 aa  72.4  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00526645 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0268  hypothetical protein  23.17 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32350  exported protein  25.16 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4371  hypothetical protein  24.6 
 
 		 370 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0968843  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0249  hypothetical protein  22.37 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.066887 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1988  hypothetical protein  25.51 
 
 		 396 aa  70.5  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6287  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  37.63 
 
 		 102 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6690  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  36.56 
 
 		 102 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6455  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  36.56 
 
 		 102 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3377  hypothetical protein  26.27 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32310  hypothetical protein  33.7 
 
 		 182 aa  55.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3887  hypothetical protein  35.94 
 
 		 405 aa  54.7  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.394813 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1137  hypothetical protein  42 
 
 		 129 aa  47  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3594  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  31.87 
 
 		 103 aa  46.6  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2521  hypothetical protein  36.92 
 
 		 470 aa  45.8  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>